MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halobacteroides halobius DSM 5150

Total Repeats: 2781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019978	TAAAG	2	10	16	25	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019978	TGAAA	2	10	556	565	60 %	20 %	20 %	0 %	435852813
3	NC_019978	AAATA	2	10	1240	1249	80 %	20 %	0 %	0 %	435852813
4	NC_019978	ATAAA	2	10	1605	1614	80 %	20 %	0 %	0 %	435852813
5	NC_019978	CCAAA	2	10	2717	2726	60 %	0 %	0 %	40 %	435852814
6	NC_019978	AGATA	2	10	6411	6420	60 %	20 %	20 %	0 %	435852819
7	NC_019978	AAAAC	2	10	6631	6640	80 %	0 %	0 %	20 %	435852819
8	NC_019978	CAATT	2	10	7349	7358	40 %	40 %	0 %	20 %	435852819
9	NC_019978	CTATG	2	10	7606	7615	20 %	40 %	20 %	20 %	435852820
10	NC_019978	AACCA	2	10	9139	9148	60 %	0 %	0 %	40 %	435852820
11	NC_019978	ATATT	2	10	10097	10106	40 %	60 %	0 %	0 %	435852821
12	NC_019978	TTTTC	2	10	10139	10148	0 %	80 %	0 %	20 %	435852821
13	NC_019978	GTTAG	2	10	10394	10403	20 %	40 %	40 %	0 %	435852821
14	NC_019978	CTTTG	2	10	10698	10707	0 %	60 %	20 %	20 %	435852821
15	NC_019978	TAAGC	2	10	11045	11054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019978	TTTAA	2	10	11313	11322	40 %	60 %	0 %	0 %	435852822
17	NC_019978	AAATC	2	10	11445	11454	60 %	20 %	0 %	20 %	435852822
18	NC_019978	CTAAT	2	10	12304	12313	40 %	40 %	0 %	20 %	435852822
19	NC_019978	ATAGT	2	10	12622	12631	40 %	40 %	20 %	0 %	435852822
20	NC_019978	ATATT	2	10	13666	13675	40 %	60 %	0 %	0 %	435852823
21	NC_019978	TTATT	2	10	14963	14972	20 %	80 %	0 %	0 %	435852825
22	NC_019978	TAATA	2	10	14994	15003	60 %	40 %	0 %	0 %	435852825
23	NC_019978	TCGTG	2	10	16612	16621	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019978	GGGAG	2	10	17753	17762	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019978	CCGTA	2	10	18860	18869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019978	TGATT	2	10	20800	20809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019978	AATTA	2	10	22418	22427	60 %	40 %	0 %	0 %	435852826
28	NC_019978	TTTAG	2	10	22716	22725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019978	GAGAA	2	10	22808	22817	60 %	0 %	40 %	0 %	435852827
30	NC_019978	AGAGA	2	10	23161	23170	60 %	0 %	40 %	0 %	435852827
31	NC_019978	TAAAG	2	10	25215	25224	60 %	20 %	20 %	0 %	435852828
32	NC_019978	AAAAG	2	10	28378	28387	80 %	0 %	20 %	0 %	435852830
33	NC_019978	TAATA	2	10	28982	28991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019978	AAATT	2	10	30324	30333	60 %	40 %	0 %	0 %	435852832
35	NC_019978	TTTGG	2	10	31465	31474	0 %	60 %	40 %	0 %	435852833
36	NC_019978	AGTTA	2	10	31784	31793	40 %	40 %	20 %	0 %	435852833
37	NC_019978	GCTAT	2	10	34585	34594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019978	AAGAT	2	10	34951	34960	60 %	20 %	20 %	0 %	435852837
39	NC_019978	ATTTG	2	10	38743	38752	20 %	60 %	20 %	0 %	435852839
40	NC_019978	TACAT	2	10	38843	38852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019978	AGATT	2	10	39321	39330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019978	TATTT	2	10	39397	39406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019978	CTGTT	2	10	42849	42858	0 %	60 %	20 %	20 %	435852843
44	NC_019978	AAAGG	2	10	47508	47517	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019978	ATGTT	2	10	48918	48927	20 %	60 %	20 %	0 %	435852848
