MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 45943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020055	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020055	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020055	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020055	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020055	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020055	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020055	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839710
9	NC_020055	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
10	NC_020055	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
11	NC_020055	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839711
12	NC_020055	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
13	NC_020055	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020055	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
15	NC_020055	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
16	NC_020055	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
17	NC_020055	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020055	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020055	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839713
20	NC_020055	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
21	NC_020055	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
22	NC_020055	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839713
23	NC_020055	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839713
24	NC_020055	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839713
25	NC_020055	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020055	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020055	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020055	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020055	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020055	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020055	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020055	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020055	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020055	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020055	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839715
36	NC_020055	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
37	NC_020055	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
38	NC_020055	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839716
39	NC_020055	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839716
40	NC_020055	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
41	NC_020055	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
42	NC_020055	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
43	NC_020055	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
44	NC_020055	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
45	NC_020055	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
46	NC_020055	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
47	NC_020055	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
48	NC_020055	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
49	NC_020055	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839716
50	NC_020055	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
51	NC_020055	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839716
52	NC_020055	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
53	NC_020055	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
54	NC_020055	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
55	NC_020055	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
56	NC_020055	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
57	NC_020055	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
58	NC_020055	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
59	NC_020055	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
60	NC_020055	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
61	NC_020055	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
62	NC_020055	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
63	NC_020055	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
64	NC_020055	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
65	NC_020055	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839717
66	NC_020055	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839717
67	NC_020055	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
68	NC_020055	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839717
69	NC_020055	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
70	NC_020055	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839717
71	NC_020055	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839717
72	NC_020055	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020055	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
74	NC_020055	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839718
75	NC_020055	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
76	NC_020055	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
77	NC_020055	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839718
78	NC_020055	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
79	NC_020055	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
80	NC_020055	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
81	NC_020055	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839719
82	NC_020055	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839719
83	NC_020055	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839719
84	NC_020055	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839719
85	NC_020055	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839719
86	NC_020055	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839719
87	NC_020055	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839719
88	NC_020055	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
89	NC_020055	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839720
90	NC_020055	AGG	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839720
91	NC_020055	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839720
92	NC_020055	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
93	NC_020055	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839720
94	NC_020055	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839720
95	NC_020055	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020055	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020055	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020055	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020055	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020055	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020055	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020055	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020055	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839721
104	NC_020055	ATT	2	6	9022	9027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839721
105	NC_020055	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020055	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839722
107	NC_020055	AGT	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
108	NC_020055	AAC	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839722
109	NC_020055	ATG	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
110	NC_020055	AGC	2	6	9498	9503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839722
111	NC_020055	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839722
112	NC_020055	AGC	3	9	9560	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839722
113	NC_020055	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839722
114	NC_020055	GTT	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
115	NC_020055	ATG	2	6	9698	9703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
116	NC_020055	TCA	3	9	9792	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839722
117	NC_020055	ATG	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
118	NC_020055	TTG	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
119	NC_020055	TGA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
120	NC_020055	TTG	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
121	NC_020055	AGA	2	6	10049	10054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839722
122	NC_020055	ATT	2	6	10268	10273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839722
123	NC_020055	GTT	2	6	10363	10368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020055	TTG	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839723
125	NC_020055	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839724
126	NC_020055	AGT	2	6	10738	10743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839724
127	NC_020055	TTG	2	6	10812	10817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839724
128	NC_020055	GCT	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839724
129	NC_020055	TGA	3	9	10870	10878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839724
130	NC_020055	GCA	2	6	10954	10959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839725
131	NC_020055	ACT	2	6	11096	11101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839725
132	NC_020055	AGT	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020055	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020055	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020055	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020055	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_020055	AGC	2	6	43004	43009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_020055	AAT	2	6	43237	43242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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