MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	CAAC	2	8	47	54	50 %	0 %	0 %	50 %	436669980
2	NC_020050	AGGA	2	8	174	181	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
3	NC_020050	GCCG	2	8	761	768	0 %	0 %	50 %	50 %	436669980
4	NC_020050	GATG	2	8	949	956	25 %	25 %	50 %	0 %	436669980
5	NC_020050	TGCT	2	8	978	985	0 %	50 %	25 %	25 %	436669980
6	NC_020050	ATCG	2	8	1316	1323	25 %	25 %	25 %	25 %	436669980
7	NC_020050	ACAG	2	8	1370	1377	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
8	NC_020050	ACGA	2	8	2637	2644	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
9	NC_020050	CCAG	2	8	4307	4314	25 %	0 %	25 %	50 %	436669982
10	NC_020050	CATC	2	8	4335	4342	25 %	25 %	0 %	50 %	436669982
11	NC_020050	TAAT	2	8	7974	7981	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
12	NC_020050	ATTT	2	8	8197	8204	25 %	75 %	0 %	0 %	436669983
13	NC_020050	ATCT	2	8	8295	8302	25 %	50 %	0 %	25 %	436669983
14	NC_020050	ACTT	2	8	8370	8377	25 %	50 %	0 %	25 %	436669983
15	NC_020050	AGGT	2	8	9011	9018	25 %	25 %	50 %	0 %	436669984
16	NC_020050	CTCA	2	8	9593	9600	25 %	25 %	0 %	50 %	436669984
17	NC_020050	TAAT	2	8	10599	10606	50 %	50 %	0 %	0 %	436669986
18	NC_020050	TCGC	2	8	10717	10724	0 %	25 %	25 %	50 %	436669986
19	NC_020050	GTTT	2	8	11062	11069	0 %	75 %	25 %	0 %	436669986
20	NC_020050	CTTG	2	8	11142	11149	0 %	50 %	25 %	25 %	436669986
21	NC_020050	GGGA	2	8	11691	11698	25 %	0 %	75 %	0 %	436669986
22	NC_020050	AGGT	2	8	13518	13525	25 %	25 %	50 %	0 %	436669990
23	NC_020050	CTTG	2	8	13599	13606	0 %	50 %	25 %	25 %	436669990
24	NC_020050	TGGG	2	8	13846	13853	0 %	25 %	75 %	0 %	436669990
25	NC_020050	GTCT	2	8	13999	14006	0 %	50 %	25 %	25 %	436669990
26	NC_020050	GATG	2	8	14510	14517	25 %	25 %	50 %	0 %	436669990
27	NC_020050	AGGA	2	8	15267	15274	50 %	0 %	50 %	0 %	436669990
28	NC_020050	GCGG	2	8	18626	18633	0 %	0 %	75 %	25 %	436669992
29	NC_020050	GAAG	2	8	18680	18687	50 %	0 %	50 %	0 %	436669992
30	NC_020050	TGGC	2	8	19636	19643	0 %	25 %	50 %	25 %	436669993
31	NC_020050	AATA	2	8	19896	19903	75 %	25 %	0 %	0 %	436669993
32	NC_020050	CCAC	2	8	20534	20541	25 %	0 %	0 %	75 %	436669993
33	NC_020050	TGAT	2	8	20823	20830	25 %	50 %	25 %	0 %	436669994
34	NC_020050	GGCA	2	8	21127	21134	25 %	0 %	50 %	25 %	436669994
35	NC_020050	CAAG	2	8	21781	21788	50 %	0 %	25 %	25 %	436669995
36	NC_020050	GGTA	2	8	22645	22652	25 %	25 %	50 %	0 %	436669996
37	NC_020050	TCAA	2	8	22848	22855	50 %	25 %	0 %	25 %	436669996
38	NC_020050	TAAA	2	8	24561	24568	75 %	25 %	0 %	0 %	436669999
39	NC_020050	GAAG	2	8	24740	24747	50 %	0 %	50 %	0 %	436669999
40	NC_020050	TTAA	2	8	25214	25221	50 %	50 %	0 %	0 %	436669999
41	NC_020050	TCTT	2	8	25469	25476	0 %	75 %	0 %	25 %	436670000
42	NC_020050	CGGA	2	8	26613	26620	25 %	0 %	50 %	25 %	436670000
43	NC_020050	TAAT	2	8	26769	26776	50 %	50 %	0 %	0 %	436670000
44	NC_020050	ATTT	2	8	27121	27128	25 %	75 %	0 %	0 %	436670001
45	NC_020050	AAAG	2	8	27463	27470	75 %	0 %	25 %	0 %	436670001
46	NC_020050	ATAA	2	8	27506	27513	75 %	25 %	0 %	0 %	436670001
47	NC_020050	TTGG	2	8	27517	27524	0 %	50 %	50 %	0 %	436670001
