MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 4169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019976	CTT	2	6	303	308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849397
2	NC_019976	GTC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849397
3	NC_019976	CGT	2	6	552	557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849397
4	NC_019976	TCC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849397
5	NC_019976	CTC	2	6	673	678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849397
6	NC_019976	TGT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849397
7	NC_019976	TCA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849397
8	NC_019976	GTT	2	6	920	925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849397
9	NC_019976	ACC	2	6	934	939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849397
10	NC_019976	AAT	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849398
11	NC_019976	GAA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849398
12	NC_019976	TGA	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
13	NC_019976	CAG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849398
14	NC_019976	CTT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849398
15	NC_019976	CTG	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849398
16	NC_019976	CGA	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849398
17	NC_019976	CGA	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849398
18	NC_019976	AAG	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849398
19	NC_019976	ATG	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
20	NC_019976	TCC	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849398
21	NC_019976	TGA	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
22	NC_019976	CTC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849398
23	NC_019976	ATG	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849398
24	NC_019976	ACT	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849398
25	NC_019976	AGA	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849398
26	NC_019976	TCG	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849398
27	NC_019976	AGG	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849398
28	NC_019976	CAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849399
29	NC_019976	CTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
30	NC_019976	ATC	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849399
31	NC_019976	GTC	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
32	NC_019976	TGA	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849399
33	NC_019976	CGA	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849399
34	NC_019976	ACC	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849399
35	NC_019976	GCG	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849399
36	NC_019976	TCG	2	6	3260	3265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
37	NC_019976	CGT	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
38	NC_019976	TAA	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849399
39	NC_019976	CAA	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849399
40	NC_019976	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849399
41	NC_019976	CTG	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
42	NC_019976	GTA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849399
43	NC_019976	ACC	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849399
44	NC_019976	AAC	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849399
45	NC_019976	TCG	3	9	3704	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849399
46	NC_019976	TCC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849399
47	NC_019976	ATC	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849399
48	NC_019976	GAG	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849399
49	NC_019976	ACG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849399
50	NC_019976	TAG	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849399
51	NC_019976	GAC	2	6	4168	4173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849399
52	NC_019976	CTC	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849399
53	NC_019976	TCG	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849400
54	NC_019976	CAT	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
55	NC_019976	TGA	2	6	5013	5018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849400
56	NC_019976	TTG	2	6	5123	5128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
57	NC_019976	AAC	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849400
58	NC_019976	CAG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849400
59	NC_019976	CTC	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849400
60	NC_019976	GTT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
61	NC_019976	CGT	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849400
62	NC_019976	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849400
63	NC_019976	GTT	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
64	NC_019976	ATC	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
65	NC_019976	TCG	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849400
66	NC_019976	TGT	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849400
67	NC_019976	TTC	2	6	5924	5929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849400
68	NC_019976	ATC	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
69	NC_019976	GGA	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849400
70	NC_019976	ATC	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849400
71	NC_019976	CGG	2	6	6159	6164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849400
72	NC_019976	TCG	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
73	NC_019976	AGT	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849401
74	NC_019976	CGT	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
75	NC_019976	GCT	2	6	7766	7771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
76	NC_019976	CTC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
77	NC_019976	ACG	2	6	7806	7811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849401
78	NC_019976	CTC	2	6	7981	7986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
79	NC_019976	CGT	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
80	NC_019976	CGC	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849401
81	NC_019976	ATC	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
82	NC_019976	CGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
83	NC_019976	GTT	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849401
84	NC_019976	GTC	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
85	NC_019976	TCC	2	6	8192	8197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
86	NC_019976	TCG	3	9	8255	8263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
87	NC_019976	TTC	2	6	8336	8341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849401
88	NC_019976	TCG	2	6	8348	8353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
89	NC_019976	TGC	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
90	NC_019976	TCC	2	6	8549	8554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849401
91	NC_019976	TTC	2	6	8599	8604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849401
92	NC_019976	TCG	2	6	8801	8806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
93	NC_019976	TCG	2	6	8915	8920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
94	NC_019976	ATC	2	6	8968	8973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
95	NC_019976	TCG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
96	NC_019976	CTT	2	6	9001	9006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849401
97	NC_019976	GTT	2	6	9018	9023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849401
98	NC_019976	TCG	2	6	9080	9085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
99	NC_019976	ATC	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
100	NC_019976	CCG	2	6	9196	9201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849401
101	NC_019976	CTG	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849401
102	NC_019976	TTC	2	6	9223	9228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849401
103	NC_019976	GCC	2	6	9296	9301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849401
104	NC_019976	ACG	2	6	9318	9323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849401
105	NC_019976	TCA	2	6	9386	9391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849401
106	NC_019976	TTG	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849401
107	NC_019976	TCG	2	6	10044	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849402
108	NC_019976	CGA	2	6	10087	10092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849402
109	NC_019976	AGG	2	6	10110	10115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849402
110	NC_019976	AGC	2	6	10185	10190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849402
111	NC_019976	TGC	2	6	10236	10241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849402
112	NC_019976	GCC	2	6	10254	10259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849402
113	NC_019976	GAT	2	6	10298	10303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849402
114	NC_019976	GCC	2	6	10367	10372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849402
115	NC_019976	ACC	2	6	10445	10450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849402
116	NC_019976	TCA	2	6	10455	10460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849402
117	NC_019976	GCT	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849402
118	NC_019976	CTG	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849402
119	NC_019976	TAC	2	6	10700	10705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849402
120	NC_019976	TGA	3	9	10710	10718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849402
121	NC_019976	CTC	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849402
122	NC_019976	CCG	2	6	10761	10766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849402
123	NC_019976	GAG	2	6	10781	10786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849402
124	NC_019976	GTC	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849402
125	NC_019976	CTC	2	6	10999	11004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849402
126	NC_019976	CTG	2	6	11036	11041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849402
127	NC_019976	CCG	2	6	11046	11051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849402
128	NC_019976	CGC	2	6	11101	11106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849402
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251	NC_019976	CGA	2	6	23535	23540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
252	NC_019976	GAC	2	6	23547	23552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
253	NC_019976	TCG	2	6	23555	23560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
254	NC_019976	TGC	2	6	23639	23644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
255	NC_019976	GAC	2	6	23695	23700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
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371	NC_019976	GAC	2	6	34085	34090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849422
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497	NC_019976	GCA	2	6	47306	47311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849439
498	NC_019976	CGA	2	6	47348	47353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849439
499	NC_019976	CTA	2	6	47506	47511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849440
500	NC_019976	TCG	2	6	47519	47524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849440

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