MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 41185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839710
2	NC_020055	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
3	NC_020055	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
4	NC_020055	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839711
5	NC_020055	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
6	NC_020055	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
7	NC_020055	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
8	NC_020055	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
9	NC_020055	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839713
10	NC_020055	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
11	NC_020055	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
12	NC_020055	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839713
13	NC_020055	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839713
14	NC_020055	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839713
15	NC_020055	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839715
16	NC_020055	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
17	NC_020055	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
18	NC_020055	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839716
19	NC_020055	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839716
20	NC_020055	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
21	NC_020055	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
22	NC_020055	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
23	NC_020055	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
24	NC_020055	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
25	NC_020055	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
26	NC_020055	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
27	NC_020055	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
28	NC_020055	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
29	NC_020055	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839716
30	NC_020055	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
31	NC_020055	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839716
32	NC_020055	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
33	NC_020055	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
34	NC_020055	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
35	NC_020055	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
36	NC_020055	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
37	NC_020055	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
38	NC_020055	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
39	NC_020055	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
40	NC_020055	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
41	NC_020055	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
42	NC_020055	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
43	NC_020055	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
44	NC_020055	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
45	NC_020055	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839717
46	NC_020055	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839717
47	NC_020055	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
48	NC_020055	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839717
49	NC_020055	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
50	NC_020055	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839717
51	NC_020055	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839717
52	NC_020055	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
53	NC_020055	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839718
54	NC_020055	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
55	NC_020055	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
56	NC_020055	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839718
57	NC_020055	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
58	NC_020055	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
59	NC_020055	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
60	NC_020055	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839719
61	NC_020055	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839719
62	NC_020055	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839719
63	NC_020055	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839719
64	NC_020055	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839719
65	NC_020055	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839719
66	NC_020055	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839719
67	NC_020055	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
68	NC_020055	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839720
69	NC_020055	AGG	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839720
70	NC_020055	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839720
71	NC_020055	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
72	NC_020055	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839720
73	NC_020055	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839720
74	NC_020055	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839721
75	NC_020055	ATT	2	6	9022	9027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839721
76	NC_020055	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839722
77	NC_020055	AGT	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
78	NC_020055	AAC	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839722
79	NC_020055	ATG	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
80	NC_020055	AGC	2	6	9498	9503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839722
81	NC_020055	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839722
82	NC_020055	AGC	3	9	9560	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839722
83	NC_020055	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839722
84	NC_020055	GTT	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
85	NC_020055	ATG	2	6	9698	9703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
86	NC_020055	TCA	3	9	9792	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839722
87	NC_020055	ATG	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
88	NC_020055	TTG	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
89	NC_020055	TGA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
90	NC_020055	TTG	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
91	NC_020055	AGA	2	6	10049	10054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839722
92	NC_020055	ATT	2	6	10268	10273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839722
93	NC_020055	TTG	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839723
94	NC_020055	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839724
95	NC_020055	AGT	2	6	10738	10743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839724
96	NC_020055	TTG	2	6	10812	10817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839724
97	NC_020055	GCT	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839724
98	NC_020055	TGA	3	9	10870	10878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839724
99	NC_020055	GCA	2	6	10954	10959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839725
100	NC_020055	ACT	2	6	11096	11101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839725
101	NC_020055	ATC	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839726
102	NC_020055	AAG	3	9	11739	11747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839726
103	NC_020055	ACA	2	6	11764	11769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839726
104	NC_020055	GGC	2	6	11812	11817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839726
105	NC_020055	ATA	2	6	12586	12591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839726
106	NC_020055	ACG	2	6	12659	12664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839726
107	NC_020055	GAT	2	6	12842	12847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839726
108	NC_020055	AAG	2	6	13011	13016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839727
109	NC_020055	AAG	2	6	13143	13148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839727
110	NC_020055	ATG	3	9	13201	13209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839727
111	NC_020055	TTC	2	6	13263	13268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839727
112	NC_020055	CTT	2	6	13271	13276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839727
113	NC_020055	CAT	2	6	13293	13298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839727
114	NC_020055	TTG	2	6	13369	13374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839727
115	NC_020055	AAG	2	6	13581	13586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839727
116	NC_020055	GTG	2	6	13714	13719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839728
117	NC_020055	CTG	2	6	13851	13856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839729
118	NC_020055	TGA	2	6	13936	13941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839729
119	NC_020055	CTT	2	6	13952	13957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839729
120	NC_020055	TGC	2	6	14038	14043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839729
121	NC_020055	TTA	2	6	14088	14093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839729
122	NC_020055	CTG	2	6	14118	14123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839729
123	NC_020055	TTG	2	6	14138	14143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839729
124	NC_020055	TGA	2	6	14284	14289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839729
125	NC_020055	ATC	2	6	14328	14333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839729
126	NC_020055	AGC	2	6	14500	14505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839730
127	NC_020055	TTA	2	6	14557	14562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839730
128	NC_020055	TTG	2	6	14581	14586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839730
129	NC_020055	ATT	2	6	14689	14694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839730
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251	NC_020055	CCG	2	6	27046	27051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839745
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253	NC_020055	GAA	3	9	27173	27181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839745
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