MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019976	CTTAT	2	10	2867	2876	20 %	60 %	0 %	20 %	435849399
2	NC_019976	ATGAG	2	10	3182	3191	40 %	20 %	40 %	0 %	435849399
3	NC_019976	TGCGT	2	10	5741	5750	0 %	40 %	40 %	20 %	435849400
4	NC_019976	CGTCG	2	10	8276	8285	0 %	20 %	40 %	40 %	435849401
5	NC_019976	TCGAT	2	10	8753	8762	20 %	40 %	20 %	20 %	435849401
6	NC_019976	GGTGA	2	10	19062	19071	20 %	20 %	60 %	0 %	435849408
7	NC_019976	GATCG	2	10	19691	19700	20 %	20 %	40 %	20 %	435849409
8	NC_019976	GATCC	2	10	23450	23459	20 %	20 %	20 %	40 %	435849413
9	NC_019976	TCGTT	2	10	26296	26305	0 %	60 %	20 %	20 %	435849415
10	NC_019976	CCTGG	2	10	26867	26876	0 %	20 %	40 %	40 %	435849415
11	NC_019976	CGATT	2	10	29674	29683	20 %	40 %	20 %	20 %	435849417
12	NC_019976	AGGAC	2	10	30075	30084	40 %	0 %	40 %	20 %	435849418
13	NC_019976	CAGTT	2	10	30189	30198	20 %	40 %	20 %	20 %	435849418
14	NC_019976	CGATT	2	10	37099	37108	20 %	40 %	20 %	20 %	435849427
15	NC_019976	GGTTC	2	10	38205	38214	0 %	40 %	40 %	20 %	435849428
16	NC_019976	TCGAC	2	10	39877	39886	20 %	20 %	20 %	40 %	435849429
17	NC_019976	CTCGC	2	10	43649	43658	0 %	20 %	20 %	60 %	435849434
18	NC_019976	GAGAT	2	10	46176	46185	40 %	20 %	40 %	0 %	435849438
19	NC_019976	TCCTC	2	10	47538	47547	0 %	40 %	0 %	60 %	435849440
20	NC_019976	CTTCG	2	10	47704	47713	0 %	40 %	20 %	40 %	435849440
21	NC_019976	ACAGC	2	10	48399	48408	40 %	0 %	20 %	40 %	435849440
22	NC_019976	AACTC	2	10	49159	49168	40 %	20 %	0 %	40 %	435849441
23	NC_019976	CGGAG	2	10	49474	49483	20 %	0 %	60 %	20 %	435849441
24	NC_019976	TCTGC	2	10	53215	53224	0 %	40 %	20 %	40 %	435849443
25	NC_019976	TCGGT	2	10	53343	53352	0 %	40 %	40 %	20 %	435849444
26	NC_019976	GTTGT	2	10	54248	54257	0 %	60 %	40 %	0 %	435849445
27	NC_019976	TCCCG	2	10	54374	54383	0 %	20 %	20 %	60 %	435849445
28	NC_019976	TTCCG	2	10	55675	55684	0 %	40 %	20 %	40 %	435849448
29	NC_019976	GTTCC	2	10	55758	55767	0 %	40 %	20 %	40 %	435849448
30	NC_019976	GTCGC	2	10	56346	56355	0 %	20 %	40 %	40 %	435849449
31	NC_019976	GGGAC	2	10	57009	57018	20 %	0 %	60 %	20 %	435849449
32	NC_019976	CCGTC	2	10	57968	57977	0 %	20 %	20 %	60 %	435849450
33	NC_019976	GCCGA	2	10	64620	64629	20 %	0 %	40 %	40 %	435849457
34	NC_019976	CGGTC	2	10	65461	65470	0 %	20 %	40 %	40 %	435849458
35	NC_019976	CTTTT	2	10	68460	68469	0 %	80 %	0 %	20 %	435849461
36	NC_019976	TCGAA	2	10	68528	68537	40 %	20 %	20 %	20 %	435849461
37	NC_019976	CGAAC	2	10	68593	68602	40 %	0 %	20 %	40 %	435849461
38	NC_019976	CGGAT	2	10	70900	70909	20 %	20 %	40 %	20 %	435849461
39	NC_019976	TGGTG	2	10	74953	74962	0 %	40 %	60 %	0 %	435849462
