MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019976	CA	3	6	2496	2501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019976	TA	3	6	4272	4277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019976	GA	3	6	4605	4610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019976	AC	3	6	6246	6251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019976	AT	3	6	6435	6440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019976	TC	3	6	7317	7322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019976	AT	3	6	7325	7330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019976	GA	3	6	7430	7435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019976	CA	3	6	7445	7450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019976	AC	3	6	12465	12470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019976	TC	3	6	13016	13021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019976	CA	3	6	14397	14402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019976	AC	3	6	16430	16435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019976	CG	3	6	18377	18382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019976	AT	3	6	18645	18650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019976	GA	3	6	18753	18758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019976	CT	3	6	22427	22432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019976	GA	3	6	22547	22552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019976	GA	3	6	25564	25569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019976	GA	3	6	27640	27645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019976	AC	3	6	27671	27676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019976	TC	3	6	28095	28100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019976	TC	3	6	28915	28920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019976	TG	3	6	29019	29024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019976	TA	3	6	29721	29726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019976	CT	3	6	31937	31942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019976	GT	3	6	31948	31953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019976	AG	3	6	34762	34767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019976	AG	3	6	36455	36460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019976	TA	3	6	37020	37025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019976	AC	3	6	37039	37044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019976	TA	3	6	39047	39052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019976	GT	3	6	40739	40744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019976	AT	3	6	41407	41412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019976	AT	3	6	42687	42692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019976	AG	3	6	44945	44950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019976	TC	3	6	45117	45122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019976	AC	3	6	45639	45644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019976	GC	3	6	46542	46547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019976	GA	3	6	47101	47106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019976	GA	3	6	47445	47450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019976	AG	3	6	48649	48654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019976	AG	3	6	51504	51509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019976	GA	3	6	51667	51672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019976	GA	3	6	55384	55389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019976	GT	3	6	56050	56055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019976	CT	4	8	57085	57092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019976	AC	3	6	57301	57306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019976	CT	3	6	57369	57374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019976	CA	3	6	58594	58599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019976	TC	3	6	60646	60651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019976	GA	3	6	63209	63214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019976	CT	3	6	67453	67458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019976	CT	3	6	68277	68282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019976	AC	3	6	79375	79380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019976	AT	3	6	80567	80572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019976	CT	3	6	81246	81251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019976	GC	3	6	81339	81344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019976	GC	3	6	81648	81653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019976	CG	3	6	93687	93692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019976	TC	3	6	93843	93848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019976	CG	3	6	95124	95129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019976	CA	3	6	95294	95299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019976	GC	3	6	95361	95366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019976	CA	3	6	97988	97993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019976	GT	3	6	98618	98623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019976	GC	4	8	99725	99732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019976	TC	3	6	99842	99847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019976	GC	3	6	99909	99914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019976	GC	3	6	100089	100094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019976	AC	3	6	100204	100209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019976	GA	3	6	100296	100301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019976	AT	3	6	100485	100490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019976	CG	3	6	101443	101448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019976	GC	3	6	102626	102631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019976	TC	3	6	102801	102806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019976	GA	4	8	108316	108323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019976	TA	3	6	113279	113284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019976	AC	3	6	115696	115701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019976	CG	3	6	116045	116050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019976	GC	3	6	118037	118042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019976	GC	3	6	124973	124978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019976	AT	3	6	126546	126551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019976	AG	3	6	130023	130028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019976	TC	3	6	130094	130099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019976	CT	3	6	131181	131186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019976	TC	3	6	131212	131217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019976	TC	3	6	131343	131348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019976	AC	3	6	131460	131465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019976	AG	3	6	132275	132280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019976	TC	3	6	136082	136087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019976	AC	3	6	136314	136319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019976	GA	3	6	142818	142823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019976	TC	3	6	148523	148528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019976	TG	3	6	151858	151863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019976	CT	3	6	152431	152436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019976	CA	3	6	154021	154026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019976	GC	3	6	154384	154389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019976	TC	3	6	154428	154433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019976	GT	3	6	155206	155211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019976	TC	4	8	156091	156098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019976	TC	3	6	157482	157487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019976	CT	3	6	159863	159868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019976	TG	3	6	160147	160152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019976	GA	3	6	160160	160165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019976	TG	3	6	167129	167134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019976	AG	4	8	167159	167166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019976	GT	3	6	190165	190170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019976	CA	3	6	200366	200371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019976	GA	3	6	200442	200447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019976	CG	3	6	200452	200457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019976	CA	3	6	201648	201653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019976	AG	3	6	204284	204289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019976	AT	3	6	207099	207104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019976	GT	3	6	207993	207998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019976	GA	3	6	209483	209488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019976	GA	3	6	209611	209616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019976	AG	3	6	209988	209993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019976	AC	3	6	211538	211543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019976	GT	3	6	212329	212334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019976	CT	3	6	212436	212441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019976	GA	3	6	215186	215191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019976	GA	3	6	215360	215365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019976	TC	3	6	219244	219249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019976	AC	3	6	219933	219938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019976	CT	3	6	224163	224168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019976	AG	3	6	228087	228092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019976	CG	3	6	228360	228365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019976	GA	3	6	228442	228447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019976	AT	3	6	242783	242788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019976	TG	3	6	247105	247110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019976	GA	3	6	250939	250944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019976	AG	3	6	251144	251149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019976	GA	3	6	251866	251871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019976	GC	3	6	253290	253295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019976	GC	3	6	253558	253563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019976	AC	3	6	254253	254258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019976	TC	3	6	254424	254429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019976	GA	3	6	254524	254529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019976	CG	3	6	255593	255598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019976	TC	3	6	256147	256152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019976	TA	3	6	256606	256611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019976	GA	3	6	256681	256686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019976	GA	3	6	257853	257858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019976	AG	3	6	257998	258003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019976	TC	3	6	259416	259421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019976	CA	3	6	265629	265634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019976	GT	3	6	268825	268830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019976	TC	3	6	269120	269125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019976	GT	3	6	269526	269531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019976	GC	3	6	271856	271861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019976	GA	3	6	271872	271877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019976	GA	4	8	272401	272408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019976	AT	3	6	274535	274540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019976	GA	3	6	274613	274618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019976	AT	3	6	276650	276655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019976	AT	3	6	278655	278660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019976	CA	3	6	278746	278751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019976	GA	3	6	279090	279095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019976	GT	3	6	279111	279116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019976	GT	3	6	279147	279152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019976	GA	3	6	279155	279160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019976	AT	3	6	279347	279352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019976	AG	3	6	279471	279476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019976	AT	3	6	283030	283035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019976	AC	3	6	283740	283745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_019976	AT	3	6	283983	283988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019976	TA	3	6	285458	285463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019976	AG	3	6	285697	285702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019976	GA	3	6	285713	285718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.