MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	TC	3	6	2375	2380	0 %	50 %	0 %	50 %	436736820
2	NC_020053	TA	3	6	3917	3922	50 %	50 %	0 %	0 %	436736820
3	NC_020053	TA	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	436736821
4	NC_020053	AG	3	6	5289	5294	50 %	0 %	50 %	0 %	436736822
5	NC_020053	AG	3	6	6743	6748	50 %	0 %	50 %	0 %	436736823
6	NC_020053	AG	3	6	7134	7139	50 %	0 %	50 %	0 %	436736823
7	NC_020053	AG	3	6	7213	7218	50 %	0 %	50 %	0 %	436736823
8	NC_020053	CG	3	6	8206	8211	0 %	0 %	50 %	50 %	436736824
9	NC_020053	CG	3	6	9677	9682	0 %	0 %	50 %	50 %	436736824
10	NC_020053	AG	3	6	10004	10009	50 %	0 %	50 %	0 %	436736824
11	NC_020053	AT	3	6	11071	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	436736825
12	NC_020053	CG	3	6	12015	12020	0 %	0 %	50 %	50 %	436736826
13	NC_020053	TG	3	6	13327	13332	0 %	50 %	50 %	0 %	436736828
14	NC_020053	AG	3	6	14002	14007	50 %	0 %	50 %	0 %	436736830
15	NC_020053	CT	3	6	14366	14371	0 %	50 %	0 %	50 %	436736831
16	NC_020053	TC	3	6	15224	15229	0 %	50 %	0 %	50 %	436736832
17	NC_020053	TA	3	6	16600	16605	50 %	50 %	0 %	0 %	436736836
18	NC_020053	TC	3	6	17601	17606	0 %	50 %	0 %	50 %	436736838
19	NC_020053	GC	3	6	18686	18691	0 %	0 %	50 %	50 %	436736839
20	NC_020053	GT	3	6	19129	19134	0 %	50 %	50 %	0 %	436736840
21	NC_020053	AC	3	6	19159	19164	50 %	0 %	0 %	50 %	436736840
22	NC_020053	CT	3	6	19179	19184	0 %	50 %	0 %	50 %	436736840
23	NC_020053	AT	3	6	19203	19208	50 %	50 %	0 %	0 %	436736840
24	NC_020053	TA	3	6	19241	19246	50 %	50 %	0 %	0 %	436736840
25	NC_020053	AT	3	6	22232	22237	50 %	50 %	0 %	0 %	436736845
26	NC_020053	CG	3	6	23481	23486	0 %	0 %	50 %	50 %	436736848
27	NC_020053	TA	3	6	25648	25653	50 %	50 %	0 %	0 %	436736851
28	NC_020053	AT	3	6	28820	28825	50 %	50 %	0 %	0 %	436736852
29	NC_020053	CT	3	6	30419	30424	0 %	50 %	0 %	50 %	436736852
30	NC_020053	CA	3	6	30644	30649	50 %	0 %	0 %	50 %	436736852
31	NC_020053	AC	3	6	31174	31179	50 %	0 %	0 %	50 %	436736852
32	NC_020053	TG	3	6	31283	31288	0 %	50 %	50 %	0 %	436736852
33	NC_020053	TC	3	6	31868	31873	0 %	50 %	0 %	50 %	436736853
34	NC_020053	GA	3	6	32907	32912	50 %	0 %	50 %	0 %	436736854
35	NC_020053	AG	3	6	35465	35470	50 %	0 %	50 %	0 %	436736858
36	NC_020053	CA	3	6	35616	35621	50 %	0 %	0 %	50 %	436736858
37	NC_020053	GA	3	6	37376	37381	50 %	0 %	50 %	0 %	436736858
38	NC_020053	AT	3	6	38654	38659	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
39	NC_020053	TC	3	6	39434	39439	0 %	50 %	0 %	50 %	436736858
40	NC_020053	AG	3	6	40605	40610	50 %	0 %	50 %	0 %	436736859
41	NC_020053	TC	3	6	44557	44562	0 %	50 %	0 %	50 %	436736864
42	NC_020053	AT	3	6	45651	45656	50 %	50 %	0 %	0 %	436736865
43	NC_020053	GT	3	6	46356	46361	0 %	50 %	50 %	0 %	436736865
44	NC_020053	AC	3	6	46516	46521	50 %	0 %	0 %	50 %	436736865
45	NC_020053	AC	3	6	46871	46876	50 %	0 %	0 %	50 %	436736865
