MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 5582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020053	AAG	2	6	76	81	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
3	NC_020053	GAA	3	9	120	128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
4	NC_020053	AGA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
5	NC_020053	GAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
6	NC_020053	TCG	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
7	NC_020053	AGC	2	6	850	855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
8	NC_020053	TTA	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736820
9	NC_020053	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
10	NC_020053	ATT	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736820
11	NC_020053	CGC	2	6	1228	1233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
12	NC_020053	CTA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736820
13	NC_020053	CGA	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
14	NC_020053	ATC	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736820
15	NC_020053	CAA	2	6	1639	1644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
16	NC_020053	CGA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
17	NC_020053	GCC	2	6	1713	1718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
18	NC_020053	TCG	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
19	NC_020053	TTA	2	6	1861	1866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736820
20	NC_020053	AGC	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
21	NC_020053	TAA	2	6	1909	1914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736820
22	NC_020053	TCC	2	6	1923	1928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736820
23	NC_020053	CTT	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736820
24	NC_020053	TGG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
25	NC_020053	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736820
26	NC_020053	ACC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736820
27	NC_020053	TCC	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736820
28	NC_020053	AGA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736820
29	NC_020053	ACC	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736820
30	NC_020053	CAG	3	9	2574	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
31	NC_020053	TGT	2	6	2639	2644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736820
32	NC_020053	CGG	2	6	2673	2678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736820
33	NC_020053	AGC	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
34	NC_020053	TGG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
35	NC_020053	ACA	2	6	2872	2877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
36	NC_020053	GTC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
37	NC_020053	TAG	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
38	NC_020053	TGG	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
39	NC_020053	AAG	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736820
40	NC_020053	TGT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736820
41	NC_020053	AAT	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736820
42	NC_020053	CAA	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
43	NC_020053	GTA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
44	NC_020053	CCG	2	6	3578	3583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
45	NC_020053	GCC	2	6	3608	3613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
46	NC_020053	CTG	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
47	NC_020053	GGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
48	NC_020053	CAA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
49	NC_020053	CGG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736820
50	NC_020053	GCA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
51	NC_020053	AGC	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
52	NC_020053	CAG	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
53	NC_020053	ACG	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
54	NC_020053	GAT	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
55	NC_020053	CTA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736820
56	NC_020053	TGA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
57	NC_020053	CAA	2	6	4578	4583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
58	NC_020053	ATA	2	6	4746	4751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736821
59	NC_020053	AGT	2	6	4891	4896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736821
60	NC_020053	TGA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736821
61	NC_020053	TGA	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736821
62	NC_020053	ATC	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736822
63	NC_020053	CGT	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736822
64	NC_020053	ATA	2	6	5401	5406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736822
65	NC_020053	ATA	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736822
66	NC_020053	GGA	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736822
67	NC_020053	AAT	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736822
68	NC_020053	TTC	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736822
69	NC_020053	ATA	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
70	NC_020053	CGT	2	6	5621	5626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736823
71	NC_020053	ATT	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736823
72	NC_020053	AAT	2	6	5900	5905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
73	NC_020053	ACT	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
74	NC_020053	GCA	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736823
75	NC_020053	TCC	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736823
76	NC_020053	AGC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736823
77	NC_020053	GGA	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736823
78	NC_020053	CAT	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
79	NC_020053	TCG	2	6	6803	6808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736823
80	NC_020053	GAA	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736823
81	NC_020053	CCG	2	6	6869	6874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736823
82	NC_020053	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
83	NC_020053	GAT	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
84	NC_020053	CGC	2	6	7107	7112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736823
85	NC_020053	GCC	2	6	7171	7176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736823
86	NC_020053	CGA	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736823
87	NC_020053	CAT	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
88	NC_020053	ATA	2	6	7591	7596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
89	NC_020053	AGT	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
90	NC_020053	GTA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
91	NC_020053	ATA	2	6	7761	7766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
92	NC_020053	ACT	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
93	NC_020053	AAC	2	6	8126	8131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736824
94	NC_020053	GTT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736824
95	NC_020053	GGC	2	6	8300	8305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736824
96	NC_020053	CGA	2	6	8344	8349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736824
97	NC_020053	GCT	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
98	NC_020053	CTT	2	6	8662	8667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736824
99	NC_020053	CTG	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
100	NC_020053	ATG	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736824
101	NC_020053	CGC	2	6	9140	9145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736824
102	NC_020053	TGA	2	6	9149	9154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736824
103	NC_020053	ATA	2	6	9211	9216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736824
104	NC_020053	CAT	2	6	9226	9231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736824
105	NC_020053	CAA	2	6	9239	9244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736824
106	NC_020053	CTT	2	6	9394	9399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736824
107	NC_020053	TGG	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736824
108	NC_020053	CGT	2	6	9530	9535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
109	NC_020053	GTG	2	6	9645	9650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736824
110	NC_020053	TCG	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
111	NC_020053	GCG	2	6	9828	9833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736824
112	NC_020053	CTG	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
113	NC_020053	CGG	2	6	10120	10125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736824
114	NC_020053	TCA	2	6	10225	10230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736824
115	NC_020053	CTG	2	6	10524	10529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
116	NC_020053	ACC	2	6	10618	10623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736824
117	NC_020053	AGC	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020053	TAA	2	6	10954	10959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020053	TTA	2	6	10975	10980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020053	TAG	2	6	11026	11031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020053	ACA	2	6	11138	11143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736825
122	NC_020053	GAT	3	9	11299	11307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736825
123	NC_020053	GTC	2	6	11314	11319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736825
124	NC_020053	CGA	2	6	11337	11342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736825
125	NC_020053	CCA	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736825
126	NC_020053	AAG	2	6	11695	11700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736826
127	NC_020053	AGC	2	6	11777	11782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736826
128	NC_020053	GAA	2	6	11807	11812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736826
129	NC_020053	GTT	2	6	11819	11824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736826
130	NC_020053	TGC	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736826
131	NC_020053	ATT	2	6	11852	11857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736826
132	NC_020053	GGC	2	6	11967	11972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736826
133	NC_020053	ATG	2	6	12033	12038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736826
134	NC_020053	GTA	2	6	12120	12125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736826
135	NC_020053	CTG	2	6	12172	12177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736826
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150	NC_020053	GAC	2	6	13512	13517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_020053	CAT	2	6	13797	13802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_020053	TGC	2	6	13816	13821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_020053	CCG	2	6	13824	13829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_020053	TTG	2	6	13886	13891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_020053	CAA	2	6	21487	21492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736844
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256	NC_020053	CTG	2	6	21948	21953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_020053	TCG	2	6	21969	21974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_020053	GTG	2	6	22127	22132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736845
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262	NC_020053	TCG	2	6	22389	22394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_020053	GCA	2	6	22691	22696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_020053	TCC	2	6	31309	31314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736852
381	NC_020053	GAA	2	6	31436	31441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736852
382	NC_020053	AGA	2	6	31620	31625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
383	NC_020053	AGA	2	6	31674	31679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
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385	NC_020053	TTC	2	6	31841	31846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736853
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389	NC_020053	AGA	2	6	32210	32215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
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392	NC_020053	AGA	2	6	32531	32536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
393	NC_020053	TAA	2	6	32594	32599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736853
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401	NC_020053	TCC	2	6	33572	33577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
402	NC_020053	CAT	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736856
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491	NC_020053	AAT	2	6	42491	42496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736862
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499	NC_020053	GTT	2	6	43304	43309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736863
500	NC_020053	TCA	2	6	43409	43414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736863

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