MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 2111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	436839711
2	NC_020055	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	436839715
3	NC_020055	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	436839716
4	NC_020055	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	436839718
5	NC_020055	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	436839718
6	NC_020055	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	436839718
7	NC_020055	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	436839719
8	NC_020055	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	436839720
9	NC_020055	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	436839720
10	NC_020055	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	436839721
11	NC_020055	TGATA	2	10	9258	9267	40 %	40 %	20 %	0 %	436839722
12	NC_020055	GCAAA	2	10	11836	11845	60 %	0 %	20 %	20 %	436839726
13	NC_020055	AAGTG	2	10	13664	13673	40 %	20 %	40 %	0 %	436839728
14	NC_020055	GAAAG	2	10	13985	13994	60 %	0 %	40 %	0 %	436839729
15	NC_020055	AGGAT	2	10	14058	14067	40 %	20 %	40 %	0 %	436839729
16	NC_020055	TTCTC	2	10	29425	29434	0 %	60 %	0 %	40 %	436839749
17	NC_020055	CATAT	2	10	31013	31022	40 %	40 %	0 %	20 %	436839752
18	NC_020055	GCAGA	2	10	31352	31361	40 %	0 %	40 %	20 %	436839752
19	NC_020055	AGAGG	2	10	36143	36152	40 %	0 %	60 %	0 %	436839756
20	NC_020055	GCTGT	2	10	37825	37834	0 %	40 %	40 %	20 %	436839757
21	NC_020055	CATGT	2	10	38652	38661	20 %	40 %	20 %	20 %	436839758
22	NC_020055	CAGTG	2	10	39315	39324	20 %	20 %	40 %	20 %	436839758
23	NC_020055	TTCTG	2	10	40449	40458	0 %	60 %	20 %	20 %	436839759
24	NC_020055	ATGGA	2	10	41358	41367	40 %	20 %	40 %	0 %	436839760
25	NC_020055	CAATC	2	10	42064	42073	40 %	20 %	0 %	40 %	436839760
26	NC_020055	AAATT	2	10	42402	42411	60 %	40 %	0 %	0 %	436839760
27	NC_020055	TCCTC	2	10	45248	45257	0 %	40 %	0 %	60 %	436839763
28	NC_020055	GTTGC	2	10	46319	46328	0 %	40 %	40 %	20 %	436839764
29	NC_020055	ATTTG	2	10	46405	46414	20 %	60 %	20 %	0 %	436839764
30	NC_020055	TTATC	2	10	49191	49200	20 %	60 %	0 %	20 %	436839766
31	NC_020055	CTGAG	2	10	50628	50637	20 %	20 %	40 %	20 %	436839768
32	NC_020055	ACTGT	2	10	50985	50994	20 %	40 %	20 %	20 %	436839768
33	NC_020055	AAATG	2	10	51940	51949	60 %	20 %	20 %	0 %	436839769
34	NC_020055	CTGCA	2	10	55648	55657	20 %	20 %	20 %	40 %	436839776
35	NC_020055	TGCCT	2	10	56785	56794	0 %	40 %	20 %	40 %	436839777
36	NC_020055	TTTGC	2	10	59405	59414	0 %	60 %	20 %	20 %	436839779
37	NC_020055	CAGCG	2	10	62525	62534	20 %	0 %	40 %	40 %	436839780
38	NC_020055	ATAAG	2	10	67883	67892	60 %	20 %	20 %	0 %	436839784
39	NC_020055	TGAAG	2	10	81629	81638	40 %	20 %	40 %	0 %	436839794
40	NC_020055	CTGTA	2	10	82358	82367	20 %	40 %	20 %	20 %	436839795
41	NC_020055	GGAAA	2	10	86498	86507	60 %	0 %	40 %	0 %	436839797
