MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	CTCTG	2	10	324	333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020051	CTAAA	2	10	901	910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020051	TTGTT	2	10	1427	1436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020051	TGACA	2	10	1554	1563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020051	GTTTT	2	10	3353	3362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020051	ATGCA	2	10	16591	16600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020051	ACCCA	2	10	21702	21711	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_020051	ACTCA	2	10	27098	27107	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020051	AGAAC	2	10	27828	27837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020051	TTTCC	2	10	30371	30380	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_020051	ATTTT	2	10	31691	31700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020051	ATTTT	2	10	31766	31775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020051	CGCAT	2	10	32274	32283	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020051	CTGAC	2	10	33798	33807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_020051	GGAGC	2	10	34364	34373	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020051	ACAAA	2	10	34401	34410	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020051	AAACT	2	10	38240	38249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020051	CAGTT	2	10	39505	39514	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020051	AAGGC	2	10	43471	43480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020051	TGCCA	2	10	46309	46318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_020051	ACTGT	2	10	53740	53749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020051	TAAAA	2	10	53750	53759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020051	TGTAT	2	10	53962	53971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020051	AATTA	2	10	55984	55993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020051	TTTAT	2	10	56922	56931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020051	ATAAG	2	10	57349	57358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020051	TTGTG	2	10	79729	79738	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020051	AACAA	2	10	81652	81661	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020051	AATAA	2	10	82367	82376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020051	GAGAA	2	10	82498	82507	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020051	AGACA	2	10	86659	86668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020051	TATTG	2	10	94356	94365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020051	ACTGA	2	10	98790	98799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020051	TGCTA	2	10	102342	102351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020051	AGTCA	2	10	102372	102381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020051	ATAAA	2	10	107198	107207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020051	GCTAA	2	10	109691	109700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020051	CAAAC	2	10	109749	109758	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_020051	CTAAG	2	10	163486	163495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020051	ATTCA	2	10	164455	164464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020051	CTGCT	2	10	168041	168050	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_020051	GCACA	2	10	173852	173861	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020051	ACCCC	2	10	179388	179397	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_020051	ACCCC	2	10	179446	179455	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_020051	ACCCC	2	10	179469	179478	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_020051	AGCGC	2	10	186099	186108	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020051	TTTAG	2	10	200913	200922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020051	CAGAG	2	10	201490	201499	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.