MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 1636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	AATT	2	8	47	54	50 %	50 %	0 %	0 %	436736819
2	NC_020053	TGCT	2	8	232	239	0 %	50 %	25 %	25 %	436736819
3	NC_020053	AATT	2	8	669	676	50 %	50 %	0 %	0 %	436736820
4	NC_020053	GCGA	2	8	1287	1294	25 %	0 %	50 %	25 %	436736820
5	NC_020053	CAAT	2	8	1420	1427	50 %	25 %	0 %	25 %	436736820
6	NC_020053	GGTG	2	8	1429	1436	0 %	25 %	75 %	0 %	436736820
7	NC_020053	CGAT	2	8	1524	1531	25 %	25 %	25 %	25 %	436736820
8	NC_020053	CAAC	2	8	1693	1700	50 %	0 %	0 %	50 %	436736820
9	NC_020053	CAAT	2	8	2353	2360	50 %	25 %	0 %	25 %	436736820
10	NC_020053	TGGG	2	8	2830	2837	0 %	25 %	75 %	0 %	436736820
11	NC_020053	CAAC	2	8	3062	3069	50 %	0 %	0 %	50 %	436736820
12	NC_020053	GAAA	2	8	3217	3224	75 %	0 %	25 %	0 %	436736820
13	NC_020053	AGCT	2	8	4236	4243	25 %	25 %	25 %	25 %	436736820
14	NC_020053	TCGA	2	8	4569	4576	25 %	25 %	25 %	25 %	436736820
15	NC_020053	TCCT	2	8	4638	4645	0 %	50 %	0 %	50 %	436736820
16	NC_020053	AATT	2	8	4657	4664	50 %	50 %	0 %	0 %	436736820
17	NC_020053	GGTC	2	8	4700	4707	0 %	25 %	50 %	25 %	436736820
18	NC_020053	AGGT	2	8	5265	5272	25 %	25 %	50 %	0 %	436736822
19	NC_020053	TAAA	2	8	5629	5636	75 %	25 %	0 %	0 %	436736823
20	NC_020053	CTTT	2	8	6182	6189	0 %	75 %	0 %	25 %	436736823
21	NC_020053	ATCG	2	8	6277	6284	25 %	25 %	25 %	25 %	436736823
22	NC_020053	CGTC	2	8	6721	6728	0 %	25 %	25 %	50 %	436736823
23	NC_020053	TCGA	2	8	6931	6938	25 %	25 %	25 %	25 %	436736823
24	NC_020053	AGCG	2	8	7473	7480	25 %	0 %	50 %	25 %	436736823
25	NC_020053	TCGT	2	8	7903	7910	0 %	50 %	25 %	25 %	436736823
26	NC_020053	ATCG	2	8	8241	8248	25 %	25 %	25 %	25 %	436736824
27	NC_020053	CTCG	2	8	8353	8360	0 %	25 %	25 %	50 %	436736824
28	NC_020053	ATCG	2	8	8429	8436	25 %	25 %	25 %	25 %	436736824
29	NC_020053	CGAT	2	8	8572	8579	25 %	25 %	25 %	25 %	436736824
30	NC_020053	CTGC	2	8	9112	9119	0 %	25 %	25 %	50 %	436736824
31	NC_020053	ATCG	2	8	9713	9720	25 %	25 %	25 %	25 %	436736824
32	NC_020053	TAAG	2	8	10127	10134	50 %	25 %	25 %	0 %	436736824
33	NC_020053	CCCG	2	8	10482	10489	0 %	0 %	25 %	75 %	436736824
34	NC_020053	CTCG	2	8	10570	10577	0 %	25 %	25 %	50 %	436736824
35	NC_020053	GATA	2	8	11235	11242	50 %	25 %	25 %	0 %	436736825
36	NC_020053	GAAC	2	8	11409	11416	50 %	0 %	25 %	25 %	436736825
37	NC_020053	ACTC	2	8	11537	11544	25 %	25 %	0 %	50 %	436736826
38	NC_020053	TCGA	2	8	12096	12103	25 %	25 %	25 %	25 %	436736826
39	NC_020053	TACT	2	8	12189	12196	25 %	50 %	0 %	25 %	436736826
40	NC_020053	AATT	2	8	12912	12919	50 %	50 %	0 %	0 %	436736827
41	NC_020053	TCGA	3	12	12943	12954	25 %	25 %	25 %	25 %	436736827
42	NC_020053	TGAG	2	8	13585	13592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020053	ACTC	2	8	13606	13613	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020053	TAAA	2	8	14067	14074	75 %	25 %	0 %	0 %	436736830
45	NC_020053	CAGA	2	8	14103	14110	50 %	0 %	25 %	25 %	436736830
46	NC_020053	CCCA	2	8	14619	14626	25 %	0 %	0 %	75 %	436736831
47	NC_020053	CGAT	2	8	14748	14755	25 %	25 %	25 %	25 %	436736831
48	NC_020053	GAGC	2	8	15261	15268	25 %	0 %	50 %	25 %	436736832
49	NC_020053	TCGC	2	8	15305	15312	0 %	25 %	25 %	50 %	436736832
50	NC_020053	ATAA	2	8	15525	15532	75 %	25 %	0 %	0 %	436736832
