MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019975	TGAT	2	8	594	601	25 %	50 %	25 %	0 %	435849358
2	NC_019975	CTAA	2	8	1310	1317	50 %	25 %	0 %	25 %	435849359
3	NC_019975	TCGG	2	8	1367	1374	0 %	25 %	50 %	25 %	435849359
4	NC_019975	ACTA	2	8	1736	1743	50 %	25 %	0 %	25 %	435849359
5	NC_019975	CCGT	2	8	2255	2262	0 %	25 %	25 %	50 %	435849360
6	NC_019975	TCGA	2	8	2275	2282	25 %	25 %	25 %	25 %	435849360
7	NC_019975	ACGA	2	8	3195	3202	50 %	0 %	25 %	25 %	435849363
8	NC_019975	CGAC	2	8	3519	3526	25 %	0 %	25 %	50 %	435849364
9	NC_019975	TCGA	2	8	5212	5219	25 %	25 %	25 %	25 %	435849367
10	NC_019975	GTTC	2	8	5871	5878	0 %	50 %	25 %	25 %	435849369
11	NC_019975	CGCT	2	8	5899	5906	0 %	25 %	25 %	50 %	435849369
12	NC_019975	TCCG	2	8	6265	6272	0 %	25 %	25 %	50 %	435849370
13	NC_019975	GTTC	2	8	6562	6569	0 %	50 %	25 %	25 %	435849371
14	NC_019975	CGAG	2	8	6711	6718	25 %	0 %	50 %	25 %	435849371
15	NC_019975	AAAG	2	8	7053	7060	75 %	0 %	25 %	0 %	435849372
16	NC_019975	GGAC	2	8	7671	7678	25 %	0 %	50 %	25 %	435849374
17	NC_019975	CTGT	2	8	8413	8420	0 %	50 %	25 %	25 %	435849375
18	NC_019975	AGTT	2	8	9492	9499	25 %	50 %	25 %	0 %	435849376
19	NC_019975	AGTC	2	8	10206	10213	25 %	25 %	25 %	25 %	435849377
20	NC_019975	GAAA	2	8	10709	10716	75 %	0 %	25 %	0 %	435849377
21	NC_019975	CGAC	2	8	10753	10760	25 %	0 %	25 %	50 %	435849377
22	NC_019975	TGCT	2	8	10828	10835	0 %	50 %	25 %	25 %	435849377
23	NC_019975	ACCG	2	8	12102	12109	25 %	0 %	25 %	50 %	435849377
24	NC_019975	TCGG	2	8	12289	12296	0 %	25 %	50 %	25 %	435849377
25	NC_019975	ACGG	2	8	12708	12715	25 %	0 %	50 %	25 %	435849377
26	NC_019975	ATTA	2	8	12921	12928	50 %	50 %	0 %	0 %	435849377

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.