42	NC_020055	AGGTC	2	10	89324	89333	20 %	20 %	40 %	20 %	436839801
43	NC_020055	ATATT	2	10	89884	89893	40 %	60 %	0 %	0 %	436839802
44	NC_020055	AGAAT	2	10	91297	91306	60 %	20 %	20 %	0 %	436839802
45	NC_020055	GGCTC	2	10	91310	91319	0 %	20 %	40 %	40 %	436839802
46	NC_020055	GCAGG	2	10	92301	92310	20 %	0 %	60 %	20 %	436839804
47	NC_020055	GACCG	2	10	93488	93497	20 %	0 %	40 %	40 %	436839804
48	NC_020055	GTTTT	2	10	94352	94361	0 %	80 %	20 %	0 %	436839805
49	NC_020055	TTTCA	2	10	94549	94558	20 %	60 %	0 %	20 %	436839805
50	NC_020055	ACTGA	2	10	96359	96368	40 %	20 %	20 %	20 %	436839806
51	NC_020055	ACTGG	2	10	97191	97200	20 %	20 %	40 %	20 %	436839807
52	NC_020055	TCGAA	2	10	98727	98736	40 %	20 %	20 %	20 %	436839809
53	NC_020055	AAATT	2	10	106613	106622	60 %	40 %	0 %	0 %	436839818
54	NC_020055	TGCAT	2	10	113124	113133	20 %	40 %	20 %	20 %	436839824
55	NC_020055	TCTGC	2	10	115282	115291	0 %	40 %	20 %	40 %	436839826
56	NC_020055	CGCTG	2	10	120919	120928	0 %	20 %	40 %	40 %	436839837
57	NC_020055	GTTCA	2	10	121218	121227	20 %	40 %	20 %	20 %	436839839
58	NC_020055	CAGTG	2	10	121320	121329	20 %	20 %	40 %	20 %	436839839
59	NC_020055	TTCCT	2	10	121340	121349	0 %	60 %	0 %	40 %	436839839
60	NC_020055	ACATC	2	10	121766	121775	40 %	20 %	0 %	40 %	436839839
61	NC_020055	CTGAT	2	10	125434	125443	20 %	40 %	20 %	20 %	436839843
62	NC_020055	TTTTG	2	10	128759	128768	0 %	80 %	20 %	0 %	436839846
63	NC_020055	AGGTC	2	10	130524	130533	20 %	20 %	40 %	20 %	436839848
64	NC_020055	GGAAA	2	10	131506	131515	60 %	0 %	40 %	0 %	436839848
65	NC_020055	TTCAT	2	10	133017	133026	20 %	60 %	0 %	20 %	436839849
66	NC_020055	GCATC	2	10	133544	133553	20 %	20 %	20 %	40 %	436839850
67	NC_020055	GGGCT	2	10	134645	134654	0 %	20 %	60 %	20 %	436839851
68	NC_020055	CTTTT	2	10	134841	134850	0 %	80 %	0 %	20 %	436839851
69	NC_020055	TTGAG	2	10	134917	134926	20 %	40 %	40 %	0 %	436839851
70	NC_020055	AGAAT	2	10	136656	136665	60 %	20 %	20 %	0 %	436839853
71	NC_020055	GTGAA	2	10	136671	136680	40 %	20 %	40 %	0 %	436839853
72	NC_020055	TTACT	2	10	138165	138174	20 %	60 %	0 %	20 %	436839853
73	NC_020055	CTGGT	2	10	138789	138798	0 %	40 %	40 %	20 %	436839855
74	NC_020055	CCGGC	2	10	139468	139477	0 %	0 %	40 %	60 %	436839856
75	NC_020055	ATTTT	2	10	140184	140193	20 %	80 %	0 %	0 %	436839856
76	NC_020055	TTCGG	2	10	141109	141118	0 %	40 %	40 %	20 %	436839859
77	NC_020055	GCATG	2	10	141242	141251	20 %	20 %	40 %	20 %	436839859
78	NC_020055	TTTCA	2	10	142857	142866	20 %	60 %	0 %	20 %	436839859
79	NC_020055	ATCCC	2	10	144186	144195	20 %	20 %	0 %	60 %	436839860
80	NC_020055	GCGTA	2	10	148291	148300	20 %	20 %	40 %	20 %	436839862
81	NC_020055	TTTCC	2	10	150088	150097	0 %	60 %	0 %	40 %	436839865
82	NC_020055	CAATA	2	10	151840	151849	60 %	20 %	0 %	20 %	436839866
83	NC_020055	GCTTC	2	10	153544	153553	0 %	40 %	20 %	40 %	436839866
