MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 5604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669980
2	NC_020050	TCA	2	6	249	254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
3	NC_020050	GCT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
4	NC_020050	TGA	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
5	NC_020050	GTT	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669980
6	NC_020050	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
7	NC_020050	GAA	2	6	605	610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
8	NC_020050	CGC	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
9	NC_020050	TCG	2	6	637	642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
10	NC_020050	GTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
11	NC_020050	GAG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
12	NC_020050	GAA	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
13	NC_020050	AAG	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
14	NC_020050	CCA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669980
15	NC_020050	CGT	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
16	NC_020050	CAG	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
17	NC_020050	TAG	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
18	NC_020050	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
19	NC_020050	AGA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
20	NC_020050	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
21	NC_020050	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
22	NC_020050	AGA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
23	NC_020050	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
24	NC_020050	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
25	NC_020050	AGG	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
26	NC_020050	GAA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
27	NC_020050	CGC	2	6	2084	2089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
28	NC_020050	CTG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
29	NC_020050	GAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
30	NC_020050	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
31	NC_020050	AAT	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669980
32	NC_020050	TTC	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669980
33	NC_020050	CGA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
34	NC_020050	TGA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
35	NC_020050	CTG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
36	NC_020050	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
37	NC_020050	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669981
38	NC_020050	TAG	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
39	NC_020050	TGG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669981
40	NC_020050	TTG	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669981
41	NC_020050	TGC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
42	NC_020050	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669981
43	NC_020050	TAT	2	6	3196	3201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
44	NC_020050	GAT	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
45	NC_020050	AAG	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669981
46	NC_020050	ATT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020050	TCA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020050	AAG	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020050	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020050	GGA	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020050	ATA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669982
52	NC_020050	AGT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669982
53	NC_020050	CAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669982
54	NC_020050	CTT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669982
55	NC_020050	AAC	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020050	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020050	GAT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020050	AGA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020050	AGA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020050	TGG	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020050	GCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020050	ATT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020050	TCA	3	9	4697	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020050	CCA	2	6	4706	4711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020050	AGA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020050	CAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020050	AGA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020050	TAG	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020050	ACC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020050	TAC	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020050	AGA	2	6	5014	5019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020050	AGT	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020050	TAG	2	6	5058	5063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020050	AAG	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020050	TCG	2	6	5235	5240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020050	GTA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020050	ACG	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020050	ACA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020050	GTG	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020050	GTC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020050	TAA	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020050	GTG	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020050	CTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020050	CTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020050	TGA	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020050	TTG	2	6	6032	6037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020050	GTT	2	6	6071	6076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020050	TCT	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020050	TTA	2	6	6122	6127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020050	TGG	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020050	CTA	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020050	GAT	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020050	TCT	2	6	6277	6282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020050	GCA	2	6	6387	6392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020050	ATG	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020050	GGC	2	6	6552	6557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020050	TAA	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020050	TAG	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020050	ACA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020050	GCA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020050	TCA	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020050	TAT	3	9	6989	6997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020050	GCA	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020050	TTA	2	6	7041	7046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020050	TGG	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020050	AGT	2	6	7177	7182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020050	AGA	2	6	7372	7377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020050	TCT	2	6	7381	7386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020050	TAA	2	6	7527	7532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020050	AGT	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
111	NC_020050	TAA	2	6	7662	7667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
112	NC_020050	ACA	2	6	7709	7714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
113	NC_020050	ATT	2	6	7723	7728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669983
114	NC_020050	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669983
115	NC_020050	TCT	2	6	7801	7806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669983
116	NC_020050	TGT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669983
117	NC_020050	TAG	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
118	NC_020050	AAT	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
119	NC_020050	AGT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
120	NC_020050	CCA	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669983
121	NC_020050	CAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
122	NC_020050	TAA	2	6	8283	8288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
123	NC_020050	AGA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669983
124	NC_020050	CAA	2	6	8516	8521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
125	NC_020050	TGG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669983
126	NC_020050	GAT	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
127	NC_020050	AGT	2	6	8681	8686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
128	NC_020050	CTA	2	6	8712	8717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669983
129	NC_020050	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
130	NC_020050	AGG	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669984
131	NC_020050	AGA	2	6	8859	8864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
132	NC_020050	GAA	2	6	8950	8955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
133	NC_020050	CTA	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669984
134	NC_020050	TGA	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669984
135	NC_020050	GAC	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669984
136	NC_020050	CCA	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669984
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160	NC_020050	CAA	3	9	12145	12153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_020050	CCT	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_020050	TGC	2	6	12651	12656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_020050	AGA	2	6	12735	12740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020050	CAA	2	6	12784	12789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_020050	TCC	2	6	21310	21315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_020050	ATT	2	6	21394	21399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669995
265	NC_020050	CAT	2	6	21415	21420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669995
266	NC_020050	CGC	2	6	21436	21441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669995
267	NC_020050	GAA	2	6	21449	21454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669995
268	NC_020050	TGT	2	6	21641	21646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669995
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270	NC_020050	CTT	2	6	21729	21734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669995
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273	NC_020050	TAA	2	6	21858	21863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669995
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277	NC_020050	TAT	2	6	22457	22462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_020050	TTC	2	6	23133	23138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669997
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288	NC_020050	ATT	2	6	23534	23539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020050	GTT	2	6	23572	23577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020050	CAC	2	6	23780	23785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_020050	AAT	2	6	23875	23880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020050	CAA	2	6	23887	23892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_020050	CAA	2	6	24031	24036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_020050	CAA	2	6	24180	24185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669999
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366	NC_020050	ATG	2	6	29953	29958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_020050	GGA	2	6	30571	30576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_020050	ATA	2	6	31306	31311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
385	NC_020050	TAC	2	6	31725	31730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670003
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389	NC_020050	ACC	2	6	32651	32656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670004
390	NC_020050	TGA	2	6	32675	32680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670004
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