MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	TA	3	6	53	58	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020051	CA	3	6	1085	1090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020051	AC	3	6	1251	1256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020051	CG	4	8	1371	1378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020051	CT	4	8	2257	2264	0 %	50 %	0 %	50 %	436735874
6	NC_020051	GA	3	6	2300	2305	50 %	0 %	50 %	0 %	436735874
7	NC_020051	TA	3	6	4078	4083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020051	AC	3	6	4175	4180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020051	GC	3	6	4608	4613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020051	CT	3	6	7038	7043	0 %	50 %	0 %	50 %	436735875
11	NC_020051	TC	3	6	7260	7265	0 %	50 %	0 %	50 %	436735875
12	NC_020051	CG	3	6	8717	8722	0 %	0 %	50 %	50 %	436735876
13	NC_020051	TC	3	6	9082	9087	0 %	50 %	0 %	50 %	436735876
14	NC_020051	CA	3	6	9515	9520	50 %	0 %	0 %	50 %	436735877
15	NC_020051	AG	3	6	9629	9634	50 %	0 %	50 %	0 %	436735877
16	NC_020051	AC	3	6	11331	11336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020051	GA	3	6	11597	11602	50 %	0 %	50 %	0 %	436735879
18	NC_020051	CT	3	6	11796	11801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020051	CA	3	6	11953	11958	50 %	0 %	0 %	50 %	436735880
20	NC_020051	CT	3	6	14401	14406	0 %	50 %	0 %	50 %	436735882
21	NC_020051	AG	3	6	15549	15554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020051	GT	5	10	15772	15781	0 %	50 %	50 %	0 %	436735884
23	NC_020051	GA	3	6	16900	16905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020051	TC	3	6	17090	17095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020051	AG	3	6	18495	18500	50 %	0 %	50 %	0 %	436735885
26	NC_020051	TC	3	6	19376	19381	0 %	50 %	0 %	50 %	436735886
27	NC_020051	GA	3	6	22841	22846	50 %	0 %	50 %	0 %	436735890
28	NC_020051	GA	3	6	23017	23022	50 %	0 %	50 %	0 %	436735890
29	NC_020051	AG	3	6	24286	24291	50 %	0 %	50 %	0 %	436735890
30	NC_020051	TC	3	6	24378	24383	0 %	50 %	0 %	50 %	436735890
31	NC_020051	TA	3	6	24675	24680	50 %	50 %	0 %	0 %	436735890
32	NC_020051	TG	3	6	28030	28035	0 %	50 %	50 %	0 %	436735891
33	NC_020051	TG	3	6	28045	28050	0 %	50 %	50 %	0 %	436735891
34	NC_020051	CT	4	8	29281	29288	0 %	50 %	0 %	50 %	436735892
35	NC_020051	CG	3	6	30680	30685	0 %	0 %	50 %	50 %	436735893
36	NC_020051	GT	3	6	30956	30961	0 %	50 %	50 %	0 %	436735893
37	NC_020051	TC	3	6	35103	35108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020051	TA	4	8	36308	36315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020051	TC	3	6	38143	38148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020051	CT	3	6	38747	38752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020051	TG	3	6	39457	39462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020051	CA	3	6	40192	40197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020051	GT	3	6	40705	40710	0 %	50 %	50 %	0 %	436735899
44	NC_020051	AT	3	6	40800	40805	50 %	50 %	0 %	0 %	436735899
45	NC_020051	AT	3	6	41040	41045	50 %	50 %	0 %	0 %	436735899
46	NC_020051	TA	3	6	41170	41175	50 %	50 %	0 %	0 %	436735899
47	NC_020051	GA	3	6	41330	41335	50 %	0 %	50 %	0 %	436735899
48	NC_020051	AT	3	6	42276	42281	50 %	50 %	0 %	0 %	436735900
49	NC_020051	AG	3	6	42841	42846	50 %	0 %	50 %	0 %	436735901
50	NC_020051	AG	3	6	44226	44231	50 %	0 %	50 %	0 %	436735902
51	NC_020051	TA	3	6	45142	45147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020051	TG	3	6	45294	45299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020051	GA	3	6	45363	45368	50 %	0 %	50 %	0 %	436735903
54	NC_020051	AG	3	6	45811	45816	50 %	0 %	50 %	0 %	436735903
55	NC_020051	TA	3	6	47649	47654	50 %	50 %	0 %	0 %	436735904
56	NC_020051	TG	3	6	49621	49626	0 %	50 %	50 %	0 %	436735905
57	NC_020051	CT	3	6	50877	50882	0 %	50 %	0 %	50 %	436735905
58	NC_020051	TC	3	6	51755	51760	0 %	50 %	0 %	50 %	436735906
59	NC_020051	TA	3	6	51967	51972	50 %	50 %	0 %	0 %	436735907
60	NC_020051	TA	3	6	53569	53574	50 %	50 %	0 %	0 %	436735907
61	NC_020051	AT	3	6	53647	53652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020051	AT	3	6	53915	53920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020051	CG	4	8	54906	54913	0 %	0 %	50 %	50 %	436735908
64	NC_020051	AT	3	6	56239	56244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020051	AT	3	6	57205	57210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020051	TA	3	6	57579	57584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020051	TC	3	6	57641	57646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020051	TA	3	6	57711	57716	50 %	50 %	0 %	0 %	436735910