84	NC_020055	TTCTT	2	10	154051	154060	0 %	80 %	0 %	20 %	436839868
85	NC_020055	TTCCA	2	10	155499	155508	20 %	40 %	0 %	40 %	436839868
86	NC_020055	TTTTG	2	10	155659	155668	0 %	80 %	20 %	0 %	436839868
87	NC_020055	GCTCG	2	10	156447	156456	0 %	20 %	40 %	40 %	436839869
88	NC_020055	TGATC	2	10	157572	157581	20 %	40 %	20 %	20 %	436839869
89	NC_020055	AAAAG	2	10	157583	157592	80 %	0 %	20 %	0 %	436839869
90	NC_020055	CCAGA	2	10	160011	160020	40 %	0 %	20 %	40 %	436839871
91	NC_020055	GTACT	2	10	160808	160817	20 %	40 %	20 %	20 %	436839871
92	NC_020055	GTTGC	2	10	161073	161082	0 %	40 %	40 %	20 %	436839872
93	NC_020055	CTTGC	2	10	161379	161388	0 %	40 %	20 %	40 %	436839872
94	NC_020055	GCAAG	2	10	162825	162834	40 %	0 %	40 %	20 %	436839873
95	NC_020055	GAAAA	2	10	163638	163647	80 %	0 %	20 %	0 %	436839874
96	NC_020055	GCGGG	2	10	165464	165473	0 %	0 %	80 %	20 %	436839877
97	NC_020055	TCCTG	2	10	168469	168478	0 %	40 %	20 %	40 %	436839879
98	NC_020055	GGCAA	2	10	169137	169146	40 %	0 %	40 %	20 %	436839880
99	NC_020055	TCAGA	2	10	169472	169481	40 %	20 %	20 %	20 %	436839880
100	NC_020055	AAATT	2	10	169801	169810	60 %	40 %	0 %	0 %	436839880
101	NC_020055	AGATA	2	10	173280	173289	60 %	20 %	20 %	0 %	436839884
102	NC_020055	GGCTT	2	10	173483	173492	0 %	40 %	40 %	20 %	436839885
103	NC_020055	AGTGC	2	10	173982	173991	20 %	20 %	40 %	20 %	436839886
104	NC_020055	CAGGC	2	10	175049	175058	20 %	0 %	40 %	40 %	436839886
105	NC_020055	AATTC	2	10	176858	176867	40 %	40 %	0 %	20 %	436839887
106	NC_020055	TTTTC	2	10	178161	178170	0 %	80 %	0 %	20 %	436839888
107	NC_020055	TCAGA	2	10	178571	178580	40 %	20 %	20 %	20 %	436839889
108	NC_020055	CAGGT	2	10	180915	180924	20 %	20 %	40 %	20 %	436839893
109	NC_020055	TTATT	2	10	182488	182497	20 %	80 %	0 %	0 %	436839896
110	NC_020055	TTGTT	2	10	183146	183155	0 %	80 %	20 %	0 %	436839896
111	NC_020055	CAGCG	2	10	184072	184081	20 %	0 %	40 %	40 %	436839899
112	NC_020055	CAGCC	2	10	187260	187269	20 %	0 %	20 %	60 %	436839900
113	NC_020055	TTTGT	2	10	187416	187425	0 %	80 %	20 %	0 %	436839900
114	NC_020055	TAATG	2	10	187481	187490	40 %	40 %	20 %	0 %	436839900
115	NC_020055	GGGAT	2	10	189255	189264	20 %	20 %	60 %	0 %	436839901
116	NC_020055	TCAGA	2	10	191745	191754	40 %	20 %	20 %	20 %	436839902
117	NC_020055	CAGAC	2	10	192123	192132	40 %	0 %	20 %	40 %	436839903
118	NC_020055	AATCT	2	10	193902	193911	40 %	40 %	0 %	20 %	436839906
119	NC_020055	GAAGA	2	10	194872	194881	60 %	0 %	40 %	0 %	436839907
120	NC_020055	TCGCT	2	10	195386	195395	0 %	40 %	20 %	40 %	436839907
121	NC_020055	CTTTG	2	10	196076	196085	0 %	60 %	20 %	20 %	436839907
122	NC_020055	AGTCC	2	10	198282	198291	20 %	20 %	20 %	40 %	436839908
123	NC_020055	TGCTG	2	10	201802	201811	0 %	40 %	40 %	20 %	436839910
124	NC_020055	ATTTT	2	10	202853	202862	20 %	80 %	0 %	0 %	436839910
125	NC_020055	CTTTG	2	10	204600	204609	0 %	60 %	20 %	20 %	436839912