46	NC_019978	AGATT	2	10	49326	49335	40 %	40 %	20 %	0 %	435852848
47	NC_019978	GAAGA	2	10	51961	51970	60 %	0 %	40 %	0 %	435852850
48	NC_019978	TTAAT	2	10	52360	52369	40 %	60 %	0 %	0 %	435852850
49	NC_019978	AAAGT	2	10	52958	52967	60 %	20 %	20 %	0 %	435852851
50	NC_019978	TTTCA	2	10	53025	53034	20 %	60 %	0 %	20 %	435852851
51	NC_019978	ATTTG	2	10	54909	54918	20 %	60 %	20 %	0 %	435852852
52	NC_019978	TTAGA	2	10	55465	55474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019978	TTACT	2	10	55517	55526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019978	TTATA	2	10	55705	55714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019978	ATTAA	2	10	56130	56139	60 %	40 %	0 %	0 %	435852853
56	NC_019978	TTTTA	2	10	60283	60292	20 %	80 %	0 %	0 %	435852857
57	NC_019978	GAATT	2	10	60361	60370	40 %	40 %	20 %	0 %	435852857
58	NC_019978	TAAAT	2	10	61397	61406	60 %	40 %	0 %	0 %	435852859
59	NC_019978	ATTAT	2	10	61462	61471	40 %	60 %	0 %	0 %	435852859
60	NC_019978	GTTAT	2	10	61995	62004	20 %	60 %	20 %	0 %	435852860
61	NC_019978	AAAGA	2	10	63869	63878	80 %	0 %	20 %	0 %	435852863
62	NC_019978	AGGAT	2	10	64521	64530	40 %	20 %	40 %	0 %	435852863
63	NC_019978	CTAAC	2	10	64720	64729	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_019978	AGATA	2	10	65662	65671	60 %	20 %	20 %	0 %	435852864
65	NC_019978	AAGAA	2	10	67426	67435	80 %	0 %	20 %	0 %	435852865
66	NC_019978	TCTTT	2	10	68516	68525	0 %	80 %	0 %	20 %	435852866
67	NC_019978	CATGG	2	10	70220	70229	20 %	20 %	40 %	20 %	435852867
68	NC_019978	GTTTG	2	10	70706	70715	0 %	60 %	40 %	0 %	435852867
69	NC_019978	GATTA	2	10	72263	72272	40 %	40 %	20 %	0 %	435852868
70	NC_019978	TAATT	2	10	73130	73139	40 %	60 %	0 %	0 %	435852869
71	NC_019978	TATTT	2	10	73614	73623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019978	TTATA	2	10	74250	74259	40 %	60 %	0 %	0 %	435852870
73	NC_019978	AGTAA	2	10	75058	75067	60 %	20 %	20 %	0 %	435852870
74	NC_019978	TAAAA	2	10	79617	79626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019978	TAAAT	2	10	80777	80786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019978	TTAAT	2	10	83182	83191	40 %	60 %	0 %	0 %	435852877
77	NC_019978	GAAGA	2	10	84890	84899	60 %	0 %	40 %	0 %	435852878
78	NC_019978	TTAAT	2	10	85289	85298	40 %	60 %	0 %	0 %	435852878
79	NC_019978	TAGTT	2	10	88554	88563	20 %	60 %	20 %	0 %	435852882
80	NC_019978	TATAG	2	10	88897	88906	40 %	40 %	20 %	0 %	435852882
81	NC_019978	TACAA	2	10	89560	89569	60 %	20 %	0 %	20 %	435852882
82	NC_019978	TTTTG	2	10	89788	89797	0 %	80 %	20 %	0 %	435852883
83	NC_019978	GAGAA	2	10	90646	90655	60 %	0 %	40 %	0 %	435852883
84	NC_019978	AATTA	2	10	92406	92415	60 %	40 %	0 %	0 %	435852885
85	NC_019978	GAAAA	2	10	92853	92862	80 %	0 %	20 %	0 %	435852885
86	NC_019978	AACTT	2	10	94300	94309	40 %	40 %	0 %	20 %	435852885
87	NC_019978	ATGAT	2	10	96723	96732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019978	GGGTA	2	10	96961	96970	20 %	20 %	60 %	0 %	435852888
89	NC_019978	AATTA	2	10	97608	97617	60 %	40 %	0 %	0 %	435852888
90	NC_019978	GGTAA	2	10	98879	98888	40 %	20 %	40 %	0 %	435852890
91	NC_019978	ATTAG	2	10	102034	102043	40 %	40 %	20 %	0 %	435852892
92	NC_019978	GACAG	2	10	102358	102367	40 %	0 %	40 %	20 %	435852893
