MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	CTCTG	2	10	324	333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020051	CTAAA	2	10	901	910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020051	TTGTT	2	10	1427	1436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020051	TGACA	2	10	1554	1563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020051	GTTTT	2	10	3353	3362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020051	CGACC	2	10	7180	7189	20 %	0 %	20 %	60 %	436735875
7	NC_020051	AGTTG	2	10	8444	8453	20 %	40 %	40 %	0 %	436735876
8	NC_020051	TTGAG	2	10	10397	10406	20 %	40 %	40 %	0 %	436735878
9	NC_020051	ACTGA	2	10	13024	13033	40 %	20 %	20 %	20 %	436735882
10	NC_020051	TGCTT	2	10	15293	15302	0 %	60 %	20 %	20 %	436735883
11	NC_020051	ATGCA	2	10	16591	16600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020051	GTTCT	2	10	18037	18046	0 %	60 %	20 %	20 %	436735885
13	NC_020051	ATCTC	2	10	18261	18270	20 %	40 %	0 %	40 %	436735885
14	NC_020051	ATCCG	2	10	19345	19354	20 %	20 %	20 %	40 %	436735886
15	NC_020051	ACCCA	2	10	21702	21711	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_020051	AATTG	2	10	23291	23300	40 %	40 %	20 %	0 %	436735890
17	NC_020051	GTAGC	2	10	24466	24475	20 %	20 %	40 %	20 %	436735890
18	NC_020051	TCAAA	2	10	25173	25182	60 %	20 %	0 %	20 %	436735890
19	NC_020051	ACTCA	2	10	27098	27107	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020051	AGAAC	2	10	27828	27837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020051	GTTGA	2	10	28225	28234	20 %	40 %	40 %	0 %	436735891
22	NC_020051	TTTCC	2	10	30371	30380	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_020051	ACTGC	2	10	30509	30518	20 %	20 %	20 %	40 %	436735893
24	NC_020051	ATTTT	2	10	31691	31700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020051	ATTTT	2	10	31766	31775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020051	CGCAT	2	10	32274	32283	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020051	CTGAC	2	10	33798	33807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020051	GGAGC	2	10	34364	34373	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020051	ACAAA	2	10	34401	34410	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020051	GAATG	2	10	36403	36412	40 %	20 %	40 %	0 %	436735896
31	NC_020051	GCAGC	2	10	37785	37794	20 %	0 %	40 %	40 %	436735898
32	NC_020051	AAACT	2	10	38240	38249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020051	CAGTT	2	10	39505	39514	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020051	ACCAC	2	10	41438	41447	40 %	0 %	0 %	60 %	436735899
35	NC_020051	AAGGC	2	10	43471	43480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020051	TGCCA	2	10	46309	46318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020051	ATTAC	2	10	48339	48348	40 %	40 %	0 %	20 %	436735905
38	NC_020051	TCAAG	2	10	51319	51328	40 %	20 %	20 %	20 %	436735906
39	NC_020051	ACTGT	2	10	53740	53749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020051	TAAAA	2	10	53750	53759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020051	TGTAT	2	10	53962	53971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020051	AAAAC	2	10	54290	54299	80 %	0 %	0 %	20 %	436735908
43	NC_020051	CTTTA	2	10	55268	55277	20 %	60 %	0 %	20 %	436735908
44	NC_020051	AATTA	2	10	55984	55993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020051	TTTAT	2	10	56922	56931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020051	ATAAG	2	10	57349	57358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020051	CTTAG	2	10	59439	59448	20 %	40 %	20 %	20 %	436735912