126	NC_020055	CGGAC	2	10	207530	207539	20 %	0 %	40 %	40 %	436839915
127	NC_020055	GGCAG	2	10	209544	209553	20 %	0 %	60 %	20 %	436839916
128	NC_020055	GATCA	2	10	211293	211302	40 %	20 %	20 %	20 %	436839918
129	NC_020055	CAGAT	2	10	211897	211906	40 %	20 %	20 %	20 %	436839918
130	NC_020055	ATTAT	2	10	213195	213204	40 %	60 %	0 %	0 %	436839920
131	NC_020055	ATTTC	2	10	214059	214068	20 %	60 %	0 %	20 %	436839921
132	NC_020055	TAAGA	2	10	216764	216773	60 %	20 %	20 %	0 %	436839923
133	NC_020055	GCGGG	2	10	218080	218089	0 %	0 %	80 %	20 %	436839924
134	NC_020055	GATTT	2	10	220433	220442	20 %	60 %	20 %	0 %	436839926
135	NC_020055	GAACA	2	10	223686	223695	60 %	0 %	20 %	20 %	436839930
136	NC_020055	ACTGA	2	10	224021	224030	40 %	20 %	20 %	20 %	436839931
137	NC_020055	TTTCC	2	10	227157	227166	0 %	60 %	0 %	40 %	436839938
138	NC_020055	CTTTT	2	10	228039	228048	0 %	80 %	0 %	20 %	436839940
139	NC_020055	ACTGC	2	10	229125	229134	20 %	20 %	20 %	40 %	436839941
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141	NC_020055	CGGTT	2	10	234511	234520	0 %	40 %	40 %	20 %	436839953
142	NC_020055	TTCGG	2	10	235618	235627	0 %	40 %	40 %	20 %	436839953
143	NC_020055	ACTTG	2	10	235648	235657	20 %	40 %	20 %	20 %	436839953
144	NC_020055	AATGG	2	10	235929	235938	40 %	20 %	40 %	0 %	436839953
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146	NC_020055	TAATG	2	10	240061	240070	40 %	40 %	20 %	0 %	436839960
147	NC_020055	GTTGG	2	10	240820	240829	0 %	40 %	60 %	0 %	436839960
148	NC_020055	ACTCC	2	10	242927	242936	20 %	20 %	0 %	60 %	436839963
149	NC_020055	ATAAA	2	10	245861	245870	80 %	20 %	0 %	0 %	436839968
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152	NC_020055	TGCCG	2	10	248396	248405	0 %	20 %	40 %	40 %	436839972
153	NC_020055	ATGGA	2	10	252377	252386	40 %	20 %	40 %	0 %	436839975
154	NC_020055	TCCTT	2	10	252812	252821	0 %	60 %	0 %	40 %	436839975
155	NC_020055	GTTAC	2	10	255744	255753	20 %	40 %	20 %	20 %	436839980
156	NC_020055	ATTTT	2	10	259184	259193	20 %	80 %	0 %	0 %	436839984
157	NC_020055	CCAAG	2	10	259785	259794	40 %	0 %	20 %	40 %	436839984
158	NC_020055	TTCTT	2	10	260217	260226	0 %	80 %	0 %	20 %	436839984
159	NC_020055	AAACA	2	10	261314	261323	80 %	0 %	0 %	20 %	436839984
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163	NC_020055	CAAAA	2	10	270364	270373	80 %	0 %	0 %	20 %	436839996
164	NC_020055	CCGGG	2	10	270535	270544	0 %	0 %	60 %	40 %	436839996
165	NC_020055	TGCCG	2	10	271252	271261	0 %	20 %	40 %	40 %	436839996
166	NC_020055	AAATA	2	10	271304	271313	80 %	20 %	0 %	0 %	436839996
167	NC_020055	AAGAT	2	10	272213	272222	60 %	20 %	20 %	0 %	436839998
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175	NC_020055	GATCG	2	10	282694	282703	20 %	20 %	40 %	20 %	436840016
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247	NC_020055	CGCTT	2	10	398300	398309	0 %	40 %	20 %	40 %	436840127
