MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacteroides halobius DSM 5150

Total Repeats: 492

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019978	TAAAG	2	10	16	25	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019978	TAAGC	2	10	11045	11054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019978	TCGTG	2	10	16612	16621	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019978	GGGAG	2	10	17753	17762	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019978	CCGTA	2	10	18860	18869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019978	TGATT	2	10	20800	20809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019978	TTTAG	2	10	22716	22725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019978	TAATA	2	10	28982	28991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019978	GCTAT	2	10	34585	34594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019978	TACAT	2	10	38843	38852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019978	AGATT	2	10	39321	39330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019978	TATTT	2	10	39397	39406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019978	AAAGG	2	10	47508	47517	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019978	TTAGA	2	10	55465	55474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019978	TTACT	2	10	55517	55526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019978	TTATA	2	10	55705	55714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019978	CTAAC	2	10	64720	64729	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019978	TATTT	2	10	73614	73623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019978	TAAAA	2	10	79617	79626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019978	TAAAT	2	10	80777	80786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019978	ATGAT	2	10	96723	96732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019978	TATAA	2	10	103027	103036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019978	GTTTA	2	10	131344	131353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019978	AATCC	2	10	133249	133258	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019978	ATAGA	2	10	133350	133359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019978	CTTTT	2	10	133391	133400	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019978	AATGA	2	10	141762	141771	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019978	TCGTG	2	10	154928	154937	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019978	GGGAG	2	10	156069	156078	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019978	CCGTA	2	10	157176	157185	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019978	TATAA	2	10	163656	163665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019978	TAGAT	2	10	183877	183886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019978	TAAGC	2	10	185248	185257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019978	TTAAG	2	10	189851	189860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019978	TAATT	2	10	193389	193398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019978	TTGGT	2	10	211381	211390	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019978	TATAT	2	10	248314	248323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019978	TAAAT	2	10	255089	255098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019978	AGGAA	2	10	258378	258387	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019978	ATCAG	2	10	268006	268015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019978	AGATG	2	10	268056	268065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019978	TTAAT	2	10	279489	279498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019978	ATTAT	2	10	299123	299132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019978	TTGTA	2	10	300331	300340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019978	GATTT	2	10	318287	318296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019978	GAAGA	2	10	329863	329872	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019978	TTAAT	2	10	330262	330271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019978	TTAAT	2	10	330278	330287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019978	AATGA	2	10	347996	348005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019978	CTTAG	2	10	352078	352087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019978	TAAAT	2	10	352594	352603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019978	AAATT	2	10	355724	355733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019978	ATTTC	2	10	355775	355784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019978	AAAAT	2	10	356013	356022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019978	AAAGT	2	10	356799	356808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019978	TAATT	2	10	357831	357840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019978	GAAAT	2	10	359476	359485	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019978	TTAAT	2	10	361069	361078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019978	GGAAT	2	10	361633	361642	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019978	TTAAA	2	10	363424	363433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019978	ATTAA	2	10	363534	363543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019978	TGGAG	2	10	364008	364017	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019978	TAATT	2	10	367494	367503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019978	TAAAA	2	10	372885	372894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019978	AATTT	2	10	379223	379232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019978	TACCA	2	10	379378	379387	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_019978	AATAA	2	10	386922	386931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019978	AGTTG	2	10	398473	398482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019978	AATTA	2	10	405375	405384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019978	ATTTA	2	10	413436	413445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019978	AGGGG	2	10	424415	424424	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019978	ATTTT	2	10	426399	426408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019978	TTAAT	2	10	429406	429415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019978	TACCA	2	10	429565	429574	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_019978	TAATA	2	10	431874	431883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019978	TAAGA	2	10	434039	434048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019978	TAATA	2	10	434316	434325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019978	AGAGA	2	10	434659	434668	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019978	GAGCT	2	10	434734	434743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019978	GATCA	2	10	435710	435719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019978	AGTTA	2	10	440754	440763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019978	AGTAT	2	10	465041	465050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019978	TGATT	2	10	465284	465293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019978	TAAAA	2	10	465774	465783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019978	TTATT	2	10	467615	467624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019978	AGATT	2	10	471237	471246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019978	TCTTG	2	10	471314	471323	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019978	ATTAG	2	10	473352	473361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019978	ATTAT	2	10	475007	475016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019978	AAATT	2	10	475286	475295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019978	AGAAT	2	10	475491	475500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019978	AAAAT	2	10	475572	475581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019978	AAAGT	2	10	476419	476428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019978	GTTTT	2	10	476629	476638	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019978	TAAAT	2	10	480387	480396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019978	ATTTA	2	10	482415	482424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019978	GGTAA	2	10	486552	486561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019978	ATTAT	2	10	488713	488722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019978	TTATA	2	10	488874	488883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019978	TTATT	2	10	489938	489947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019978	ATTTA	2	10	491890	491899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019978	CTATA	2	10	492723	492732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019978	ATAAA	2	10	499921	499930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019978	ATATT	2	10	500791	500800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019978	AATGA	2	10	510285	510294	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019978	TTCAT	2	10	540507	540516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019978	TATAA	2	10	545382	545391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019978	TAAAA	2	10	547826	547835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019978	ATACA	2	10	550831	550840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019978	GGAAA	2	10	572645	572654	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019978	GGAGA	2	10	584491	584500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019978	ATATT	2	10	597217	597226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019978	AAAAT	2	10	601198	601207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019978	AAAAT	2	10	609454	609463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019978	AGAAA	2	10	611649	611658	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019978	GTTAA	2	10	611681	611690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019978	TTTTA	2	10	616449	616458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019978	GATAA	2	10	622335	622344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019978	TATAA	2	10	622460	622469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019978	ATTTA	2	10	655728	655737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019978	GGAGG	2	10	676809	676818	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019978	AATTT	2	10	682759	682768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019978	ATCTT	2	10	700382	700391	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019978	TATAA	2	10	700413	700422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019978	ATTTT	2	10	702263	702272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019978	AATTT	2	10	702281	702290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019978	AAAAT	2	10	704388	704397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019978	TAATT	3	15	708375	708389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019978	TTTAT	2	10	728234	728243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019978	TTTGT	2	10	728269	728278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019978	TTTAA	2	10	732685	732694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019978	TAAAT	2	10	737063	737072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019978	TAGTT	2	10	739301	739310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019978	TAAAA	2	10	749038	749047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019978	TATGA	2	10	753888	753897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019978	TAGAT	2	10	758164	758173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019978	TTTAA	2	10	759466	759475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019978	AATGA	2	10	762134	762143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019978	AATAT	2	10	763756	763765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019978	TATAT	2	10	764778	764787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019978	GATTA	2	10	773997	774006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019978	AAATT	2	10	793049	793058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019978	TGTAT	2	10	796531	796540	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019978	GAATA	2	10	806659	806668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019978	ATTTC	2	10	806982	806991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019978	TATTT	2	10	810963	810972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019978	AGATA	2	10	811030	811039	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019978	TACCA	2	10	811198	811207	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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490	NC_019978	AAATC	2	10	2638608	2638617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.