93	NC_019978	TAATT	2	10	102410	102419	40 %	60 %	0 %	0 %	435852893
94	NC_019978	AGATA	2	10	102914	102923	60 %	20 %	20 %	0 %	435852893
95	NC_019978	TATAA	2	10	103027	103036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019978	AATTA	2	10	105080	105089	60 %	40 %	0 %	0 %	435852897
97	NC_019978	AAGGA	2	10	109364	109373	60 %	0 %	40 %	0 %	435852899
98	NC_019978	TAATT	2	10	110487	110496	40 %	60 %	0 %	0 %	435852899
99	NC_019978	AAAAG	2	10	111763	111772	80 %	0 %	20 %	0 %	435852900
100	NC_019978	AAAGC	2	10	112624	112633	60 %	0 %	20 %	20 %	435852901
101	NC_019978	TAAAG	2	10	113040	113049	60 %	20 %	20 %	0 %	435852901
102	NC_019978	ATCAA	2	10	113144	113153	60 %	20 %	0 %	20 %	435852901
103	NC_019978	GAACG	2	10	115027	115036	40 %	0 %	40 %	20 %	435852903
104	NC_019978	TGATG	2	10	115096	115105	20 %	40 %	40 %	0 %	435852903
105	NC_019978	AAATT	2	10	115611	115620	60 %	40 %	0 %	0 %	435852903
106	NC_019978	ATATT	2	10	116888	116897	40 %	60 %	0 %	0 %	435852904
107	NC_019978	TTGGA	2	10	117677	117686	20 %	40 %	40 %	0 %	435852905
108	NC_019978	TTATT	2	10	118019	118028	20 %	80 %	0 %	0 %	435852905
109	NC_019978	TGGAT	2	10	118543	118552	20 %	40 %	40 %	0 %	435852906
110	NC_019978	AATTA	2	10	119356	119365	60 %	40 %	0 %	0 %	435852907
111	NC_019978	TTAAG	2	10	120752	120761	40 %	40 %	20 %	0 %	435852907
112	NC_019978	AATTA	2	10	120964	120973	60 %	40 %	0 %	0 %	435852908
113	NC_019978	AATGG	2	10	120981	120990	40 %	20 %	40 %	0 %	435852908
114	NC_019978	AGTTA	2	10	124442	124451	40 %	40 %	20 %	0 %	435852911
115	NC_019978	AAGAA	2	10	125498	125507	80 %	0 %	20 %	0 %	435852912
116	NC_019978	GATTT	2	10	128041	128050	20 %	60 %	20 %	0 %	435852915
117	NC_019978	TATTT	2	10	128096	128105	20 %	80 %	0 %	0 %	435852915
118	NC_019978	AAGAA	2	10	128581	128590	80 %	0 %	20 %	0 %	435852916
119	NC_019978	GTTTA	2	10	131344	131353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019978	AATTA	2	10	131613	131622	60 %	40 %	0 %	0 %	435852919
121	NC_019978	AATTT	2	10	131744	131753	40 %	60 %	0 %	0 %	435852919
122	NC_019978	TAGAT	2	10	132191	132200	40 %	40 %	20 %	0 %	435852920
123	NC_019978	AGAAA	2	10	132709	132718	80 %	0 %	20 %	0 %	435852920
124	NC_019978	AATCC	2	10	133249	133258	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019978	ATAGA	2	10	133350	133359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019978	CTTTT	2	10	133391	133400	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019978	TTTAT	2	10	133766	133775	20 %	80 %	0 %	0 %	435852921
128	NC_019978	TTGAT	2	10	134652	134661	20 %	60 %	20 %	0 %	435852921
129	NC_019978	AGAAA	2	10	135101	135110	80 %	0 %	20 %	0 %	435852921
130	NC_019978	AGATT	2	10	136540	136549	40 %	40 %	20 %	0 %	435852922
131	NC_019978	AAGAA	2	10	137117	137126	80 %	0 %	20 %	0 %	435852922
132	NC_019978	AAGTT	2	10	137511	137520	40 %	40 %	20 %	0 %	435852923
133	NC_019978	TACTT	2	10	137725	137734	20 %	60 %	0 %	20 %	435852923
134	NC_019978	GAAAA	2	10	138726	138735	80 %	0 %	20 %	0 %	435852924
135	NC_019978	AGAGT	2	10	139203	139212	40 %	20 %	40 %	0 %	435852924
136	NC_019978	AACTT	2	10	140526	140535	40 %	40 %	0 %	20 %	435852925
137	NC_019978	ATTAA	2	10	141230	141239	60 %	40 %	0 %	0 %	435852925
138	NC_019978	AATGA	2	10	141762	141771	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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