48	NC_020051	TGCAA	2	10	60321	60330	40 %	20 %	20 %	20 %	436735913
49	NC_020051	CAAGA	2	10	62684	62693	60 %	0 %	20 %	20 %	436735915
50	NC_020051	GCAAT	2	10	68654	68663	40 %	20 %	20 %	20 %	436735920
51	NC_020051	TTGAT	2	10	72663	72672	20 %	60 %	20 %	0 %	436735923
52	NC_020051	ATGCC	2	10	74043	74052	20 %	20 %	20 %	40 %	436735924
53	NC_020051	CCCCA	2	10	75113	75122	20 %	0 %	0 %	80 %	436735926
54	NC_020051	TTGTG	2	10	79729	79738	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020051	AACAA	2	10	81652	81661	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020051	AATAA	2	10	82367	82376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020051	GAGAA	2	10	82498	82507	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020051	GAAGT	2	10	85465	85474	40 %	20 %	40 %	0 %	436735934
59	NC_020051	AGACA	2	10	86659	86668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020051	CTTGC	2	10	88037	88046	0 %	40 %	20 %	40 %	436735936
61	NC_020051	GTTGC	2	10	89419	89428	0 %	40 %	40 %	20 %	436735937
62	NC_020051	CAATC	2	10	89762	89771	40 %	20 %	0 %	40 %	436735937
63	NC_020051	TATTG	2	10	94356	94365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020051	GAAGG	2	10	96860	96869	40 %	0 %	60 %	0 %	436735948
65	NC_020051	TTGGA	2	10	97108	97117	20 %	40 %	40 %	0 %	436735948
66	NC_020051	TTTAG	2	10	97268	97277	20 %	60 %	20 %	0 %	436735948
67	NC_020051	ACTGA	2	10	98790	98799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020051	TGCTA	2	10	102342	102351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020051	AGTCA	2	10	102372	102381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020051	GAATG	2	10	102649	102658	40 %	20 %	40 %	0 %	436735955
71	NC_020051	GCAGA	2	10	103227	103236	40 %	0 %	40 %	20 %	436735956
72	NC_020051	CCAAT	2	10	104259	104268	40 %	20 %	0 %	40 %	436735957
73	NC_020051	ACTCA	2	10	104774	104783	40 %	20 %	0 %	40 %	436735958
74	NC_020051	TTTTG	2	10	105709	105718	0 %	80 %	20 %	0 %	436735960
75	NC_020051	GCGTG	2	10	106990	106999	0 %	20 %	60 %	20 %	436735961
76	NC_020051	AGGCG	2	10	107056	107065	20 %	0 %	60 %	20 %	436735961
77	NC_020051	ATAAA	2	10	107198	107207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020051	GCTAA	2	10	109691	109700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020051	CAAAC	2	10	109749	109758	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_020051	TCAAA	2	10	111267	111276	60 %	20 %	0 %	20 %	436735965
81	NC_020051	CTGCC	2	10	112005	112014	0 %	20 %	20 %	60 %	436735966
82	NC_020051	TTAAC	2	10	112445	112454	40 %	40 %	0 %	20 %	436735967
83	NC_020051	CCGCA	2	10	112676	112685	20 %	0 %	20 %	60 %	436735967
84	NC_020051	CAAAT	2	10	113320	113329	60 %	20 %	0 %	20 %	436735967
85	NC_020051	CAATG	2	10	121443	121452	40 %	20 %	20 %	20 %	436735973
86	NC_020051	AGTTG	2	10	125244	125253	20 %	40 %	40 %	0 %	436735975
87	NC_020051	CCAAG	2	10	129348	129357	40 %	0 %	20 %	40 %	436735976
88	NC_020051	TATGG	2	10	133429	133438	20 %	40 %	40 %	0 %	436735978
89	NC_020051	AGAGC	2	10	135335	135344	40 %	0 %	40 %	20 %	436735979
90	NC_020051	ACCCA	2	10	137808	137817	40 %	0 %	0 %	60 %	436735982
91	NC_020051	GGCAA	2	10	139791	139800	40 %	0 %	40 %	20 %	436735982
92	NC_020051	AAAAG	2	10	142985	142994	80 %	0 %	20 %	0 %	436735987
93	NC_020051	GAACC	2	10	145066	145075	40 %	0 %	20 %	40 %	436735990