48	NC_020050	TGTT	2	8	28638	28645	0 %	75 %	25 %	0 %	436670001
49	NC_020050	AATC	2	8	29191	29198	50 %	25 %	0 %	25 %	436670001
50	NC_020050	AAAT	2	8	29261	29268	75 %	25 %	0 %	0 %	436670001
51	NC_020050	AATT	2	8	30768	30775	50 %	50 %	0 %	0 %	436670002
52	NC_020050	ATTG	2	8	30882	30889	25 %	50 %	25 %	0 %	436670002
53	NC_020050	AATT	2	8	31070	31077	50 %	50 %	0 %	0 %	436670002
54	NC_020050	GCAA	2	8	31412	31419	50 %	0 %	25 %	25 %	436670003
55	NC_020050	AATA	2	8	31712	31719	75 %	25 %	0 %	0 %	436670003
56	NC_020050	CTCG	2	8	31768	31775	0 %	25 %	25 %	50 %	436670003
57	NC_020050	GAAA	2	8	33098	33105	75 %	0 %	25 %	0 %	436670004
58	NC_020050	TATT	2	8	33425	33432	25 %	75 %	0 %	0 %	436670004
59	NC_020050	ATGT	2	8	33869	33876	25 %	50 %	25 %	0 %	436670005
60	NC_020050	CCAC	2	8	34290	34297	25 %	0 %	0 %	75 %	436670006
61	NC_020050	CACC	2	8	35481	35488	25 %	0 %	0 %	75 %	436670007
62	NC_020050	ATTT	2	8	35730	35737	25 %	75 %	0 %	0 %	436670008
63	NC_020050	TACA	2	8	35755	35762	50 %	25 %	0 %	25 %	436670008
64	NC_020050	TATT	2	8	36541	36548	25 %	75 %	0 %	0 %	436670010
65	NC_020050	ACAA	2	8	36626	36633	75 %	0 %	0 %	25 %	436670010
66	NC_020050	TCAA	2	8	36887	36894	50 %	25 %	0 %	25 %	436670010
67	NC_020050	GCTT	2	8	37041	37048	0 %	50 %	25 %	25 %	436670010
68	NC_020050	TTAA	2	8	37248	37255	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
69	NC_020050	AGTA	2	8	37613	37620	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
70	NC_020050	AAAG	2	8	37628	37635	75 %	0 %	25 %	0 %	436670010
71	NC_020050	AATG	2	8	37676	37683	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
72	NC_020050	ATTT	2	8	38105	38112	25 %	75 %	0 %	0 %	436670010
73	NC_020050	AATT	2	8	38329	38336	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
74	NC_020050	GGAA	2	8	38563	38570	50 %	0 %	50 %	0 %	436670010
75	NC_020050	TCAA	2	8	38659	38666	50 %	25 %	0 %	25 %	436670010
76	NC_020050	ATGT	2	8	39264	39271	25 %	50 %	25 %	0 %	436670010
77	NC_020050	CAAG	2	8	39333	39340	50 %	0 %	25 %	25 %	436670010
78	NC_020050	AATG	2	8	39378	39385	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
79	NC_020050	AATT	2	8	39667	39674	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
80	NC_020050	TCTA	2	8	40094	40101	25 %	50 %	0 %	25 %	436670010
81	NC_020050	TGAT	2	8	40216	40223	25 %	50 %	25 %	0 %	436670010
82	NC_020050	ATTT	2	8	40875	40882	25 %	75 %	0 %	0 %	436670011
83	NC_020050	GTTT	2	8	40995	41002	0 %	75 %	25 %	0 %	436670011
84	NC_020050	GAAT	2	8	41088	41095	50 %	25 %	25 %	0 %	436670011
85	NC_020050	ATTA	2	8	41830	41837	50 %	50 %	0 %	0 %	436670011
86	NC_020050	GAAA	2	8	42163	42170	75 %	0 %	25 %	0 %	436670011
87	NC_020050	ATTG	2	8	42694	42701	25 %	50 %	25 %	0 %	436670011
88	NC_020050	CAAA	2	8	43426	43433	75 %	0 %	0 %	25 %	436670011
89	NC_020050	TATC	2	8	44692	44699	25 %	50 %	0 %	25 %	436670011
90	NC_020050	GTTT	2	8	45083	45090	0 %	75 %	25 %	0 %	436670011
91	NC_020050	TGGT	2	8	45311	45318	0 %	50 %	50 %	0 %	436670011
92	NC_020050	CTTT	2	8	46623	46630	0 %	75 %	0 %	25 %	436670011
93	NC_020050	CCGC	2	8	47213	47220	0 %	0 %	25 %	75 %	436670012