40	NC_019976	CCCAT	2	10	75676	75685	20 %	20 %	0 %	60 %	435849463
41	NC_019976	GTCGG	2	10	76481	76490	0 %	20 %	60 %	20 %	435849464
42	NC_019976	CCACG	2	10	76820	76829	20 %	0 %	20 %	60 %	435849464
43	NC_019976	CTTCG	2	10	78980	78989	0 %	40 %	20 %	40 %	435849467
44	NC_019976	CGTCG	2	10	83294	83303	0 %	20 %	40 %	40 %	435849471
45	NC_019976	CCGTC	2	10	83602	83611	0 %	20 %	20 %	60 %	435849471
46	NC_019976	TGTCG	2	10	89633	89642	0 %	40 %	40 %	20 %	435849476
47	NC_019976	TCGGT	2	10	89662	89671	0 %	40 %	40 %	20 %	435849476
48	NC_019976	GATCG	2	10	90506	90515	20 %	20 %	40 %	20 %	435849477
49	NC_019976	GGAAC	2	10	90706	90715	40 %	0 %	40 %	20 %	435849477
50	NC_019976	TCTCG	2	10	99061	99070	0 %	40 %	20 %	40 %	435849486
51	NC_019976	CGGAA	2	10	103213	103222	40 %	0 %	40 %	20 %	435849489
52	NC_019976	TACGA	2	10	103545	103554	40 %	20 %	20 %	20 %	435849490
53	NC_019976	CGGAT	2	10	103894	103903	20 %	20 %	40 %	20 %	435849490
54	NC_019976	GTATC	2	10	104238	104247	20 %	40 %	20 %	20 %	435849491
55	NC_019976	GATCG	2	10	104521	104530	20 %	20 %	40 %	20 %	435849492
56	NC_019976	TTCCG	2	10	104973	104982	0 %	40 %	20 %	40 %	435849493
57	NC_019976	GCCGG	2	10	106397	106406	0 %	0 %	60 %	40 %	435849494
58	NC_019976	GGACG	2	10	107068	107077	20 %	0 %	60 %	20 %	435849495
59	NC_019976	CCAGC	2	10	109497	109506	20 %	0 %	20 %	60 %	435849497
60	NC_019976	TGTGG	2	10	113157	113166	0 %	40 %	60 %	0 %	435849498
61	NC_019976	AAACC	2	10	118562	118571	60 %	0 %	0 %	40 %	435849500
62	NC_019976	GGCGA	2	10	120030	120039	20 %	0 %	60 %	20 %	435849501
63	NC_019976	CGGGA	2	10	120367	120376	20 %	0 %	60 %	20 %	435849501
64	NC_019976	GGACG	2	10	120709	120718	20 %	0 %	60 %	20 %	435849502
65	NC_019976	CGCGC	2	10	121588	121597	0 %	0 %	40 %	60 %	435849504
66	NC_019976	GAGCC	2	10	122613	122622	20 %	0 %	40 %	40 %	435849504
67	NC_019976	GGCGA	2	10	122646	122655	20 %	0 %	60 %	20 %	435849504
68	NC_019976	AGCGA	2	10	123814	123823	40 %	0 %	40 %	20 %	435849504
69	NC_019976	GCTCC	2	10	124345	124354	0 %	20 %	20 %	60 %	435849504
70	NC_019976	CGCGT	2	10	124476	124485	0 %	20 %	40 %	40 %	435849504
71	NC_019976	GTCGC	2	10	124530	124539	0 %	20 %	40 %	40 %	435849504
72	NC_019976	TCCGT	2	10	124749	124758	0 %	40 %	20 %	40 %	435849504
73	NC_019976	GACGG	2	10	125153	125162	20 %	0 %	60 %	20 %	435849505
74	NC_019976	AGGGA	2	10	125441	125450	40 %	0 %	60 %	0 %	435849505
75	NC_019976	GTCCC	2	10	126974	126983	0 %	20 %	20 %	60 %	435849507
76	NC_019976	AGTTC	2	10	129416	129425	20 %	40 %	20 %	20 %	435849509
77	NC_019976	CGGCG	2	10	132947	132956	0 %	0 %	60 %	40 %	435849513
78	NC_019976	CCGAT	2	10	133485	133494	20 %	20 %	20 %	40 %	435849514
