MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	CGACC	2	10	7180	7189	20 %	0 %	20 %	60 %	436735875
2	NC_020051	AGTTG	2	10	8444	8453	20 %	40 %	40 %	0 %	436735876
3	NC_020051	TTGAG	2	10	10397	10406	20 %	40 %	40 %	0 %	436735878
4	NC_020051	ACTGA	2	10	13024	13033	40 %	20 %	20 %	20 %	436735882
5	NC_020051	TGCTT	2	10	15293	15302	0 %	60 %	20 %	20 %	436735883
6	NC_020051	GTTCT	2	10	18037	18046	0 %	60 %	20 %	20 %	436735885
7	NC_020051	ATCTC	2	10	18261	18270	20 %	40 %	0 %	40 %	436735885
8	NC_020051	ATCCG	2	10	19345	19354	20 %	20 %	20 %	40 %	436735886
9	NC_020051	AATTG	2	10	23291	23300	40 %	40 %	20 %	0 %	436735890
10	NC_020051	GTAGC	2	10	24466	24475	20 %	20 %	40 %	20 %	436735890
11	NC_020051	TCAAA	2	10	25173	25182	60 %	20 %	0 %	20 %	436735890
12	NC_020051	GTTGA	2	10	28225	28234	20 %	40 %	40 %	0 %	436735891
13	NC_020051	ACTGC	2	10	30509	30518	20 %	20 %	20 %	40 %	436735893
14	NC_020051	GAATG	2	10	36403	36412	40 %	20 %	40 %	0 %	436735896
15	NC_020051	GCAGC	2	10	37785	37794	20 %	0 %	40 %	40 %	436735898
16	NC_020051	ACCAC	2	10	41438	41447	40 %	0 %	0 %	60 %	436735899
17	NC_020051	ATTAC	2	10	48339	48348	40 %	40 %	0 %	20 %	436735905
18	NC_020051	TCAAG	2	10	51319	51328	40 %	20 %	20 %	20 %	436735906
19	NC_020051	AAAAC	2	10	54290	54299	80 %	0 %	0 %	20 %	436735908
20	NC_020051	CTTTA	2	10	55268	55277	20 %	60 %	0 %	20 %	436735908
21	NC_020051	CTTAG	2	10	59439	59448	20 %	40 %	20 %	20 %	436735912
22	NC_020051	TGCAA	2	10	60321	60330	40 %	20 %	20 %	20 %	436735913
23	NC_020051	CAAGA	2	10	62684	62693	60 %	0 %	20 %	20 %	436735915
24	NC_020051	GCAAT	2	10	68654	68663	40 %	20 %	20 %	20 %	436735920
25	NC_020051	TTGAT	2	10	72663	72672	20 %	60 %	20 %	0 %	436735923
26	NC_020051	ATGCC	2	10	74043	74052	20 %	20 %	20 %	40 %	436735924
27	NC_020051	CCCCA	2	10	75113	75122	20 %	0 %	0 %	80 %	436735926
28	NC_020051	GAAGT	2	10	85465	85474	40 %	20 %	40 %	0 %	436735934
29	NC_020051	CTTGC	2	10	88037	88046	0 %	40 %	20 %	40 %	436735936
30	NC_020051	GTTGC	2	10	89419	89428	0 %	40 %	40 %	20 %	436735937
31	NC_020051	CAATC	2	10	89762	89771	40 %	20 %	0 %	40 %	436735937
32	NC_020051	GAAGG	2	10	96860	96869	40 %	0 %	60 %	0 %	436735948
33	NC_020051	TTGGA	2	10	97108	97117	20 %	40 %	40 %	0 %	436735948
34	NC_020051	TTTAG	2	10	97268	97277	20 %	60 %	20 %	0 %	436735948
35	NC_020051	GAATG	2	10	102649	102658	40 %	20 %	40 %	0 %	436735955
36	NC_020051	GCAGA	2	10	103227	103236	40 %	0 %	40 %	20 %	436735956
37	NC_020051	CCAAT	2	10	104259	104268	40 %	20 %	0 %	40 %	436735957
38	NC_020051	ACTCA	2	10	104774	104783	40 %	20 %	0 %	40 %	436735958
39	NC_020051	TTTTG	2	10	105709	105718	0 %	80 %	20 %	0 %	436735960
40	NC_020051	GCGTG	2	10	106990	106999	0 %	20 %	60 %	20 %	436735961
41	NC_020051	AGGCG	2	10	107056	107065	20 %	0 %	60 %	20 %	436735961
42	NC_020051	TCAAA	2	10	111267	111276	60 %	20 %	0 %	20 %	436735965
43	NC_020051	CTGCC	2	10	112005	112014	0 %	20 %	20 %	60 %	436735966
44	NC_020051	TTAAC	2	10	112445	112454	40 %	40 %	0 %	20 %	436735967
45	NC_020051	CCGCA	2	10	112676	112685	20 %	0 %	20 %	60 %	436735967
46	NC_020051	CAAAT	2	10	113320	113329	60 %	20 %	0 %	20 %	436735967
47	NC_020051	CAATG	2	10	121443	121452	40 %	20 %	20 %	20 %	436735973
