MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	CGTTGG	2	12	19645	19656	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020053	CCGGAA	2	12	27471	27482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020053	GGAACG	2	12	27634	27645	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020053	CAATCT	2	12	42141	42152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020053	TGCGAT	2	12	57239	57250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020053	AGATGC	2	12	60567	60578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020053	AGCCTT	2	12	62920	62931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020053	TATCGA	2	12	73414	73425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020053	GAGCAT	2	12	100005	100016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020053	GCTGTT	2	12	133822	133833	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020053	TCGAGA	2	12	137253	137264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020053	TCGCGA	2	12	148789	148800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020053	CGAGCA	2	12	152419	152430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020053	AAGTTT	2	12	162579	162590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020053	TTAAAT	2	12	166390	166401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020053	GATGTA	2	12	167166	167177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020053	CTCTGG	2	12	176631	176642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020053	GTATCC	2	12	178438	178449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020053	CTGCCA	2	12	189109	189120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020053	TATGGA	2	12	192440	192451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020053	AGATTG	2	12	203520	203531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020053	TCCCCT	2	12	214360	214371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020053	GCGATC	2	12	232644	232655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020053	GTAAAT	2	12	233901	233912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020053	TAATGA	2	12	248629	248640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020053	TAATTA	2	12	248667	248678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020053	CGAATA	2	12	310259	310270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020053	CACCTC	2	12	310324	310335	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020053	GATCGA	2	12	311112	311123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020053	GAATTT	2	12	311292	311303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020053	GATCGA	2	12	313237	313248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020053	AAGATT	2	12	321995	322006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020053	ATCGAG	2	12	322373	322384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020053	ATTTCC	2	12	331981	331992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020053	AACTTT	2	12	378685	378696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020053	CAAAAA	2	12	383047	383058	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020053	ATCGAT	2	12	390857	390868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020053	TCAATA	2	12	395908	395919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020053	TGAGAT	2	12	396651	396662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020053	TGCTTT	2	12	446476	446487	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.