79	NC_019976	ACCTG	2	10	137198	137207	20 %	20 %	20 %	40 %	435849519
80	NC_019976	ACCGG	2	10	137506	137515	20 %	0 %	40 %	40 %	435849520
81	NC_019976	CGACG	2	10	137943	137952	20 %	0 %	40 %	40 %	435849521
82	NC_019976	GTACC	2	10	138658	138667	20 %	20 %	20 %	40 %	435849522
83	NC_019976	GTCGG	2	10	138833	138842	0 %	20 %	60 %	20 %	435849522
84	NC_019976	ACCGA	2	10	143139	143148	40 %	0 %	20 %	40 %	435849526
85	NC_019976	GGACT	2	10	144073	144082	20 %	20 %	40 %	20 %	435849526
86	NC_019976	GGTCG	2	10	150810	150819	0 %	20 %	60 %	20 %	435849529
87	NC_019976	CCGGG	2	10	151571	151580	0 %	0 %	60 %	40 %	435849530
88	NC_019976	CGTCG	2	10	154678	154687	0 %	20 %	40 %	40 %	435849533
89	NC_019976	CGTTC	2	10	154852	154861	0 %	40 %	20 %	40 %	435849533
90	NC_019976	CAGCG	2	10	158170	158179	20 %	0 %	40 %	40 %	435849536
91	NC_019976	CGAAC	2	10	158301	158310	40 %	0 %	20 %	40 %	435849536
92	NC_019976	CCGTT	2	10	159600	159609	0 %	40 %	20 %	40 %	435849537
93	NC_019976	CAAAG	2	10	160908	160917	60 %	0 %	20 %	20 %	435849538
94	NC_019976	TTTCG	2	10	161006	161015	0 %	60 %	20 %	20 %	435849538
95	NC_019976	TCGGC	2	10	162375	162384	0 %	20 %	40 %	40 %	435849539
96	NC_019976	GATCC	2	10	164213	164222	20 %	20 %	20 %	40 %	435849541
97	NC_019976	GCGTC	2	10	164585	164594	0 %	20 %	40 %	40 %	435849541
98	NC_019976	TCGGC	2	10	165825	165834	0 %	20 %	40 %	40 %	435849542
99	NC_019976	CCAGA	2	10	167935	167944	40 %	0 %	20 %	40 %	435849544
100	NC_019976	ACCAG	2	10	168788	168797	40 %	0 %	20 %	40 %	435849544
101	NC_019976	GGACG	2	10	169288	169297	20 %	0 %	60 %	20 %	435849545
102	NC_019976	GATGC	2	10	169958	169967	20 %	20 %	40 %	20 %	435849547
103	NC_019976	GCCGC	2	10	175080	175089	0 %	0 %	40 %	60 %	435849553
104	NC_019976	TCGAC	2	10	176094	176103	20 %	20 %	20 %	40 %	435849554
105	NC_019976	CGTCC	2	10	176533	176542	0 %	20 %	20 %	60 %	435849554
106	NC_019976	CTTGC	2	10	177049	177058	0 %	40 %	20 %	40 %	435849555
107	NC_019976	CCCAG	2	10	181097	181106	20 %	0 %	20 %	60 %	435849560
108	NC_019976	CGTCG	2	10	181386	181395	0 %	20 %	40 %	40 %	435849560
109	NC_019976	CGTGG	2	10	183723	183732	0 %	20 %	60 %	20 %	435849560
110	NC_019976	CCGAC	2	10	183770	183779	20 %	0 %	20 %	60 %	435849560
111	NC_019976	TCGGC	2	10	185583	185592	0 %	20 %	40 %	40 %	435849561
112	NC_019976	AGACG	2	10	185883	185892	40 %	0 %	40 %	20 %	435849561
113	NC_019976	ACGGA	2	10	186068	186077	40 %	0 %	40 %	20 %	435849561
114	NC_019976	CGGTC	2	10	186434	186443	0 %	20 %	40 %	40 %	435849561
115	NC_019976	CGAAC	2	10	188170	188179	40 %	0 %	20 %	40 %	435849563
