MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	GA	3	6	2708	2713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020050	TC	3	6	2744	2749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020050	GA	3	6	4465	4470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020050	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020050	GA	3	6	6296	6301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020050	AT	3	6	6946	6951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020050	TA	3	6	7050	7055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020050	AG	3	6	12220	12225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020050	GT	4	8	15545	15552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020050	AT	3	6	16869	16874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020050	AT	3	6	16915	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020050	AG	3	6	17199	17204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020050	AG	3	6	17453	17458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020050	GA	4	8	18289	18296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020050	AT	3	6	21290	21295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020050	TA	3	6	22360	22365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020050	CA	3	6	23491	23496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020050	AT	3	6	32399	32404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020050	TA	3	6	32458	32463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020050	CT	3	6	51180	51185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020050	GT	3	6	52209	52214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020050	AC	3	6	52739	52744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020050	CA	3	6	52996	53001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020050	CA	3	6	53573	53578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020050	TC	3	6	53728	53733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020050	TA	3	6	53788	53793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020050	AG	5	10	72020	72029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020050	TA	3	6	72112	72117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020050	GT	4	8	72863	72870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020050	CA	3	6	93043	93048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020050	AG	5	10	99299	99308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020050	GA	3	6	101750	101755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020050	AC	3	6	101837	101842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020050	CG	3	6	102708	102713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020050	AC	3	6	103323	103328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020050	AT	3	6	103341	103346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020050	GC	3	6	103525	103530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020050	GC	3	6	103816	103821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020050	AT	3	6	104000	104005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020050	TG	3	6	104017	104022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020050	TA	3	6	107008	107013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020050	AT	3	6	107020	107025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020050	TA	3	6	113068	113073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020050	AC	3	6	113221	113226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020050	AG	3	6	117576	117581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020050	GT	3	6	117929	117934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020050	CA	3	6	118044	118049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020050	AC	3	6	118423	118428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020050	CA	3	6	118430	118435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020050	TA	3	6	121171	121176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020050	CA	3	6	121320	121325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020050	TA	3	6	122475	122480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020050	AG	3	6	123713	123718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020050	TG	3	6	132179	132184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020050	GA	4	8	135409	135416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020050	TA	3	6	141167	141172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020050	AG	4	8	145228	145235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020050	AT	3	6	149074	149079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020050	TG	3	6	149091	149096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020050	TG	3	6	150418	150423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020050	GA	3	6	153847	153852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020050	GA	3	6	154789	154794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020050	AT	3	6	159561	159566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020050	CA	3	6	162112	162117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020050	TA	3	6	162242	162247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020050	TA	4	8	170665	170672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020050	AT	3	6	170757	170762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020050	AT	3	6	172887	172892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020050	AT	3	6	172975	172980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020050	TA	3	6	174988	174993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020050	AT	3	6	175202	175207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020050	AT	3	6	175436	175441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020050	AT	3	6	176918	176923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020050	CA	3	6	176924	176929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020050	AG	3	6	177159	177164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020050	GA	3	6	178629	178634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020050	TA	4	8	178732	178739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020050	TG	3	6	179692	179697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020050	AG	3	6	182689	182694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020050	AG	3	6	182712	182717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020050	TC	3	6	184084	184089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020050	GA	4	8	184941	184948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020050	GA	3	6	187199	187204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020050	TC	3	6	207340	207345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020050	AT	4	8	207525	207532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020050	TC	3	6	213279	213284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020050	CA	3	6	213456	213461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020050	AG	3	6	213468	213473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020050	AG	3	6	215561	215566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020050	CA	3	6	216742	216747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020050	CG	3	6	217197	217202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020050	AT	3	6	217585	217590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020050	GA	3	6	218314	218319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020050	TC	3	6	229013	229018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020050	CT	4	8	229191	229198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020050	CG	3	6	237522	237527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020050	AG	3	6	239874	239879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020050	CT	3	6	239999	240004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020050	GC	3	6	240049	240054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020050	GC	3	6	245229	245234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020050	TC	3	6	253984	253989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020050	AG	3	6	262333	262338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020050	GC	3	6	262343	262348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020050	AT	3	6	271100	271105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020050	TA	3	6	274355	274360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020050	TG	3	6	276495	276500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020050	GA	3	6	282839	282844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020050	TC	3	6	291933	291938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020050	AT	3	6	303145	303150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020050	TA	3	6	303204	303209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020050	TA	3	6	306878	306883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020050	AT	3	6	307899	307904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020050	AG	3	6	308314	308319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020050	TA	3	6	311598	311603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020050	AT	3	6	316798	316803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020050	TA	3	6	318981	318986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020050	GA	3	6	319041	319046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020050	TG	3	6	319196	319201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020050	TG	3	6	319773	319778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020050	GT	3	6	320030	320035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020050	AC	3	6	320560	320565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020050	AG	3	6	321589	321594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020050	AC	4	8	323664	323671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020050	AT	3	6	327043	327048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020050	CT	4	8	329640	329647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020050	CT	3	6	329652	329657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020050	CT	3	6	329664	329669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020050	TC	3	6	332935	332940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020050	TA	3	6	336159	336164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020050	CA	3	6	337120	337125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020050	GT	3	6	338516	338521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020050	TC	3	6	345436	345441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020050	GA	3	6	345840	345845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020050	AT	3	6	351252	351257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020050	AG	3	6	355190	355195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020050	AG	3	6	356049	356054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020050	AT	3	6	368523	368528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020050	TA	4	8	368800	368807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020050	AG	3	6	369957	369962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020050	CT	3	6	372254	372259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020050	TA	3	6	373621	373626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020050	CT	3	6	375319	375324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020050	CT	3	6	377745	377750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020050	CA	3	6	377976	377981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020050	TA	3	6	378074	378079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020050	TG	3	6	379633	379638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020050	CA	3	6	379761	379766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020050	GA	3	6	380426	380431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020050	TG	3	6	381003	381008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020050	AT	3	6	381642	381647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020050	AC	3	6	382692	382697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020050	TA	3	6	382854	382859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020050	TG	3	6	382952	382957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020050	AG	3	6	383183	383188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020050	AT	3	6	385672	385677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020050	CT	3	6	386386	386391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.