MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	GAGAT	2	10	27595	27604	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020053	ATAGT	2	10	49318	49327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020053	TGATT	2	10	52479	52488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020053	CTTTG	2	10	60909	60918	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020053	TGAGA	2	10	61479	61488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020053	CCAAT	2	10	62752	62761	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020053	TGCCG	2	10	63524	63533	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020053	TCATC	2	10	67294	67303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020053	TTGCA	2	10	69084	69093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020053	TTCAT	2	10	81894	81903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020053	GATTT	2	10	113460	113469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020053	TTGAT	2	10	120389	120398	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020053	TAATG	2	10	122063	122072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020053	TGTCT	2	10	122292	122301	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020053	AATAA	2	10	124739	124748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020053	TTTAG	2	10	143242	143251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020053	GAGCG	2	10	144667	144676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020053	ATCAA	2	10	160526	160535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020053	TACTT	2	10	162970	162979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020053	TAGCC	2	10	167953	167962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_020053	TCCGC	2	10	176730	176739	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_020053	TAAAT	2	10	182012	182021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020053	CGATC	2	10	186377	186386	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020053	GCTGC	2	10	188293	188302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020053	GCCGC	2	10	188360	188369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_020053	GCTCA	2	10	205837	205846	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020053	GCTGC	2	10	228750	228759	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020053	CGCGG	2	10	247412	247421	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020053	TGACT	2	10	248321	248330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020053	CCATT	2	10	294847	294856	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020053	ATAAA	2	10	297064	297073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020053	ATCGA	2	10	301419	301428	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020053	TCGTA	2	10	310512	310521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020053	GAAAA	2	10	311609	311618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020053	GGCAA	2	10	311792	311801	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020053	CTCGA	2	10	315401	315410	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020053	CAACT	2	10	321824	321833	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020053	CAAGT	2	10	322408	322417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020053	TAATT	2	10	331767	331776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020053	TTGTT	2	10	336621	336630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020053	CTCAT	2	10	343509	343518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_020053	TCGCC	2	10	357664	357673	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_020053	ATTTC	2	10	369782	369791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020053	ACTAT	2	10	370705	370714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020053	TAACT	2	10	377986	377995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020053	AATAT	2	10	382351	382360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020053	AATAA	2	10	384037	384046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020053	ATATG	2	10	395856	395865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020053	TTAAT	2	10	396685	396694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020053	GAGAT	2	10	397543	397552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020053	GAAAT	2	10	408633	408642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020053	ATTCT	2	10	408785	408794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020053	AGTTT	2	10	415831	415840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020053	TTTAG	2	10	426978	426987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020053	ATCAT	2	10	428116	428125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020053	CAAAT	2	10	431940	431949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020053	AATAA	2	10	432073	432082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020053	GTATG	2	10	433490	433499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020053	TTACT	2	10	433505	433514	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.