MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halobacteroides halobius DSM 5150

Total Repeats: 1422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019978	TAGCAG	2	12	726	737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435852813
2	NC_019978	ACAGCA	2	12	4058	4069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	435852816
3	NC_019978	AGCTTT	2	12	4184	4195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	435852816
4	NC_019978	AGAATT	2	12	4205	4216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852816
5	NC_019978	GAAGGA	2	12	5935	5946	50 %	0 %	50 %	0 %	435852819
6	NC_019978	TTAAGA	2	12	6221	6232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852819
7	NC_019978	AGAAGT	2	12	6372	6383	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852819
8	NC_019978	AAATGA	2	12	9910	9921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852820
9	NC_019978	TTTTTA	2	12	10009	10020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	435852821
10	NC_019978	TAAAAT	2	12	10528	10539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852821
11	NC_019978	TATATT	2	12	10816	10827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852821
12	NC_019978	AATTTT	2	12	12795	12806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852823
13	NC_019978	AAGCGA	2	12	17891	17902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019978	CTGGAG	2	12	19770	19781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019978	TAATTT	2	12	22353	22364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852826
16	NC_019978	AATATT	2	12	22764	22775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019978	ATTAGA	2	12	24768	24779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852828
18	NC_019978	AAGCTC	2	12	25984	25995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	435852829
19	NC_019978	ATAAGG	2	12	27453	27464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852830
20	NC_019978	TAGCTA	2	12	33342	33353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435852835
21	NC_019978	AATTAA	2	12	34293	34304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852836
22	NC_019978	TAAAAT	2	12	34356	34367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852836
23	NC_019978	TTGAAG	2	12	35800	35811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852837
24	NC_019978	GCTTTA	2	12	36762	36773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	435852837
25	NC_019978	TAATTA	2	12	38855	38866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019978	GATATT	2	12	42505	42516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852842
27	NC_019978	GTAAAG	2	12	45223	45234	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852844
28	NC_019978	GAAGCT	2	12	46635	46646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435852844
29	NC_019978	AATTTA	2	12	47063	47074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019978	ACTGCT	2	12	48677	48688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	435852848
31	NC_019978	TAAAGC	2	12	52112	52123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435852850
32	NC_019978	ATCCTA	2	12	54400	54411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852852
33	NC_019978	TCTTTA	2	12	54777	54788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	435852852
34	NC_019978	CAGCTG	2	12	55108	55119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	435852852
35	NC_019978	AGGAGT	2	12	56948	56959	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	435852853
36	NC_019978	TAATTG	2	12	57729	57740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852854
37	NC_019978	GTTAAT	2	12	59872	59883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852856
38	NC_019978	AAATAG	2	12	60703	60714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852857
39	NC_019978	ATAAAG	2	12	65916	65927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852864
40	NC_019978	TTAAGG	2	12	67019	67030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852865
41	NC_019978	AAGTTT	2	12	68491	68502	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852866
42	NC_019978	GTGATC	2	12	69002	69013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	435852866
43	NC_019978	AAATGA	2	12	70450	70461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852867
44	NC_019978	GTCTAA	2	12	70924	70935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435852867
45	NC_019978	TAGTCG	2	12	73798	73809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	435852870
46	NC_019978	AACCAA	2	12	79669	79680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019978	TAAAGC	2	12	82934	82945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435852877
48	NC_019978	TAAAGC	2	12	85041	85052	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435852878
49	NC_019978	GCTTCT	2	12	86888	86899	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	435852880
50	NC_019978	TGTTAA	2	12	88071	88082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852882
51	NC_019978	AAAGTA	2	12	89005	89016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852882
52	NC_019978	ATTTTT	2	12	90960	90971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	435852883
53	NC_019978	CTTTAA	2	12	92189	92200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	435852884
54	NC_019978	TGGAGA	2	12	93312	93323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	435852885
55	NC_019978	TAGCTA	2	12	94184	94195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435852885
56	NC_019978	CAGAAG	2	12	94841	94852	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	435852885
57	NC_019978	GTAAAG	2	12	99177	99188	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852890
58	NC_019978	TTGTAG	2	12	100840	100851	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	435852892
59	NC_019978	GATGAA	2	12	103687	103698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852894
60	NC_019978	ATTTAG	2	12	104084	104095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852895
61	NC_019978	GGCCAA	2	12	106496	106507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852897
62	NC_019978	TTTAAC	2	12	107099	107110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	435852897
63	NC_019978	ATTTTA	2	12	108299	108310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019978	TAGCTT	2	12	108911	108922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	435852898
65	NC_019978	TAACAG	2	12	113084	113095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435852901
66	NC_019978	GCAAAT	2	12	116313	116324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435852904
67	NC_019978	TAGGAA	2	12	117628	117639	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852905
68	NC_019978	TAACTG	2	12	118230	118241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435852906
69	NC_019978	TATAAG	2	12	118982	118993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019978	AGCAGA	2	12	123325	123336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	435852910
71	NC_019978	ATGGTA	2	12	123849	123860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852910
72	NC_019978	GTCAGC	2	12	126839	126850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	435852913
73	NC_019978	AGAAGT	2	12	127356	127367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852913
74	NC_019978	GATCAT	2	12	127571	127582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019978	ATTTAG	2	12	127847	127858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852914
76	NC_019978	TTAAGG	2	12	129416	129427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852917
77	NC_019978	AAGTAA	2	12	131125	131136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852918
78	NC_019978	GATGGA	2	12	131145	131156	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	435852918
