MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019976	TCAGC	2	10	2805	2814	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019976	AAGCG	2	10	4901	4910	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019976	CGAGG	2	10	16213	16222	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019976	CGATC	2	10	16335	16344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019976	GCCAA	2	10	19847	19856	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019976	AAGCG	2	10	28305	28314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019976	TCTCC	2	10	28884	28893	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_019976	TCCCC	2	10	28900	28909	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_019976	TATCG	2	10	29002	29011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019976	TCATA	2	10	30485	30494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019976	ATTAA	2	10	30496	30505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019976	TGTGT	2	10	34550	34559	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019976	ACTCA	2	10	36246	36255	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019976	TGCGG	2	10	52352	52361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019976	GCCAC	2	10	59153	59162	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_019976	CGATC	2	10	60487	60496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019976	TCCCG	2	10	77832	77841	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019976	TTCGG	2	10	93673	93682	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019976	CCGTC	2	10	93817	93826	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_019976	TCCCC	2	10	95937	95946	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_019976	CGAAG	2	10	100028	100037	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019976	CCGCC	2	10	102286	102295	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_019976	TACGC	2	10	102478	102487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019976	CCGAC	2	10	114781	114790	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_019976	CGTCG	2	10	114871	114880	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019976	GGCGA	2	10	115149	115158	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019976	GGAAC	2	10	115911	115920	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019976	GGACG	2	10	117448	117457	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019976	CTAAA	2	10	129213	129222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019976	ATATA	2	10	131720	131729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019976	CGTTC	2	10	132252	132261	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019976	TTGCG	2	10	136029	136038	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019976	ACGGA	2	10	136100	136109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019976	GTACG	2	10	136197	136206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019976	GCTCG	2	10	148797	148806	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019976	CTCTC	2	10	148945	148954	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_019976	ACAGA	2	10	149007	149016	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019976	CGTTC	2	10	156083	156092	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019976	TCGGT	2	10	158533	158542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019976	CGTCG	2	10	163402	163411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019976	TCGAT	2	10	164887	164896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019976	GGGGA	2	10	176631	176640	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019976	TATAC	2	10	187338	187347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019976	ATCCG	2	10	193393	193402	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019976	GATCG	2	10	200124	200133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019976	TTAGA	2	10	206920	206929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019976	AACCG	2	10	209453	209462	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019976	TCCGA	2	10	212395	212404	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019976	TTGTG	2	10	212467	212476	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019976	AAGCG	2	10	214357	214366	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019976	ACGGC	2	10	217159	217168	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_019976	GTCCC	2	10	249773	249782	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_019976	ACGCG	2	10	252220	252229	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019976	CCGGT	2	10	252275	252284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019976	TCGAC	2	10	256126	256135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019976	TCCCG	2	10	258016	258025	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_019976	ATCGA	2	10	278678	278687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019976	GATCA	2	10	282174	282183	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.