51	NC_020053	GTGA	2	8	15830	15837	25 %	25 %	50 %	0 %	436736833
52	NC_020053	TATC	2	8	16015	16022	25 %	50 %	0 %	25 %	436736833
53	NC_020053	AATT	2	8	16623	16630	50 %	50 %	0 %	0 %	436736836
54	NC_020053	CAAG	2	8	17126	17133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020053	TTTG	2	8	17806	17813	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020053	ATCG	2	8	18220	18227	25 %	25 %	25 %	25 %	436736839
57	NC_020053	GATA	2	8	18336	18343	50 %	25 %	25 %	0 %	436736839
58	NC_020053	CAGC	2	8	18516	18523	25 %	0 %	25 %	50 %	436736839
59	NC_020053	CCAA	2	8	18642	18649	50 %	0 %	0 %	50 %	436736839
60	NC_020053	GTCG	2	8	18751	18758	0 %	25 %	50 %	25 %	436736839
61	NC_020053	TCGA	2	8	19499	19506	25 %	25 %	25 %	25 %	436736840
62	NC_020053	TTTG	2	8	19633	19640	0 %	75 %	25 %	0 %	436736841
63	NC_020053	AGCC	2	8	20025	20032	25 %	0 %	25 %	50 %	436736842
64	NC_020053	ACGG	2	8	20226	20233	25 %	0 %	50 %	25 %	436736842
65	NC_020053	TCGA	2	8	21125	21132	25 %	25 %	25 %	25 %	436736843
66	NC_020053	TCGC	2	8	21288	21295	0 %	25 %	25 %	50 %	436736843
67	NC_020053	CGAC	2	8	21702	21709	25 %	0 %	25 %	50 %	436736844
68	NC_020053	CGAA	2	8	22067	22074	50 %	0 %	25 %	25 %	436736845
69	NC_020053	TCGA	2	8	22252	22259	25 %	25 %	25 %	25 %	436736845
70	NC_020053	ATCG	2	8	22320	22327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020053	GTTG	2	8	22543	22550	0 %	50 %	50 %	0 %	436736846
72	NC_020053	AACA	2	8	22555	22562	75 %	0 %	0 %	25 %	436736846
73	NC_020053	GGCT	2	8	22721	22728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020053	GATC	2	8	22746	22753	25 %	25 %	25 %	25 %	436736847
75	NC_020053	TTAC	2	8	23333	23340	25 %	50 %	0 %	25 %	436736848
76	NC_020053	AGAA	2	8	23393	23400	75 %	0 %	25 %	0 %	436736848
77	NC_020053	CATC	2	8	23412	23419	25 %	25 %	0 %	50 %	436736848
78	NC_020053	GCTT	2	8	23914	23921	0 %	50 %	25 %	25 %	436736848
79	NC_020053	TCAA	2	8	24528	24535	50 %	25 %	0 %	25 %	436736850
80	NC_020053	AGAT	2	8	24574	24581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020053	TCGA	2	8	25039	25046	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
82	NC_020053	GAGT	2	8	25258	25265	25 %	25 %	50 %	0 %	436736851
83	NC_020053	GATT	2	8	25360	25367	25 %	50 %	25 %	0 %	436736851
84	NC_020053	GATC	2	8	25484	25491	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
85	NC_020053	GTTA	2	8	25614	25621	25 %	50 %	25 %	0 %	436736851
86	NC_020053	GCAA	2	8	25795	25802	50 %	0 %	25 %	25 %	436736851
87	NC_020053	TGAG	2	8	26245	26252	25 %	25 %	50 %	0 %	436736851
88	NC_020053	GATC	2	8	26339	26346	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
89	NC_020053	CCTG	2	8	26377	26384	0 %	25 %	25 %	50 %	436736851
90	NC_020053	CGAT	2	8	26485	26492	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
91	NC_020053	ATCG	2	8	26831	26838	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
92	NC_020053	CGAT	2	8	26890	26897	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
93	NC_020053	TCGA	2	8	27262	27269	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
94	NC_020053	ATAC	2	8	27331	27338	50 %	25 %	0 %	25 %	436736851
95	NC_020053	CGAT	2	8	27369	27376	25 %	25 %	25 %	25 %	436736851
96	NC_020053	TGTT	2	8	27733	27740	0 %	75 %	25 %	0 %	436736852
