MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	AG	3	6	313	318	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
2	NC_020050	AT	3	6	364	369	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
3	NC_020050	AT	3	6	1210	1215	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
4	NC_020050	AG	3	6	1385	1390	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
5	NC_020050	GA	4	8	1406	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
6	NC_020050	GA	3	6	2708	2713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020050	TC	3	6	2744	2749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020050	CT	4	8	3074	3081	0 %	50 %	0 %	50 %	436669981
9	NC_020050	GA	3	6	4465	4470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020050	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020050	GA	3	6	6296	6301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020050	AT	3	6	6946	6951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020050	TA	3	6	7050	7055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020050	AT	3	6	7597	7602	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
15	NC_020050	TA	3	6	8082	8087	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
16	NC_020050	CT	3	6	8320	8325	0 %	50 %	0 %	50 %	436669983
17	NC_020050	AC	3	6	8393	8398	50 %	0 %	0 %	50 %	436669983
18	NC_020050	AT	3	6	8852	8857	50 %	50 %	0 %	0 %	436669984
19	NC_020050	GA	3	6	10335	10340	50 %	0 %	50 %	0 %	436669985
20	NC_020050	TC	3	6	11155	11160	0 %	50 %	0 %	50 %	436669986
21	NC_020050	CG	3	6	11227	11232	0 %	0 %	50 %	50 %	436669986
22	NC_020050	AG	3	6	12220	12225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020050	CA	3	6	13545	13550	50 %	0 %	0 %	50 %	436669990
24	NC_020050	TA	3	6	14185	14190	50 %	50 %	0 %	0 %	436669990
25	NC_020050	TG	3	6	14742	14747	0 %	50 %	50 %	0 %	436669990
26	NC_020050	GT	4	8	15545	15552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020050	AT	3	6	16869	16874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020050	AT	3	6	16915	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020050	AG	3	6	17199	17204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020050	AG	3	6	17453	17458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020050	GA	4	8	18289	18296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020050	GT	3	6	18748	18753	0 %	50 %	50 %	0 %	436669992
33	NC_020050	AC	3	6	20744	20749	50 %	0 %	0 %	50 %	436669993
34	NC_020050	AT	3	6	21290	21295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020050	TA	3	6	22360	22365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020050	AT	3	6	22660	22665	50 %	50 %	0 %	0 %	436669996
37	NC_020050	CA	3	6	23491	23496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020050	TA	3	6	24706	24711	50 %	50 %	0 %	0 %	436669999
39	NC_020050	GA	3	6	25194	25199	50 %	0 %	50 %	0 %	436669999
40	NC_020050	AC	3	6	25335	25340	50 %	0 %	0 %	50 %	436669999
41	NC_020050	TA	3	6	25341	25346	50 %	50 %	0 %	0 %	436669999
42	NC_020050	AT	3	6	26075	26080	50 %	50 %	0 %	0 %	436670000
43	NC_020050	GT	3	6	26360	26365	0 %	50 %	50 %	0 %	436670000
44	NC_020050	AG	3	6	26575	26580	50 %	0 %	50 %	0 %	436670000
45	NC_020050	TC	3	6	26925	26930	0 %	50 %	0 %	50 %	436670000
46	NC_020050	AG	3	6	26948	26953	50 %	0 %	50 %	0 %	436670000
47	NC_020050	AG	3	6	27563	27568	50 %	0 %	50 %	0 %	436670001
48	NC_020050	TA	3	6	27938	27943	50 %	50 %	0 %	0 %	436670001
49	NC_020050	CT	3	6	27990	27995	0 %	50 %	0 %	50 %	436670001
50	NC_020050	CT	3	6	28837	28842	0 %	50 %	0 %	50 %	436670001
51	NC_020050	GA	3	6	28934	28939	50 %	0 %	50 %	0 %	436670001
52	NC_020050	TA	3	6	28959	28964	50 %	50 %	0 %	0 %	436670001
53	NC_020050	CA	3	6	30911	30916	50 %	0 %	0 %	50 %	436670002
54	NC_020050	AT	3	6	32399	32404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020050	TA	3	6	32458	32463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020050	TA	3	6	32925	32930	50 %	50 %	0 %	0 %	436670004
57	NC_020050	CA	3	6	33394	33399	50 %	0 %	0 %	50 %	436670004
58	NC_020050	TA	3	6	33977	33982	50 %	50 %	0 %	0 %	436670005
59	NC_020050	TG	3	6	34313	34318	0 %	50 %	50 %	0 %	436670006
60	NC_020050	TG	3	6	34668	34673	0 %	50 %	50 %	0 %	436670006
61	NC_020050	AT	3	6	38384	38389	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
62	NC_020050	TG	3	6	39485	39490	0 %	50 %	50 %	0 %	436670010
63	NC_020050	AT	3	6	39998	40003	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
64	NC_020050	TG	3	6	40626	40631	0 %	50 %	50 %	0 %	436670011
65	NC_020050	TA	3	6	42490	42495	50 %	50 %	0 %	0 %	436670011
66	NC_020050	GA	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	436670011
67	NC_020050	CT	3	6	44468	44473	0 %	50 %	0 %	50 %	436670011
68	NC_020050	TC	3	6	45054	45059	0 %	50 %	0 %	50 %	436670011
69	NC_020050	GT	3	6	48515	48520	0 %	50 %	50 %	0 %	436670015
70	NC_020050	TA	3	6	49130	49135	50 %	50 %	0 %	0 %	436670016
71	NC_020050	AT	3	6	49188	49193	50 %	50 %	0 %	0 %	436670016