94	NC_020050	GTTG	2	8	48787	48794	0 %	50 %	50 %	0 %	436670016
95	NC_020050	TTAA	2	8	49392	49399	50 %	50 %	0 %	0 %	436670016
96	NC_020050	AGCT	2	8	49418	49425	25 %	25 %	25 %	25 %	436670016
97	NC_020050	ATAG	2	8	50021	50028	50 %	25 %	25 %	0 %	436670018
98	NC_020050	ACCA	2	8	54623	54630	50 %	0 %	0 %	50 %	436670021
99	NC_020050	GGTT	2	8	55192	55199	0 %	50 %	50 %	0 %	436670021
100	NC_020050	GCTG	2	8	55307	55314	0 %	25 %	50 %	25 %	436670021
101	NC_020050	AAGT	2	8	56385	56392	50 %	25 %	25 %	0 %	436670021
102	NC_020050	CCTA	2	8	56625	56632	25 %	25 %	0 %	50 %	436670022
103	NC_020050	GCAA	2	8	57363	57370	50 %	0 %	25 %	25 %	436670023
104	NC_020050	AAAT	2	8	57417	57424	75 %	25 %	0 %	0 %	436670023
105	NC_020050	AAAT	2	8	57532	57539	75 %	25 %	0 %	0 %	436670023
106	NC_020050	CTTC	2	8	57584	57591	0 %	50 %	0 %	50 %	436670023
107	NC_020050	TTTA	2	8	58000	58007	25 %	75 %	0 %	0 %	436670023
108	NC_020050	CTAT	2	8	58138	58145	25 %	50 %	0 %	25 %	436670023
109	NC_020050	AGTT	2	8	58239	58246	25 %	50 %	25 %	0 %	436670023
110	NC_020050	TGCT	2	8	58868	58875	0 %	50 %	25 %	25 %	436670024
111	NC_020050	TTGG	2	8	58941	58948	0 %	50 %	50 %	0 %	436670024
112	NC_020050	GCAG	2	8	58994	59001	25 %	0 %	50 %	25 %	436670024
113	NC_020050	AACT	2	8	59866	59873	50 %	25 %	0 %	25 %	436670024
114	NC_020050	CGGT	2	8	60299	60306	0 %	25 %	50 %	25 %	436670024
115	NC_020050	TGGG	2	8	60936	60943	0 %	25 %	75 %	0 %	436670024
116	NC_020050	CCAA	2	8	61405	61412	50 %	0 %	0 %	50 %	436670024
117	NC_020050	TAAA	2	8	61531	61538	75 %	25 %	0 %	0 %	436670024
118	NC_020050	ACTG	2	8	62144	62151	25 %	25 %	25 %	25 %	436670024
119	NC_020050	GTCA	2	8	62173	62180	25 %	25 %	25 %	25 %	436670024
120	NC_020050	GCAA	2	8	63150	63157	50 %	0 %	25 %	25 %	436670024
121	NC_020050	ATTC	2	8	63166	63173	25 %	50 %	0 %	25 %	436670024
122	NC_020050	AAGC	2	8	64339	64346	50 %	0 %	25 %	25 %	436670024
123	NC_020050	GAAC	2	8	64728	64735	50 %	0 %	25 %	25 %	436670024
124	NC_020050	ACTC	2	8	65004	65011	25 %	25 %	0 %	50 %	436670024
125	NC_020050	GTTT	2	8	65052	65059	0 %	75 %	25 %	0 %	436670024
126	NC_020050	CAAA	2	8	65605	65612	75 %	0 %	0 %	25 %	436670024
127	NC_020050	AGAA	2	8	65815	65822	75 %	0 %	25 %	0 %	436670024
128	NC_020050	TGGA	2	8	66270	66277	25 %	25 %	50 %	0 %	436670024
129	NC_020050	ACAG	2	8	68364	68371	50 %	0 %	25 %	25 %	436670025
130	NC_020050	CAGC	2	8	68380	68387	25 %	0 %	25 %	50 %	436670025
131	NC_020050	TTTG	2	8	68388	68395	0 %	75 %	25 %	0 %	436670025
132	NC_020050	TGCT	2	8	68576	68583	0 %	50 %	25 %	25 %	436670025
133	NC_020050	TTAC	2	8	69327	69334	25 %	50 %	0 %	25 %	436670025
134	NC_020050	ACTG	2	8	69750	69757	25 %	25 %	25 %	25 %	436670025
135	NC_020050	AATG	2	8	69910	69917	50 %	25 %	25 %	0 %	436670025
136	NC_020050	AATT	2	8	70145	70152	50 %	50 %	0 %	0 %	436670025
137	NC_020050	CATT	2	8	71050	71057	25 %	50 %	0 %	25 %	436670025
138	NC_020050	CCAA	2	8	73139	73146	50 %	0 %	0 %	50 %	436670026
139	NC_020050	ACTC	2	8	73342	73349	25 %	25 %	0 %	50 %	436670026
140	NC_020050	GTTT	2	8	73390	73397	0 %	75 %	25 %	0 %	436670026
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