94	NC_020051	ACCAC	2	10	146330	146339	40 %	0 %	0 %	60 %	436735990
95	NC_020051	TGCTG	2	10	149781	149790	0 %	40 %	40 %	20 %	436735994
96	NC_020051	GGAAT	2	10	151121	151130	40 %	20 %	40 %	0 %	436735994
97	NC_020051	GTTCA	2	10	151372	151381	20 %	40 %	20 %	20 %	436735994
98	NC_020051	GCTAA	2	10	151565	151574	40 %	20 %	20 %	20 %	436735994
99	NC_020051	CGGCA	2	10	154210	154219	20 %	0 %	40 %	40 %	436735997
100	NC_020051	AGTCC	2	10	155870	155879	20 %	20 %	20 %	40 %	436735998
101	NC_020051	GGTTT	2	10	157637	157646	0 %	60 %	40 %	0 %	436736000
102	NC_020051	GATTT	2	10	160748	160757	20 %	60 %	20 %	0 %	436736003
103	NC_020051	CTAAG	2	10	163486	163495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020051	ATTCA	2	10	164455	164464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020051	TGAAT	2	10	166992	167001	40 %	40 %	20 %	0 %	436736011
106	NC_020051	CTGCT	2	10	168041	168050	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_020051	GATTG	2	10	168358	168367	20 %	40 %	40 %	0 %	436736012
108	NC_020051	ATCGA	2	10	170920	170929	40 %	20 %	20 %	20 %	436736016
109	NC_020051	AGCTT	2	10	171486	171495	20 %	40 %	20 %	20 %	436736016
110	NC_020051	AATCG	2	10	172380	172389	40 %	20 %	20 %	20 %	436736018
111	NC_020051	CTTGG	2	10	173211	173220	0 %	40 %	40 %	20 %	436736021
112	NC_020051	GCACA	2	10	173852	173861	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_020051	CGAGC	2	10	174483	174492	20 %	0 %	40 %	40 %	436736022
114	NC_020051	GTCTA	2	10	175634	175643	20 %	40 %	20 %	20 %	436736023
115	NC_020051	TGGTT	2	10	175870	175879	0 %	60 %	40 %	0 %	436736023
116	NC_020051	TTGAT	2	10	176211	176220	20 %	60 %	20 %	0 %	436736024
117	NC_020051	AAGGC	2	10	176427	176436	40 %	0 %	40 %	20 %	436736024
118	NC_020051	GAGCA	2	10	176693	176702	40 %	0 %	40 %	20 %	436736024
119	NC_020051	ATTGC	2	10	176798	176807	20 %	40 %	20 %	20 %	436736024
120	NC_020051	AACCA	2	10	176981	176990	60 %	0 %	0 %	40 %	436736024
121	NC_020051	TGAAT	2	10	177352	177361	40 %	40 %	20 %	0 %	436736024
122	NC_020051	CAAGA	2	10	178636	178645	60 %	0 %	20 %	20 %	436736025
123	NC_020051	ACTTT	2	10	178718	178727	20 %	60 %	0 %	20 %	436736025
124	NC_020051	ACCCC	2	10	179388	179397	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_020051	ACCCC	2	10	179446	179455	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_020051	ACCCC	2	10	179469	179478	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_020051	CACCC	2	10	180683	180692	20 %	0 %	0 %	80 %	436736026
128	NC_020051	CAGTC	2	10	181093	181102	20 %	20 %	20 %	40 %	436736026
129	NC_020051	CGGCA	2	10	181259	181268	20 %	0 %	40 %	40 %	436736026
130	NC_020051	AAAGC	2	10	184048	184057	60 %	0 %	20 %	20 %	436736028
131	NC_020051	ACCAA	2	10	184998	185007	60 %	0 %	0 %	40 %	436736028
132	NC_020051	TGTAG	2	10	185652	185661	20 %	40 %	40 %	0 %	436736029
133	NC_020051	AGCGC	2	10	186099	186108	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_020051	TGGCG	2	10	187118	187127	0 %	20 %	60 %	20 %	436736030
135	NC_020051	TCCTT	2	10	190219	190228	0 %	60 %	0 %	40 %	436736031
136	NC_020051	TCGCC	2	10	190261	190270	0 %	20 %	20 %	60 %	436736031
137	NC_020051	CTGTG	2	10	193877	193886	0 %	40 %	40 %	20 %	436736035
138	NC_020051	TCCAG	2	10	195077	195086	20 %	20 %	20 %	40 %	436736036
139	NC_020051	TTTAG	2	10	200913	200922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020051	CAGAG	2	10	201490	201499	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.