MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	T	6	6	4041	4046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020050	A	6	6	4418	4423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020050	A	6	6	4583	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020050	A	6	6	4671	4676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020050	A	6	6	4735	4740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020050	A	7	7	4751	4757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020050	T	6	6	5335	5340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020050	A	6	6	5693	5698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020050	T	7	7	6111	6117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020050	A	6	6	6212	6217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020050	A	6	6	6424	6429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020050	A	6	6	7162	7167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020050	T	6	6	7494	7499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020050	T	9	9	11986	11994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020050	T	8	8	12168	12175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020050	A	6	6	12402	12407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020050	A	6	6	12461	12466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020050	T	6	6	15563	15568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020050	C	6	6	15576	15581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_020050	G	6	6	15643	15648	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020050	T	6	6	15750	15755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020050	T	6	6	16366	16371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020050	T	6	6	16835	16840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020050	A	7	7	17078	17084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020050	T	6	6	17142	17147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020050	A	7	7	17227	17233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020050	T	6	6	17341	17346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020050	A	6	6	22942	22947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020050	A	6	6	24022	24027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020050	T	6	6	29315	29320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020050	T	7	7	29483	29489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020050	T	8	8	29692	29699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020050	T	6	6	30178	30183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020050	T	6	6	30198	30203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020050	A	6	6	30471	30476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020050	T	6	6	47194	47199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020050	A	6	6	50326	50331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020050	A	6	6	50691	50696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020050	A	7	7	50715	50721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020050	A	9	9	51002	51010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020050	A	6	6	51845	51850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020050	A	6	6	52030	52035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020050	A	6	6	53205	53210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020050	T	6	6	53960	53965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020050	A	7	7	56448	56454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020050	A	6	6	71332	71337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020050	T	6	6	71736	71741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020050	A	7	7	78160	78166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020050	T	7	7	99327	99333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020050	A	6	6	102023	102028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020050	A	6	6	103292	103297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020050	T	7	7	105839	105845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020050	T	6	6	105860	105865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020050	T	6	6	113152	113157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020050	G	6	6	117702	117707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020050	A	6	6	117919	117924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020050	A	6	6	122695	122700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020050	T	6	6	125149	125154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020050	A	6	6	137971	137976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020050	A	6	6	140567	140572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020050	G	6	6	143244	143249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020050	T	6	6	149123	149128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020050	A	7	7	154772	154778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020050	A	6	6	157167	157172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020050	T	6	6	161162	161167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020050	G	6	6	166370	166375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020050	T	7	7	170577	170583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020050	T	6	6	170599	170604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020050	A	6	6	172928	172933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020050	A	6	6	174973	174978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020050	N	100	100	175215	175314	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020050	A	6	6	177237	177242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020050	A	6	6	178572	178577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020050	T	6	6	178646	178651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020050	A	7	7	178803	178809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020050	T	6	6	178938	178943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020050	T	6	6	179020	179025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020050	T	6	6	183301	183306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020050	A	6	6	184160	184165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020050	A	6	6	185527	185532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020050	A	6	6	185683	185688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020050	C	6	6	187210	187215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_020050	T	6	6	190766	190771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020050	T	6	6	191334	191339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020050	T	6	6	196665	196670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020050	T	8	8	196885	196892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020050	T	6	6	197607	197612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020050	T	7	7	205992	205998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020050	T	8	8	207330	207337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020050	A	6	6	207369	207374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020050	T	6	6	207537	207542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020050	T	6	6	209418	209423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020050	T	7	7	210065	210071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020050	A	6	6	213522	213527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020050	T	6	6	214361	214366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020050	T	6	6	214391	214396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020050	T	9	9	215736	215744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020050	T	7	7	216025	216031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020050	T	6	6	216050	216055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020050	T	6	6	217950	217955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020050	T	6	6	218265	218270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020050	T	6	6	219288	219293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020050	T	6	6	220167	220172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020050	A	6	6	224017	224022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020050	T	6	6	229185	229190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020050	T	7	7	229845	229851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020050	A	6	6	234203	234208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020050	T	6	6	234527	234532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020050	T	6	6	237723	237728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020050	T	7	7	237739	237745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020050	T	6	6	242907	242912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020050	A	6	6	246305	246310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020050	G	6	6	249852	249857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020050	T	6	6	252857	252862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020050	A	6	6	253920	253925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020050	T	6	6	262391	262396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020050	G	6	6	262399	262404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020050	G	6	6	262408	262413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020050	T	7	7	273690	273696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020050	T	7	7	273834	273840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020050	T	9	9	273967	273975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020050	A	7	7	274255	274261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020050	T	7	7	274391	274397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020050	A	7	7	276263	276269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020050	A	6	6	276526	276531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020050	T	6	6	291977	291982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020050	A	6	6	294244	294249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020050	A	6	6	294358	294363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020050	A	7	7	300746	300752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020050	A	6	6	300797	300802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020050	A	6	6	301217	301222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020050	A	6	6	307597	307602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020050	G	6	6	308955	308960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020050	A	6	6	311531	311536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020050	A	6	6	311542	311547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020050	T	8	8	311553	311560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020050	A	6	6	311582	311587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020050	T	6	6	318063	318068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020050	T	6	6	318206	318211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020050	A	6	6	318239	318244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020050	N	100	100	318443	318542	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020050	A	6	6	318809	318814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020050	T	6	6	319564	319569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020050	T	6	6	320739	320744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020050	T	6	6	320924	320929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020050	T	9	9	321764	321772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020050	T	7	7	322053	322059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020050	T	6	6	322078	322083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020050	A	6	6	323462	323467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_020050	T	6	6	326808	326813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020050	T	7	7	326904	326910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.