69	NC_020051	AG	3	6	58378	58383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020051	GT	3	6	58758	58763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020051	GA	3	6	60098	60103	50 %	0 %	50 %	0 %	436735913
72	NC_020051	AT	3	6	60192	60197	50 %	50 %	0 %	0 %	436735913
73	NC_020051	AC	3	6	60955	60960	50 %	0 %	0 %	50 %	436735913
74	NC_020051	GC	3	6	62982	62987	0 %	0 %	50 %	50 %	436735915
75	NC_020051	CG	5	10	63611	63620	0 %	0 %	50 %	50 %	436735916
76	NC_020051	TC	3	6	66304	66309	0 %	50 %	0 %	50 %	436735918
77	NC_020051	AT	3	6	68318	68323	50 %	50 %	0 %	0 %	436735920
78	NC_020051	GT	3	6	70243	70248	0 %	50 %	50 %	0 %	436735921
79	NC_020051	GT	3	6	70870	70875	0 %	50 %	50 %	0 %	436735921
80	NC_020051	GT	3	6	71003	71008	0 %	50 %	50 %	0 %	436735921
81	NC_020051	AT	3	6	71538	71543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020051	AT	3	6	71546	71551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020051	AT	3	6	71556	71561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020051	GT	3	6	72365	72370	0 %	50 %	50 %	0 %	436735923
85	NC_020051	CT	3	6	76005	76010	0 %	50 %	0 %	50 %	436735926
86	NC_020051	CT	3	6	77641	77646	0 %	50 %	0 %	50 %	436735926
87	NC_020051	CT	3	6	77856	77861	0 %	50 %	0 %	50 %	436735926
88	NC_020051	CA	3	6	79193	79198	50 %	0 %	0 %	50 %	436735928
89	NC_020051	TC	3	6	80189	80194	0 %	50 %	0 %	50 %	436735929
90	NC_020051	GA	4	8	80496	80503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020051	TG	3	6	80580	80585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020051	GA	3	6	80915	80920	50 %	0 %	50 %	0 %	436735930
93	NC_020051	GA	3	6	81345	81350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020051	CT	3	6	81665	81670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020051	AT	4	8	83040	83047	50 %	50 %	0 %	0 %	436735932
96	NC_020051	TG	3	6	83356	83361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020051	AG	3	6	83683	83688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020051	CT	3	6	84011	84016	0 %	50 %	0 %	50 %	436735933
99	NC_020051	TC	4	8	84886	84893	0 %	50 %	0 %	50 %	436735934
100	NC_020051	GA	3	6	85266	85271	50 %	0 %	50 %	0 %	436735934
101	NC_020051	AG	3	6	85857	85862	50 %	0 %	50 %	0 %	436735935
102	NC_020051	AT	3	6	87416	87421	50 %	50 %	0 %	0 %	436735936
103	NC_020051	TA	3	6	88490	88495	50 %	50 %	0 %	0 %	436735936
104	NC_020051	AG	3	6	89534	89539	50 %	0 %	50 %	0 %	436735937
105	NC_020051	AC	3	6	91598	91603	50 %	0 %	0 %	50 %	436735938
106	NC_020051	TC	3	6	91932	91937	0 %	50 %	0 %	50 %	436735939
107	NC_020051	TC	3	6	92572	92577	0 %	50 %	0 %	50 %	436735942
108	NC_020051	TG	3	6	93675	93680	0 %	50 %	50 %	0 %	436735943
109	NC_020051	CA	3	6	95509	95514	50 %	0 %	0 %	50 %	436735947
110	NC_020051	TA	4	8	96600	96607	50 %	50 %	0 %	0 %	436735948
111	NC_020051	CT	3	6	97244	97249	0 %	50 %	0 %	50 %	436735948
112	NC_020051	GA	3	6	97687	97692	50 %	0 %	50 %	0 %	436735949
113	NC_020051	TG	3	6	98061	98066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020051	CT	3	6	98676	98681	0 %	50 %	0 %	50 %	436735950
115	NC_020051	CT	3	6	99147	99152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020051	TC	3	6	99381	99386	0 %	50 %	0 %	50 %	436735951
117	NC_020051	GA	3	6	100343	100348	50 %	0 %	50 %	0 %	436735952
118	NC_020051	TC	3	6	101343	101348	0 %	50 %	0 %	50 %	436735953
119	NC_020051	TA	3	6	101655	101660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020051	TG	3	6	101662	101667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020051	TC	3	6	103371	103376	0 %	50 %	0 %	50 %	436735956
122	NC_020051	AT	3	6	103527	103532	50 %	50 %	0 %	0 %	436735956
123	NC_020051	CA	3	6	105091	105096	50 %	0 %	0 %	50 %	436735959
124	NC_020051	GC	3	6	105735	105740	0 %	0 %	50 %	50 %	436735960
125	NC_020051	TC	4	8	106676	106683	0 %	50 %	0 %	50 %	436735961
126	NC_020051	CG	3	6	107918	107923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020051	GC	3	6	109069	109074	0 %	0 %	50 %	50 %	436735963
128	NC_020051	AG	3	6	111660	111665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020051	CT	3	6	111686	111691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020051	TC	3	6	113929	113934	0 %	50 %	0 %	50 %	436735967
131	NC_020051	TC	3	6	114197	114202	0 %	50 %	0 %	50 %	436735967
132	NC_020051	GT	3	6	114560	114565	0 %	50 %	50 %	0 %	436735968
133	NC_020051	TC	3	6	115605	115610	0 %	50 %	0 %	50 %	436735969
134	NC_020051	AG	3	6	117863	117868	50 %	0 %	50 %	0 %	436735971
135	NC_020051	TC	3	6	118739	118744	0 %	50 %	0 %	50 %	436735971
136	NC_020051	TG	3	6	118995	119000	0 %	50 %	50 %	0 %	436735972
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.