97	NC_020053	CGAT	2	8	27997	28004	25 %	25 %	25 %	25 %	436736852
98	NC_020053	ATCG	2	8	28315	28322	25 %	25 %	25 %	25 %	436736852
99	NC_020053	TCGA	2	8	28651	28658	25 %	25 %	25 %	25 %	436736852
100	NC_020053	AATT	2	8	29029	29036	50 %	50 %	0 %	0 %	436736852
101	NC_020053	CTGT	2	8	29361	29368	0 %	50 %	25 %	25 %	436736852
102	NC_020053	GCAA	2	8	29581	29588	50 %	0 %	25 %	25 %	436736852
103	NC_020053	CAGC	2	8	29686	29693	25 %	0 %	25 %	50 %	436736852
104	NC_020053	AGAT	2	8	30397	30404	50 %	25 %	25 %	0 %	436736852
105	NC_020053	GCTG	2	8	30896	30903	0 %	25 %	50 %	25 %	436736852
106	NC_020053	AACT	2	8	31118	31125	50 %	25 %	0 %	25 %	436736852
107	NC_020053	ATTA	2	8	31606	31613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020053	GAAA	2	8	31733	31740	75 %	0 %	25 %	0 %	436736853
109	NC_020053	ATCG	2	8	32310	32317	25 %	25 %	25 %	25 %	436736853
110	NC_020053	GCAA	2	8	32656	32663	50 %	0 %	25 %	25 %	436736853
111	NC_020053	ATCG	2	8	32799	32806	25 %	25 %	25 %	25 %	436736854
112	NC_020053	CGAT	2	8	32838	32845	25 %	25 %	25 %	25 %	436736854
113	NC_020053	ATCG	3	12	33289	33300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020053	CCAC	2	8	33781	33788	25 %	0 %	0 %	75 %	436736856
115	NC_020053	TGAA	2	8	33846	33853	50 %	25 %	25 %	0 %	436736856
116	NC_020053	CGAT	2	8	33885	33892	25 %	25 %	25 %	25 %	436736856
117	NC_020053	CGAT	2	8	34207	34214	25 %	25 %	25 %	25 %	436736857
118	NC_020053	TCGA	2	8	34679	34686	25 %	25 %	25 %	25 %	436736857
119	NC_020053	ATCG	2	8	35148	35155	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
120	NC_020053	ACTA	2	8	35520	35527	50 %	25 %	0 %	25 %	436736858
121	NC_020053	GACA	2	8	35733	35740	50 %	0 %	25 %	25 %	436736858
122	NC_020053	GATC	2	8	35900	35907	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
123	NC_020053	TCAC	2	8	36009	36016	25 %	25 %	0 %	50 %	436736858
124	NC_020053	AATT	2	8	36307	36314	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
125	NC_020053	TCGA	2	8	36333	36340	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
126	NC_020053	AAAG	2	8	36473	36480	75 %	0 %	25 %	0 %	436736858
127	NC_020053	TTGT	2	8	36507	36514	0 %	75 %	25 %	0 %	436736858
128	NC_020053	GAAT	2	8	36641	36648	50 %	25 %	25 %	0 %	436736858
129	NC_020053	TCCT	2	8	36837	36844	0 %	50 %	0 %	50 %	436736858
130	NC_020053	AATT	2	8	37006	37013	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
131	NC_020053	ATTA	2	8	37092	37099	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
132	NC_020053	CGAT	2	8	37234	37241	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
133	NC_020053	TCAA	2	8	37288	37295	50 %	25 %	0 %	25 %	436736858
134	NC_020053	TAAT	2	8	37510	37517	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
135	NC_020053	TCGA	2	8	37603	37610	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
136	NC_020053	CTGG	2	8	38090	38097	0 %	25 %	50 %	25 %	436736858
137	NC_020053	TCGA	2	8	38240	38247	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
138	NC_020053	GATC	2	8	38469	38476	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
139	NC_020053	AATC	2	8	39098	39105	50 %	25 %	0 %	25 %	436736858
140	NC_020053	TCGA	2	8	39249	39256	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
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