MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	GTCATG	2	12	5568	5579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436735875
2	NC_020051	TAATCC	2	12	11559	11570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436735879
3	NC_020051	GCAATC	2	12	14188	14199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436735882
4	NC_020051	CCGCAT	2	12	18246	18257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436735885
5	NC_020051	TGATAA	2	12	18566	18577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436735885
6	NC_020051	GCGATC	2	12	30184	30195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436735892
7	NC_020051	GCCCTC	2	12	32706	32717	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	436735895
8	NC_020051	GTGGTC	2	12	37757	37768	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436735898
9	NC_020051	CTGTGA	2	12	41320	41331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436735899
10	NC_020051	AGCTAG	2	12	43031	43042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436735901
11	NC_020051	CCCATT	2	12	43835	43846	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	436735902
12	NC_020051	GTTGGC	2	12	44094	44105	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436735902
13	NC_020051	AGAAGC	2	12	47087	47098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	436735904
14	NC_020051	GCAACC	2	12	52922	52933	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	436735907
15	NC_020051	AAGATA	2	12	53444	53455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	436735907
16	NC_020051	ATCGCG	2	12	56377	56388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436735909
17	NC_020051	AGGGTT	2	12	60918	60929	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	436735913
18	NC_020051	CAATCC	2	12	61695	61706	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	436735915
19	NC_020051	TCGCGC	2	12	61909	61920	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	436735915
20	NC_020051	ACGCTT	2	12	62853	62864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436735915
21	NC_020051	TAACCA	2	12	64109	64120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	436735916
22	NC_020051	CAATTG	2	12	64238	64249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436735916
23	NC_020051	CAATGC	2	12	66393	66404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436735918
24	NC_020051	CTACAA	2	12	68541	68552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	436735920
25	NC_020051	GACGGC	2	12	70691	70702	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	436735921
26	NC_020051	ATCTGC	2	12	71439	71450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436735921
27	NC_020051	AATCCC	2	12	72282	72293	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	436735923
28	NC_020051	TCATAA	2	12	87169	87180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436735936
29	NC_020051	GGCATG	2	12	87201	87212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436735936
30	NC_020051	CTAACC	2	12	88439	88450	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	436735936
31	NC_020051	CTGTGC	2	12	95221	95232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436735947
32	NC_020051	CAAGTC	2	12	97493	97504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436735949
33	NC_020051	CTAAAG	2	12	109196	109207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436735963
34	NC_020051	TTGAGC	2	12	113128	113139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436735967
35	NC_020051	CAATAG	2	12	127025	127036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436735976
36	NC_020051	TCATCT	2	12	127867	127878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	436735976
37	NC_020051	TTTTCA	2	12	128251	128262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	436735976
38	NC_020051	GGGATT	2	12	129687	129698	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	436735976
39	NC_020051	GTCAAT	2	12	134659	134670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436735979
40	NC_020051	GCTGTC	2	12	136261	136272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436735980
41	NC_020051	AATTAG	2	12	144073	144084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436735988
42	NC_020051	TTTGTT	2	12	145768	145779	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	436735990
43	NC_020051	AGATGA	2	12	147175	147186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436735991
44	NC_020051	CCTCGA	2	12	147610	147621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436735991
45	NC_020051	GATTAG	2	12	151926	151937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436735995
46	NC_020051	GATCGA	2	12	152719	152730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436735996
47	NC_020051	CTTCAA	2	12	157286	157297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736000
48	NC_020051	AATCCG	2	12	157755	157766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436736000
49	NC_020051	CAGCCG	2	12	162523	162534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	436736005
50	NC_020051	AGTTGC	2	12	165030	165041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436736009
51	NC_020051	GTCTTC	2	12	165459	165470	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	436736010
52	NC_020051	TAGTTG	2	12	165920	165931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436736010
53	NC_020051	CTTCAT	2	12	167700	167711	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	436736011
54	NC_020051	AAGACG	2	12	180025	180036	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	436736026
55	NC_020051	TGAAGG	2	12	182390	182401	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	436736026
56	NC_020051	GGAATT	2	12	183695	183706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736027
57	NC_020051	CCGCAG	2	12	184698	184709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	436736028
58	NC_020051	AGTAGC	2	12	198837	198848	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436736041
59	NC_020051	TCGTGG	2	12	200248	200259	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436736042

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.