MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	TGCC	2	8	536	543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020051	CTTA	2	8	718	725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020051	CCTG	2	8	862	869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020051	ATTG	2	8	1055	1062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020051	TGAC	2	8	1142	1149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020051	TCTA	2	8	2747	2754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020051	GCCT	2	8	3155	3162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020051	ATCG	2	8	3417	3424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020051	ATCG	2	8	3800	3807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020051	ACAA	2	8	3837	3844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020051	AGGT	2	8	4258	4265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020051	CTCC	2	8	4655	4662	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020051	TTGA	2	8	11014	11021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020051	CTTG	2	8	11118	11125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020051	TTTG	2	8	11204	11211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020051	TTCT	2	8	11777	11784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020051	AACA	2	8	11846	11853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020051	GCTC	2	8	16863	16870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020051	GGTT	2	8	17060	17067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020051	TCAA	2	8	17239	17246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020051	TGCT	2	8	17325	17332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020051	TAAT	2	8	17553	17560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020051	CTGT	2	8	17739	17746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020051	AAAC	2	8	25814	25821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020051	AATC	2	8	26501	26508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020051	AATT	2	8	26556	26563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020051	ATTA	2	8	34726	34733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020051	GTTA	2	8	34862	34869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020051	AGCG	2	8	34907	34914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020051	TGCC	2	8	35369	35376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020051	CAAT	2	8	35530	35537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020051	CACT	2	8	35935	35942	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020051	CACT	2	8	35956	35963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020051	AGTC	2	8	37664	37671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020051	AACT	2	8	38457	38464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020051	AAAT	2	8	38855	38862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020051	TGAA	2	8	39026	39033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020051	TTGA	2	8	39570	39577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020051	ATCA	2	8	39665	39672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020051	TTGG	2	8	39681	39688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020051	AGTT	2	8	39750	39757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020051	TTTC	2	8	39805	39812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020051	CAAC	2	8	40000	40007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020051	TAGT	2	8	40145	40152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020051	TTAC	2	8	41916	41923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020051	TTAC	2	8	41987	41994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020051	ATTG	2	8	43175	43182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020051	CAAT	2	8	43396	43403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020051	AATA	2	8	53613	53620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020051	AGCT	2	8	53780	53787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020051	TATT	2	8	53925	53932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020051	GTAG	2	8	53937	53944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020051	ACTA	2	8	55957	55964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020051	AAAT	2	8	56001	56008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020051	CTTT	2	8	57323	57330	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020051	GAAT	2	8	57435	57442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020051	TTTA	2	8	57452	57459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020051	ATCT	2	8	58955	58962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020051	TATG	2	8	65301	65308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020051	ATTA	2	8	65392	65399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020051	CTTG	2	8	68077	68084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020051	CTAG	2	8	80465	80472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020051	AAGT	2	8	81252	81259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020051	AGCT	2	8	81359	81366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020051	ACTA	2	8	82702	82709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020051	ATGG	2	8	83367	83374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020051	TTTG	2	8	83966	83973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020051	ATTG	2	8	86539	86546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020051	GCTT	2	8	86983	86990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020051	ACAA	2	8	87141	87148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020051	GAAT	2	8	91802	91809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020051	CCAT	2	8	94421	94428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020051	TTAA	2	8	95028	95035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020051	GAAA	2	8	95059	95066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020051	GGGC	2	8	97830	97837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020051	TTGA	2	8	98010	98017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020051	ATTC	2	8	102295	102302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020051	TCAA	2	8	102308	102315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020051	AAGC	2	8	103991	103998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020051	TAGG	2	8	104825	104832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020051	ATTG	2	8	105357	105364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020051	AGCC	2	8	106105	106112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020051	TCTT	2	8	107255	107262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020051	TAGC	2	8	107746	107753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020051	CAAC	2	8	111648	111655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020051	GAAT	2	8	117708	117715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020051	AGAA	2	8	123748	123755	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020051	AAAG	2	8	123797	123804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020051	GGCT	2	8	123832	123839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020051	AATA	2	8	126236	126243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020051	AGCA	2	8	126295	126302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020051	GAAA	2	8	130137	130144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020051	TTAG	2	8	136909	136916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020051	CTTA	3	12	140390	140401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020051	TTCG	2	8	140463	140470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020051	AAAG	2	8	141083	141090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020051	TGCT	2	8	141663	141670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020051	AGCT	2	8	141730	141737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020051	ATAG	2	8	144304	144311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020051	ATTT	2	8	148049	148056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020051	ATGA	2	8	148178	148185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020051	CTTA	2	8	148186	148193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020051	TAAA	2	8	152296	152303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020051	TTAA	2	8	152452	152459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020051	AATC	2	8	156753	156760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020051	TGAA	2	8	158907	158914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020051	ACCT	2	8	160815	160822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020051	AATA	2	8	161695	161702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020051	TTTA	2	8	166607	166614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020051	TAAT	2	8	167921	167928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020051	TACT	2	8	168138	168145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020051	TAAC	2	8	173444	173451	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020051	TTCG	2	8	173637	173644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020051	TTCG	2	8	173672	173679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020051	CGCA	2	8	173828	173835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020051	AATT	2	8	173930	173937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020051	GGTT	2	8	174018	174025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020051	GATA	2	8	174727	174734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020051	CTTT	2	8	175430	175437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020051	GATC	2	8	175992	175999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020051	CAAG	2	8	177593	177600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020051	TCGC	2	8	179522	179529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020051	GAAA	2	8	188887	188894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020051	TGAG	2	8	189585	189592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020051	CCAG	2	8	189698	189705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020051	ATTG	2	8	190026	190033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020051	ACAA	2	8	191440	191447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020051	GCCT	2	8	191534	191541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020051	ATTT	2	8	197130	197137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020051	ACTC	2	8	198402	198409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020051	GTTA	2	8	198557	198564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020051	GGCA	2	8	198652	198659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020051	AGTC	2	8	200673	200680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020051	CAAT	2	8	200761	200768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020051	GCAG	2	8	200953	200960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020051	TAAG	2	8	201098	201105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020051	GGCA	2	8	201280	201287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020051	CCAA	2	8	201475	201482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.