72	NC_020050	CT	3	6	51180	51185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020050	GT	3	6	52209	52214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020050	AC	3	6	52739	52744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020050	CA	3	6	52996	53001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020050	CA	3	6	53573	53578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020050	TC	3	6	53728	53733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020050	TA	3	6	53788	53793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020050	GA	3	6	56727	56732	50 %	0 %	50 %	0 %	436670022
80	NC_020050	TC	3	6	57501	57506	0 %	50 %	0 %	50 %	436670023
81	NC_020050	TA	3	6	57703	57708	50 %	50 %	0 %	0 %	436670023
82	NC_020050	AT	3	6	57918	57923	50 %	50 %	0 %	0 %	436670023
83	NC_020050	AT	3	6	59498	59503	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
84	NC_020050	GA	3	6	60713	60718	50 %	0 %	50 %	0 %	436670024
85	NC_020050	AG	3	6	61028	61033	50 %	0 %	50 %	0 %	436670024
86	NC_020050	AT	3	6	61110	61115	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
87	NC_020050	TA	3	6	61329	61334	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
88	NC_020050	CA	3	6	61838	61843	50 %	0 %	0 %	50 %	436670024
89	NC_020050	CA	3	6	62350	62355	50 %	0 %	0 %	50 %	436670024
90	NC_020050	AG	3	6	63083	63088	50 %	0 %	50 %	0 %	436670024
91	NC_020050	TA	3	6	64084	64089	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
92	NC_020050	TC	3	6	64588	64593	0 %	50 %	0 %	50 %	436670024
93	NC_020050	CG	3	6	64793	64798	0 %	0 %	50 %	50 %	436670024
94	NC_020050	TA	3	6	67504	67509	50 %	50 %	0 %	0 %	436670025
95	NC_020050	CT	3	6	68406	68411	0 %	50 %	0 %	50 %	436670025
96	NC_020050	TG	3	6	68680	68685	0 %	50 %	50 %	0 %	436670025
97	NC_020050	TG	3	6	68941	68946	0 %	50 %	50 %	0 %	436670025
98	NC_020050	CA	3	6	69036	69041	50 %	0 %	0 %	50 %	436670025
99	NC_020050	AG	5	10	72020	72029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020050	TA	3	6	72112	72117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020050	GT	4	8	72863	72870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020050	AG	3	6	73065	73070	50 %	0 %	50 %	0 %	436670026
103	NC_020050	AT	3	6	74364	74369	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
104	NC_020050	AT	3	6	74436	74441	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
105	NC_020050	AG	3	6	76248	76253	50 %	0 %	50 %	0 %	436670026
106	NC_020050	CG	3	6	77164	77169	0 %	0 %	50 %	50 %	436670026
107	NC_020050	CA	3	6	78051	78056	50 %	0 %	0 %	50 %	436670026
108	NC_020050	AT	3	6	78903	78908	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
109	NC_020050	TA	3	6	79060	79065	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
110	NC_020050	AT	3	6	79407	79412	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
111	NC_020050	TC	3	6	79863	79868	0 %	50 %	0 %	50 %	436670028
112	NC_020050	GT	3	6	80408	80413	0 %	50 %	50 %	0 %	436670028
113	NC_020050	AT	3	6	80801	80806	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
114	NC_020050	TA	3	6	82505	82510	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
115	NC_020050	CG	3	6	82524	82529	0 %	0 %	50 %	50 %	436670028
116	NC_020050	AG	3	6	83484	83489	50 %	0 %	50 %	0 %	436670028
117	NC_020050	TA	3	6	86184	86189	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
118	NC_020050	CT	3	6	86834	86839	0 %	50 %	0 %	50 %	436670029
119	NC_020050	TG	3	6	88132	88137	0 %	50 %	50 %	0 %	436670029
120	NC_020050	AT	3	6	89207	89212	50 %	50 %	0 %	0 %	436670029
121	NC_020050	AG	3	6	90180	90185	50 %	0 %	50 %	0 %	436670029
122	NC_020050	CA	4	8	91030	91037	50 %	0 %	0 %	50 %	436670029
123	NC_020050	GT	3	6	91901	91906	0 %	50 %	50 %	0 %	436670030
124	NC_020050	AT	3	6	93002	93007	50 %	50 %	0 %	0 %	436670030
125	NC_020050	CA	3	6	93043	93048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020050	AT	3	6	93871	93876	50 %	50 %	0 %	0 %	436670032
127	NC_020050	TC	3	6	94565	94570	0 %	50 %	0 %	50 %	436670033
128	NC_020050	GT	3	6	96029	96034	0 %	50 %	50 %	0 %	436670035
129	NC_020050	TA	3	6	96224	96229	50 %	50 %	0 %	0 %	436670035
130	NC_020050	TG	3	6	96874	96879	0 %	50 %	50 %	0 %	436670035
131	NC_020050	GT	3	6	97391	97396	0 %	50 %	50 %	0 %	436670036
132	NC_020050	TA	3	6	98249	98254	50 %	50 %	0 %	0 %	436670036
133	NC_020050	GA	3	6	98641	98646	50 %	0 %	50 %	0 %	436670036
134	NC_020050	AG	5	10	99299	99308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020050	GT	3	6	99894	99899	0 %	50 %	50 %	0 %	436670037
136	NC_020050	AG	3	6	101127	101132	50 %	0 %	50 %	0 %	436670038
137	NC_020050	GA	3	6	101750	101755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020050	AC	3	6	101837	101842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020050	CG	3	6	102708	102713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020050	AC	3	6	103323	103328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020050	AT	3	6	103341	103346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020050	GC	3	6	103525	103530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020050	GC	3	6	103816	103821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020050	AT	3	6	104000	104005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020050	TG	3	6	104017	104022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020050	CT	3	6	105322	105327	0 %	50 %	0 %	50 %	436670040
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