46	NC_020053	GT	3	6	48542	48547	0 %	50 %	50 %	0 %	436736866
47	NC_020053	GT	3	6	48598	48603	0 %	50 %	50 %	0 %	436736866
48	NC_020053	TG	3	6	49708	49713	0 %	50 %	50 %	0 %	436736867
49	NC_020053	TC	3	6	49761	49766	0 %	50 %	0 %	50 %	436736867
50	NC_020053	CT	3	6	50053	50058	0 %	50 %	0 %	50 %	436736868
51	NC_020053	CT	4	8	50095	50102	0 %	50 %	0 %	50 %	436736868
52	NC_020053	AG	3	6	50159	50164	50 %	0 %	50 %	0 %	436736868
53	NC_020053	GT	3	6	50530	50535	0 %	50 %	50 %	0 %	436736868
54	NC_020053	AG	3	6	52818	52823	50 %	0 %	50 %	0 %	436736869
55	NC_020053	TC	3	6	52897	52902	0 %	50 %	0 %	50 %	436736869
56	NC_020053	GA	3	6	53138	53143	50 %	0 %	50 %	0 %	436736869
57	NC_020053	CA	3	6	53511	53516	50 %	0 %	0 %	50 %	436736870
58	NC_020053	TC	3	6	54277	54282	0 %	50 %	0 %	50 %	436736870
59	NC_020053	TC	3	6	54672	54677	0 %	50 %	0 %	50 %	436736871
60	NC_020053	GT	3	6	56515	56520	0 %	50 %	50 %	0 %	436736872
61	NC_020053	AT	3	6	56539	56544	50 %	50 %	0 %	0 %	436736872
62	NC_020053	TC	3	6	56644	56649	0 %	50 %	0 %	50 %	436736872
63	NC_020053	TA	3	6	56888	56893	50 %	50 %	0 %	0 %	436736872
64	NC_020053	AT	3	6	57096	57101	50 %	50 %	0 %	0 %	436736872
65	NC_020053	GA	3	6	58257	58262	50 %	0 %	50 %	0 %	436736874
66	NC_020053	CT	3	6	58746	58751	0 %	50 %	0 %	50 %	436736874
67	NC_020053	CT	3	6	59896	59901	0 %	50 %	0 %	50 %	436736876
68	NC_020053	GA	3	6	63187	63192	50 %	0 %	50 %	0 %	436736877
69	NC_020053	GA	3	6	63199	63204	50 %	0 %	50 %	0 %	436736877
70	NC_020053	TC	3	6	63351	63356	0 %	50 %	0 %	50 %	436736877
71	NC_020053	TC	3	6	65994	65999	0 %	50 %	0 %	50 %	436736878
72	NC_020053	CA	3	6	66318	66323	50 %	0 %	0 %	50 %	436736878
73	NC_020053	AG	3	6	68004	68009	50 %	0 %	50 %	0 %	436736880
74	NC_020053	AT	3	6	68588	68593	50 %	50 %	0 %	0 %	436736881
75	NC_020053	TC	3	6	71043	71048	0 %	50 %	0 %	50 %	436736883
76	NC_020053	AT	3	6	71159	71164	50 %	50 %	0 %	0 %	436736883
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78	NC_020053	CT	3	6	71805	71810	0 %	50 %	0 %	50 %	436736884
79	NC_020053	TC	3	6	71841	71846	0 %	50 %	0 %	50 %	436736884
80	NC_020053	CG	3	6	73032	73037	0 %	0 %	50 %	50 %	436736884
81	NC_020053	GT	3	6	75029	75034	0 %	50 %	50 %	0 %	436736886
82	NC_020053	TG	3	6	75420	75425	0 %	50 %	50 %	0 %	436736886
83	NC_020053	CT	3	6	79057	79062	0 %	50 %	0 %	50 %	436736887
84	NC_020053	GA	3	6	80195	80200	50 %	0 %	50 %	0 %	436736887
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86	NC_020053	GC	3	6	86665	86670	0 %	0 %	50 %	50 %	436736898
87	NC_020053	CG	3	6	88292	88297	0 %	0 %	50 %	50 %	436736899
88	NC_020053	AG	3	6	89293	89298	50 %	0 %	50 %	0 %	436736900
89	NC_020053	AT	3	6	89416	89421	50 %	50 %	0 %	0 %	436736901
90	NC_020053	AC	3	6	92297	92302	50 %	0 %	0 %	50 %	436736903
91	NC_020053	CG	3	6	92649	92654	0 %	0 %	50 %	50 %	436736904
