MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019977	AAGAAA	2	12	22966	22977	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019977	ATATTT	2	12	23101	23112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019977	TGAAAT	2	12	35422	35433	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019977	TATAAA	2	12	88175	88186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019977	TTTTCT	2	12	128303	128314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019977	TTGCTT	2	12	194625	194636	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019977	AAAATT	2	12	237481	237492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019977	TTATTT	2	12	256751	256762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019977	ATTCTC	2	12	275516	275527	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019977	CCCATT	2	12	317984	317995	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019977	TATAAA	2	12	327483	327494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019977	TATTTA	2	12	333092	333103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019977	TCAATA	2	12	366262	366273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019977	ATTTTT	2	12	369420	369431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019977	CATTTA	2	12	372758	372769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019977	TGCCAG	2	12	372978	372989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019977	ATAAAA	2	12	391109	391120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019977	TAAAAA	2	12	392214	392225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019977	CTTAAT	2	12	430603	430614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019977	CATCAA	2	12	431034	431045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019977	TAATTT	2	12	461404	461415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019977	TTTTTA	2	12	480717	480728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019977	TGGAAC	2	12	500214	500225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019977	TAGAAG	2	12	517689	517700	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019977	TATAAA	2	12	551128	551139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019977	TTTTTA	2	12	567255	567266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019977	ATTTTG	2	12	628040	628051	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019977	TATATT	2	12	630455	630466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019977	TAAAAA	2	12	696919	696930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019977	TATTCA	2	12	770371	770382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019977	TATAAA	2	12	772737	772748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019977	TTTTTA	2	12	781605	781616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019977	AGTTAA	2	12	784761	784772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019977	AAAGAA	2	12	803994	804005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019977	CATTTA	2	12	804351	804362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019977	TATCTG	2	12	828295	828306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019977	TATTTC	2	12	846916	846927	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019977	AATATA	2	12	859002	859013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019977	ATTAAT	2	12	876460	876471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019977	TTATAT	2	12	922307	922318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019977	TCCTTT	2	12	945964	945975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019977	GAAAAA	2	12	949159	949170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019977	TGAAAA	2	12	955585	955596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019977	TTATGT	2	12	996272	996283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019977	TATATT	2	12	998650	998661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019977	GAAAAA	2	12	1043603	1043614	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019977	ATAGGG	2	12	1058277	1058288	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019977	TTCCAT	2	12	1061848	1061859	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019977	CTTTTA	2	12	1085514	1085525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019977	TTTTTC	2	12	1120651	1120662	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019977	CTTATT	2	12	1142367	1142378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019977	ATGATT	2	12	1143496	1143507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019977	TCGGAT	2	12	1144613	1144624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019977	AAAATA	2	12	1169389	1169400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019977	TATCAA	2	12	1172968	1172979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019977	GTGAAA	2	12	1243002	1243013	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019977	AACAAA	2	12	1249911	1249922	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019977	GAACAT	2	12	1297831	1297842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019977	CCCCTG	2	12	1317966	1317977	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019977	TTTTGT	2	12	1325949	1325960	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019977	TTAATT	2	12	1352835	1352846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019977	ACACGG	2	12	1373178	1373189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019977	ATTCCA	2	12	1401586	1401597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019977	ATACTT	2	12	1408928	1408939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019977	CTGATA	2	12	1412749	1412760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019977	CTAAAA	2	12	1414248	1414259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019977	AATATG	2	12	1449921	1449932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019977	GATGGT	2	12	1462444	1462455	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019977	ATAATT	2	12	1469079	1469090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019977	ATTTGT	2	12	1477188	1477199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019977	AAACAA	2	12	1477811	1477822	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019977	ATAGGT	2	12	1483089	1483100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019977	TTACTT	2	12	1503155	1503166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019977	CTTTGA	2	12	1570516	1570527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019977	AAAACA	2	12	1617640	1617651	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019977	TTTTCT	2	12	1621722	1621733	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019977	AGTAAG	2	12	1631893	1631904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019977	TTTTCT	2	12	1651373	1651384	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019977	CTTTTT	2	12	1693090	1693101	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019977	AATATA	2	12	1801097	1801108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019977	TCAAGA	2	12	1801613	1801624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019977	ATAGCA	2	12	1806520	1806531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019977	ATAGGT	2	12	1824170	1824181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019977	GAATGA	2	12	1844444	1844455	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019977	ATTCAG	2	12	1877485	1877496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019977	AAATAT	2	12	1925793	1925804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019977	AAAAAG	2	12	1947784	1947795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019977	TATAAA	2	12	1957429	1957440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019977	AAAAGG	2	12	1966408	1966419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019977	AAAATT	2	12	1994586	1994597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019977	TTTTAT	2	12	2016621	2016632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019977	ATTCTC	2	12	2032214	2032225	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019977	TATATT	2	12	2088896	2088907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019977	GTAATT	2	12	2148210	2148221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019977	TACTTC	2	12	2215055	2215066	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019977	TTTGCA	2	12	2307206	2307217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019977	TATAAA	2	12	2314553	2314564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019977	CGATAT	2	12	2324541	2324552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019977	AAAGAT	2	12	2342681	2342692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019977	AACAAA	2	12	2345668	2345679	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019977	AAAGCT	2	12	2349073	2349084	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019977	TAAAAG	2	12	2357012	2357023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019977	CTGGAT	2	12	2358932	2358943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019977	TACTCT	2	12	2361041	2361052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019977	TTGAAT	2	12	2373096	2373107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.