MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978

Total Repeats: 26161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_019977	AAT	2	6	2416268	2416273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852534
26003	NC_019977	TCC	2	6	2416289	2416294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435852534
26004	NC_019977	GCA	2	6	2416433	2416438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852534
26005	NC_019977	CAA	2	6	2416452	2416457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852534
26006	NC_019977	CAA	2	6	2416509	2416514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852534
26007	NC_019977	TCA	2	6	2416554	2416559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852534
26008	NC_019977	AGA	2	6	2416646	2416651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852534
26009	NC_019977	TCT	2	6	2416739	2416744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852534
26010	NC_019977	GCA	2	6	2416865	2416870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852534
26011	NC_019977	TAA	2	6	2416959	2416964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852535
26012	NC_019977	GGC	2	6	2417189	2417194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435852535
26013	NC_019977	TGA	2	6	2417199	2417204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852535
26014	NC_019977	CAC	2	6	2417283	2417288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852535
26015	NC_019977	ATC	2	6	2417387	2417392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852535
26016	NC_019977	GCT	2	6	2417400	2417405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852535
26017	NC_019977	ATT	2	6	2417423	2417428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852535
26018	NC_019977	GCA	2	6	2417462	2417467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852535
26019	NC_019977	GCA	2	6	2417532	2417537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852535
26020	NC_019977	TTA	2	6	2417586	2417591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852535
26021	NC_019977	CTT	2	6	2417599	2417604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852535
26022	NC_019977	CTT	2	6	2417646	2417651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852535
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26025	NC_019977	ACT	2	6	2418279	2418284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852536
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26027	NC_019977	TCA	2	6	2418393	2418398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852536
26028	NC_019977	GCT	2	6	2418415	2418420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852536
26029	NC_019977	TGA	2	6	2418445	2418450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852536
26030	NC_019977	TGA	2	6	2418466	2418471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852536
26031	NC_019977	ATT	2	6	2418507	2418512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852536
26032	NC_019977	TGA	2	6	2418556	2418561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852536
26033	NC_019977	TGC	2	6	2418660	2418665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852536
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26040	NC_019977	TTA	2	6	2419264	2419269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852537
26041	NC_019977	GAT	2	6	2419310	2419315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852537
26042	NC_019977	TAG	2	6	2419424	2419429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852537
26043	NC_019977	TCA	3	9	2419435	2419443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852537
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26049	NC_019977	TGG	2	6	2419915	2419920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435852537
26050	NC_019977	TGC	2	6	2419935	2419940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852537
26051	NC_019977	ATC	2	6	2419944	2419949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852537
26052	NC_019977	TGC	2	6	2419980	2419985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852537
26053	NC_019977	TGT	2	6	2419989	2419994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852537
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26057	NC_019977	TCT	2	6	2420332	2420337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852537
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26101	NC_019977	TAC	2	6	2424765	2424770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
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26104	NC_019977	ATT	2	6	2424823	2424828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852543
26105	NC_019977	TCA	2	6	2424831	2424836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
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26108	NC_019977	TTC	2	6	2425169	2425174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852543
26109	NC_019977	AAT	2	6	2425224	2425229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852543
26110	NC_019977	CTA	2	6	2425257	2425262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
26111	NC_019977	CCA	2	6	2425283	2425288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852543
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26113	NC_019977	CTG	2	6	2425455	2425460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852543
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.