248	NC_020055	GTCCA	2	10	400234	400243	20 %	20 %	20 %	40 %	436840129
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250	NC_020055	GAGAG	2	10	404021	404030	40 %	0 %	60 %	0 %	436840130
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254	NC_020055	AACCC	2	10	409060	409069	40 %	0 %	0 %	60 %	436840135
255	NC_020055	GAGCT	2	10	409808	409817	20 %	20 %	40 %	20 %	436840136
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257	NC_020055	TCATA	2	10	410244	410253	40 %	40 %	0 %	20 %	436840136
258	NC_020055	ACATT	2	10	418461	418470	40 %	40 %	0 %	20 %	436840144
259	NC_020055	AACTG	2	10	425253	425262	40 %	20 %	20 %	20 %	436840152
260	NC_020055	GAAAA	2	10	425371	425380	80 %	0 %	20 %	0 %	436840152
261	NC_020055	TTATC	2	10	427689	427698	20 %	60 %	0 %	20 %	436840153
262	NC_020055	ACAGT	2	10	429566	429575	40 %	20 %	20 %	20 %	436840154
263	NC_020055	AAAGA	2	10	432385	432394	80 %	0 %	20 %	0 %	436840155
264	NC_020055	CATTT	2	10	433969	433978	20 %	60 %	0 %	20 %	436840155
265	NC_020055	AGATG	2	10	435214	435223	40 %	20 %	40 %	0 %	436840156
266	NC_020055	TCTCT	2	10	437791	437800	0 %	60 %	0 %	40 %	436840159
267	NC_020055	ACCAG	2	10	442430	442439	40 %	0 %	20 %	40 %	436840164
268	NC_020055	TGGAC	2	10	442961	442970	20 %	20 %	40 %	20 %	436840165
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270	NC_020055	AGGTG	2	10	443491	443500	20 %	20 %	60 %	0 %	436840165
271	NC_020055	TATTT	2	10	443706	443715	20 %	80 %	0 %	0 %	436840165
272	NC_020055	CTGCT	2	10	449646	449655	0 %	40 %	20 %	40 %	436840172
273	NC_020055	TAAAA	2	10	450144	450153	80 %	20 %	0 %	0 %	436840172
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278	NC_020055	AAAGA	2	10	453310	453319	80 %	0 %	20 %	0 %	436840174
279	NC_020055	GTTCT	2	10	454557	454566	0 %	60 %	20 %	20 %	436840175
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285	NC_020055	CAGTG	2	10	460439	460448	20 %	20 %	40 %	20 %	436840182
286	NC_020055	CGCTG	2	10	461716	461725	0 %	20 %	40 %	40 %	436840183
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297	NC_020055	CCCTG	2	10	472620	472629	0 %	20 %	20 %	60 %	436840189
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382	NC_020055	TTGAC	2	10	641134	641143	20 %	40 %	20 %	20 %	436840349
383	NC_020055	GAAAT	2	10	641268	641277	60 %	20 %	20 %	0 %	436840349
384	NC_020055	TCATA	2	10	644878	644887	40 %	40 %	0 %	20 %	436840354
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389	NC_020055	TGCCA	2	10	651945	651954	20 %	20 %	20 %	40 %	436840361
390	NC_020055	ATTTT	2	10	654628	654637	20 %	80 %	0 %	0 %	436840363
391	NC_020055	AAAAC	2	10	657720	657729	80 %	0 %	0 %	20 %	436840366
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499	NC_020055	CCGTT	2	10	885116	885125	0 %	40 %	20 %	40 %	436840588
500	NC_020055	ATTTT	2	10	886000	886009	20 %	80 %	0 %	0 %	436840588

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