92	NC_020053	TA	3	6	93813	93818	50 %	50 %	0 %	0 %	436736904
93	NC_020053	CT	3	6	95009	95014	0 %	50 %	0 %	50 %	436736905
94	NC_020053	GA	3	6	95526	95531	50 %	0 %	50 %	0 %	436736905
95	NC_020053	CA	3	6	98409	98414	50 %	0 %	0 %	50 %	436736907
96	NC_020053	CA	3	6	102737	102742	50 %	0 %	0 %	50 %	436736911
97	NC_020053	GA	3	6	102836	102841	50 %	0 %	50 %	0 %	436736911
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100	NC_020053	CA	3	6	105774	105779	50 %	0 %	0 %	50 %	436736913
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102	NC_020053	GA	3	6	110256	110261	50 %	0 %	50 %	0 %	436736916
103	NC_020053	TG	3	6	110599	110604	0 %	50 %	50 %	0 %	436736916
104	NC_020053	TC	3	6	112153	112158	0 %	50 %	0 %	50 %	436736917
105	NC_020053	TC	3	6	112249	112254	0 %	50 %	0 %	50 %	436736917
106	NC_020053	AC	3	6	112630	112635	50 %	0 %	0 %	50 %	436736917
107	NC_020053	TG	3	6	114223	114228	0 %	50 %	50 %	0 %	436736920
108	NC_020053	GT	3	6	115071	115076	0 %	50 %	50 %	0 %	436736921
109	NC_020053	CG	3	6	118139	118144	0 %	0 %	50 %	50 %	436736922
110	NC_020053	GA	3	6	118594	118599	50 %	0 %	50 %	0 %	436736922
111	NC_020053	GC	3	6	119388	119393	0 %	0 %	50 %	50 %	436736923
112	NC_020053	TG	3	6	121382	121387	0 %	50 %	50 %	0 %	436736925
113	NC_020053	AG	3	6	125237	125242	50 %	0 %	50 %	0 %	436736927
114	NC_020053	AG	3	6	125724	125729	50 %	0 %	50 %	0 %	436736927
115	NC_020053	GA	4	8	125810	125817	50 %	0 %	50 %	0 %	436736927
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117	NC_020053	TC	3	6	127789	127794	0 %	50 %	0 %	50 %	436736931
118	NC_020053	TG	3	6	127833	127838	0 %	50 %	50 %	0 %	436736931
119	NC_020053	CT	3	6	128127	128132	0 %	50 %	0 %	50 %	436736932
120	NC_020053	TG	3	6	133660	133665	0 %	50 %	50 %	0 %	436736935
121	NC_020053	AT	3	6	134228	134233	50 %	50 %	0 %	0 %	436736936
122	NC_020053	TG	3	6	136997	137002	0 %	50 %	50 %	0 %	436736941
123	NC_020053	TC	3	6	140529	140534	0 %	50 %	0 %	50 %	436736946
124	NC_020053	GA	3	6	142126	142131	50 %	0 %	50 %	0 %	436736948
125	NC_020053	GT	3	6	142713	142718	0 %	50 %	50 %	0 %	436736948
126	NC_020053	TA	3	6	142799	142804	50 %	50 %	0 %	0 %	436736948
127	NC_020053	AT	3	6	143374	143379	50 %	50 %	0 %	0 %	436736949
128	NC_020053	TC	4	8	145695	145702	0 %	50 %	0 %	50 %	436736950
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130	NC_020053	TA	3	6	148617	148622	50 %	50 %	0 %	0 %	436736953
131	NC_020053	AC	3	6	150093	150098	50 %	0 %	0 %	50 %	436736955
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137	NC_020053	AG	3	6	157925	157930	50 %	0 %	50 %	0 %	436736960
138	NC_020053	TG	3	6	157938	157943	0 %	50 %	50 %	0 %	436736960
139	NC_020053	TG	3	6	158839	158844	0 %	50 %	50 %	0 %	436736961
140	NC_020053	TG	3	6	159893	159898	0 %	50 %	50 %	0 %	436736962
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.