116	NC_019976	GCCGT	2	10	188849	188858	0 %	20 %	40 %	40 %	435849563
117	NC_019976	CCGAG	2	10	189128	189137	20 %	0 %	40 %	40 %	435849564
118	NC_019976	CGATC	2	10	191385	191394	20 %	20 %	20 %	40 %	435849566
119	NC_019976	CGAAC	2	10	191673	191682	40 %	0 %	20 %	40 %	435849566
120	NC_019976	CGTCC	2	10	192687	192696	0 %	20 %	20 %	60 %	435849568
121	NC_019976	CGTCC	2	10	193594	193603	0 %	20 %	20 %	60 %	435849569
122	NC_019976	GGGAC	2	10	196109	196118	20 %	0 %	60 %	20 %	435849570
123	NC_019976	GCGGG	2	10	196991	197000	0 %	0 %	80 %	20 %	435849570
124	NC_019976	GCGCC	2	10	198294	198303	0 %	0 %	40 %	60 %	435849571
125	NC_019976	GGACT	2	10	199481	199490	20 %	20 %	40 %	20 %	435849572
126	NC_019976	GCACC	2	10	202186	202195	20 %	0 %	20 %	60 %	435849575
127	NC_019976	ACCGA	2	10	206601	206610	40 %	0 %	20 %	40 %	435849581
128	NC_019976	GATCA	2	10	207509	207518	40 %	20 %	20 %	20 %	435849582
129	NC_019976	GTTCG	2	10	213347	213356	0 %	40 %	40 %	20 %	435849588
130	NC_019976	AGCCG	2	10	213602	213611	20 %	0 %	40 %	40 %	435849588
131	NC_019976	CGAAC	2	10	216073	216082	40 %	0 %	20 %	40 %	435849589
132	NC_019976	CTCGA	2	10	216423	216432	20 %	20 %	20 %	40 %	435849589
133	NC_019976	CGATG	2	10	220215	220224	20 %	20 %	40 %	20 %	435849593
134	NC_019976	GTTCG	2	10	222133	222142	0 %	40 %	40 %	20 %	435849595
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140	NC_019976	CGACC	2	10	231825	231834	20 %	0 %	20 %	60 %	435849602
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150	NC_019976	CGCGA	2	10	245512	245521	20 %	0 %	40 %	40 %	435849610
151	NC_019976	GGAAC	2	10	245835	245844	40 %	0 %	40 %	20 %	435849610
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163	NC_019976	TCCGA	2	10	261684	261693	20 %	20 %	20 %	40 %	435849624
164	NC_019976	CGAGA	2	10	261858	261867	40 %	0 %	40 %	20 %	435849624
165	NC_019976	GCTTC	2	10	261987	261996	0 %	40 %	20 %	40 %	435849624
166	NC_019976	AGACC	2	10	262360	262369	40 %	0 %	20 %	40 %	435849625
167	NC_019976	GAACG	2	10	262748	262757	40 %	0 %	40 %	20 %	435849625
168	NC_019976	ACCGG	2	10	264401	264410	20 %	0 %	40 %	40 %	435849626
169	NC_019976	CGATC	2	10	264998	265007	20 %	20 %	20 %	40 %	435849626
170	NC_019976	GCGTC	2	10	270171	270180	0 %	20 %	40 %	40 %	435849631
171	NC_019976	CGTTG	2	10	273578	273587	0 %	40 %	40 %	20 %	435849632
172	NC_019976	CGGCG	2	10	277606	277615	0 %	0 %	60 %	40 %	435849634
173	NC_019976	CATGG	2	10	281336	281345	20 %	20 %	40 %	20 %	435849636
174	NC_019976	TGGCC	2	10	284872	284881	0 %	20 %	40 %	40 %	435849639
175	NC_019976	GGAGT	2	10	286483	286492	20 %	20 %	60 %	0 %	435849640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.