79	NC_019978	AGTTTT	2	12	133907	133918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	435852921
80	NC_019978	GAAAGT	2	12	135398	135409	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852921
81	NC_019978	TTGGCC	2	12	136044	136055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852922
82	NC_019978	AGCCTG	2	12	138282	138293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	435852924
83	NC_019978	TACACC	2	12	140254	140265	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	435852925
84	NC_019978	GATATT	2	12	141689	141700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852925
85	NC_019978	ATAGTA	2	12	143253	143264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852927
86	NC_019978	TGACAG	2	12	143984	143995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435852929
87	NC_019978	TGCAAT	2	12	144006	144017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435852929
88	NC_019978	GCCTTA	2	12	145066	145077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	435852930
89	NC_019978	AATTAA	2	12	145579	145590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852930
90	NC_019978	GGAATT	2	12	151541	151552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852936
91	NC_019978	AAATAA	2	12	153627	153638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019978	AAGCGA	2	12	156207	156218	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019978	CTGGAG	2	12	158086	158097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019978	ATTTTT	2	12	158954	158965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019978	GATTTA	2	12	160284	160295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852941
96	NC_019978	AATGAA	2	12	161061	161072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435852941
97	NC_019978	AGAAGG	2	12	161253	161264	50 %	0 %	50 %	0 %	435852942
98	NC_019978	TTTAAT	2	12	163960	163971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852943
99	NC_019978	TTTGCA	2	12	164725	164736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	435852943
100	NC_019978	TATAGA	2	12	166293	166304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852945
101	NC_019978	CTGATG	2	12	168752	168763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	435852948
102	NC_019978	GGTTAT	2	12	169583	169594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	435852949
103	NC_019978	AAGAGG	2	12	169801	169812	50 %	0 %	50 %	0 %	435852949
104	NC_019978	CTGTTT	2	12	169821	169832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	435852949
105	NC_019978	TTATGT	2	12	170745	170756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	435852950
106	NC_019978	AAAAGC	2	12	180109	180120	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	435852959
107	NC_019978	ACTGCT	2	12	184480	184491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	435852965
108	NC_019978	AGAAGC	2	12	184638	184649	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	435852965
109	NC_019978	ACTGGT	2	12	186097	186108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	435852967
110	NC_019978	GAAATG	2	12	186618	186629	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852968
111	NC_019978	TTGAAT	2	12	187060	187071	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435852968
112	NC_019978	AAGTGA	2	12	190335	190346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852969
113	NC_019978	AAGAAA	2	12	194551	194562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	435852972
114	NC_019978	AATTAC	2	12	194567	194578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	435852972
115	NC_019978	CTGGAG	2	12	197848	197859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	435852974
116	NC_019978	TAAAGG	2	12	198431	198442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852975
117	NC_019978	GTTAAA	2	12	199514	199525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	435852977
118	NC_019978	AAGCTA	2	12	200873	200884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435852980
119	NC_019978	GATGAA	2	12	205732	205743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435852992
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236	NC_019978	TAAAAG	2	12	416698	416709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435853174
237	NC_019978	TTTAAG	2	12	420733	420744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435853177
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239	NC_019978	AAGATG	2	12	425130	425141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435853180
240	NC_019978	ATTCTT	2	12	426093	426104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	435853180
241	NC_019978	TAGTTA	2	12	430967	430978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435853185
242	NC_019978	TAGTGA	2	12	431201	431212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435853185
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245	NC_019978	TAGAAA	2	12	435936	435947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_019978	CTGAAA	2	12	461457	461468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435853211
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264	NC_019978	AACCAA	2	12	465826	465837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_019978	GGGTAT	2	12	488914	488925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_019978	TATAAG	2	12	507669	507680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_019978	GCTGAT	2	12	507967	507978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	435853256
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324	NC_019978	ATTATA	2	12	566455	566466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_019978	AGGAAC	2	12	567448	567459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	435853325
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340	NC_019978	ATTGCA	2	12	594593	594604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435853354
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342	NC_019978	CAAGAT	2	12	596089	596100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435853356
343	NC_019978	ATGATA	2	12	597398	597409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
344	NC_019978	TATGCT	2	12	598262	598273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	435853358
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346	NC_019978	TGGGTT	2	12	600246	600257	0 %	50 %	50 %	0 %	435853361
347	NC_019978	AAGGAT	2	12	601464	601475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	435853362
348	NC_019978	TTTTGG	2	12	602133	602144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435853363
349	NC_019978	ATTTTA	2	12	605410	605421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_019978	AGGTGA	2	12	605454	605465	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
351	NC_019978	TAAGCA	2	12	606372	606383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435853368
352	NC_019978	ACTGCT	2	12	609163	609174	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	435853368
353	NC_019978	TAAAGA	2	12	610652	610663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	435853370
354	NC_019978	TTAGAT	2	12	611732	611743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	435853371
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357	NC_019978	TTGGTG	2	12	616226	616237	0 %	50 %	50 %	0 %	435853378
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359	NC_019978	TAGGAT	2	12	622891	622902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435853389
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361	NC_019978	TTTAAT	2	12	633078	633089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435853399
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367	NC_019978	AAAAGA	2	12	643240	643251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	435853413
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