48	NC_020051	AGTTG	2	10	125244	125253	20 %	40 %	40 %	0 %	436735975
49	NC_020051	CCAAG	2	10	129348	129357	40 %	0 %	20 %	40 %	436735976
50	NC_020051	TATGG	2	10	133429	133438	20 %	40 %	40 %	0 %	436735978
51	NC_020051	AGAGC	2	10	135335	135344	40 %	0 %	40 %	20 %	436735979
52	NC_020051	ACCCA	2	10	137808	137817	40 %	0 %	0 %	60 %	436735982
53	NC_020051	GGCAA	2	10	139791	139800	40 %	0 %	40 %	20 %	436735982
54	NC_020051	AAAAG	2	10	142985	142994	80 %	0 %	20 %	0 %	436735987
55	NC_020051	GAACC	2	10	145066	145075	40 %	0 %	20 %	40 %	436735990
56	NC_020051	ACCAC	2	10	146330	146339	40 %	0 %	0 %	60 %	436735990
57	NC_020051	TGCTG	2	10	149781	149790	0 %	40 %	40 %	20 %	436735994
58	NC_020051	GGAAT	2	10	151121	151130	40 %	20 %	40 %	0 %	436735994
59	NC_020051	GTTCA	2	10	151372	151381	20 %	40 %	20 %	20 %	436735994
60	NC_020051	GCTAA	2	10	151565	151574	40 %	20 %	20 %	20 %	436735994
61	NC_020051	CGGCA	2	10	154210	154219	20 %	0 %	40 %	40 %	436735997
62	NC_020051	AGTCC	2	10	155870	155879	20 %	20 %	20 %	40 %	436735998
63	NC_020051	GGTTT	2	10	157637	157646	0 %	60 %	40 %	0 %	436736000
64	NC_020051	GATTT	2	10	160748	160757	20 %	60 %	20 %	0 %	436736003
65	NC_020051	TGAAT	2	10	166992	167001	40 %	40 %	20 %	0 %	436736011
66	NC_020051	GATTG	2	10	168358	168367	20 %	40 %	40 %	0 %	436736012
67	NC_020051	ATCGA	2	10	170920	170929	40 %	20 %	20 %	20 %	436736016
68	NC_020051	AGCTT	2	10	171486	171495	20 %	40 %	20 %	20 %	436736016
69	NC_020051	AATCG	2	10	172380	172389	40 %	20 %	20 %	20 %	436736018
70	NC_020051	CTTGG	2	10	173211	173220	0 %	40 %	40 %	20 %	436736021
71	NC_020051	CGAGC	2	10	174483	174492	20 %	0 %	40 %	40 %	436736022
72	NC_020051	GTCTA	2	10	175634	175643	20 %	40 %	20 %	20 %	436736023
73	NC_020051	TGGTT	2	10	175870	175879	0 %	60 %	40 %	0 %	436736023
74	NC_020051	TTGAT	2	10	176211	176220	20 %	60 %	20 %	0 %	436736024
75	NC_020051	AAGGC	2	10	176427	176436	40 %	0 %	40 %	20 %	436736024
76	NC_020051	GAGCA	2	10	176693	176702	40 %	0 %	40 %	20 %	436736024
77	NC_020051	ATTGC	2	10	176798	176807	20 %	40 %	20 %	20 %	436736024
78	NC_020051	AACCA	2	10	176981	176990	60 %	0 %	0 %	40 %	436736024
79	NC_020051	TGAAT	2	10	177352	177361	40 %	40 %	20 %	0 %	436736024
80	NC_020051	CAAGA	2	10	178636	178645	60 %	0 %	20 %	20 %	436736025
81	NC_020051	ACTTT	2	10	178718	178727	20 %	60 %	0 %	20 %	436736025
82	NC_020051	CACCC	2	10	180683	180692	20 %	0 %	0 %	80 %	436736026
83	NC_020051	CAGTC	2	10	181093	181102	20 %	20 %	20 %	40 %	436736026
84	NC_020051	CGGCA	2	10	181259	181268	20 %	0 %	40 %	40 %	436736026
85	NC_020051	AAAGC	2	10	184048	184057	60 %	0 %	20 %	20 %	436736028
86	NC_020051	ACCAA	2	10	184998	185007	60 %	0 %	0 %	40 %	436736028
87	NC_020051	TGTAG	2	10	185652	185661	20 %	40 %	40 %	0 %	436736029
88	NC_020051	TGGCG	2	10	187118	187127	0 %	20 %	60 %	20 %	436736030
89	NC_020051	TCCTT	2	10	190219	190228	0 %	60 %	0 %	40 %	436736031
90	NC_020051	TCGCC	2	10	190261	190270	0 %	20 %	20 %	60 %	436736031
91	NC_020051	CTGTG	2	10	193877	193886	0 %	40 %	40 %	20 %	436736035
92	NC_020051	TCCAG	2	10	195077	195086	20 %	20 %	20 %	40 %	436736036

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.