MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019974	GAACGA	2	12	1048	1059	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019974	ACGGCC	2	12	14176	14187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019974	TCGACG	2	12	30268	30279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019974	GCGTTC	2	12	56818	56829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019974	GGAGCG	2	12	82541	82552	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019974	CTTCCG	2	12	90227	90238	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019974	CACTTT	2	12	91470	91481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019974	TTGCGC	2	12	159057	159068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019974	CGAGGA	2	12	221150	221161	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019974	CGCTCC	2	12	234621	234632	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019974	CGACGG	2	12	259569	259580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019974	TCACTT	2	12	280968	280979	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019974	TCGATC	2	12	286238	286249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019974	GGCGCG	2	12	327687	327698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019974	CTGAAA	2	12	355748	355759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019974	GCGGTC	2	12	363818	363829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019974	GGACGT	2	12	392415	392426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019974	AATCGA	2	12	431881	431892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019974	CGACAG	2	12	434357	434368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019974	GCTGGA	2	12	437641	437652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019974	ATCGAT	2	12	461260	461271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019974	TCCGTC	2	12	480661	480672	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019974	CGCGGC	2	12	520258	520269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019974	TCTCGG	2	12	535150	535161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019974	CGCGTC	2	12	606911	606922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019974	GTAGCG	2	12	658608	658619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019974	CGTATA	2	12	707035	707046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019974	TGGACG	2	12	710178	710189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019974	CGTCGC	2	12	722243	722254	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019974	CAAACC	2	12	733904	733915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019974	GCGCGG	2	12	742341	742352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019974	TGAACG	2	12	742402	742413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019974	GTCGCG	2	12	779952	779963	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019974	TTCGCG	2	12	800386	800397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019974	CCGGTA	2	12	800659	800670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019974	CGGTTC	2	12	803577	803588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019974	CGACGG	2	12	820792	820803	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019974	CGTACT	2	12	830147	830158	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019974	CCGCGG	2	12	918945	918956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019974	CGTTTG	3	18	925534	925551	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019974	ACGAGC	2	12	928447	928458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019974	GTGACA	2	12	930060	930071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019974	CGACAC	2	12	932680	932691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019974	ATCTAG	2	12	950239	950250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019974	GGGGGT	2	12	950385	950396	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019974	TCGGCG	2	12	981587	981598	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019974	AAACCG	2	12	995555	995566	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019974	CTGCAC	2	12	1029445	1029456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019974	TGACCG	2	12	1101617	1101628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019974	AAGATC	2	12	1151700	1151711	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019974	GCTTCG	2	12	1153590	1153601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019974	CCTCGG	2	12	1167120	1167131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019974	ACCGCC	2	12	1200438	1200449	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019974	ATACCG	2	12	1206350	1206361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019974	AACTAT	2	12	1214327	1214338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019974	CAGGTG	2	12	1239273	1239284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019974	AGGGAG	2	12	1269474	1269485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019974	AGCCGG	2	12	1278296	1278307	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019974	CGAGAT	2	12	1283958	1283969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019974	GCGACA	2	12	1284266	1284277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019974	CCGTTT	2	12	1308727	1308738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019974	CGCTCA	2	12	1326794	1326805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019974	CAGCGA	2	12	1352201	1352212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019974	GCTCGA	2	12	1371451	1371462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019974	GGACGA	3	18	1389956	1389973	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019974	GACCGG	2	12	1391388	1391399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019974	AGAGGG	2	12	1440413	1440424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019974	CAGTCG	2	12	1440669	1440680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019974	TCCCGG	2	12	1456094	1456105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019974	GCCGTT	2	12	1457337	1457348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019974	CGACGT	2	12	1468255	1468266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019974	AGCGTC	2	12	1516670	1516681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019974	CGGGGA	2	12	1528099	1528110	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019974	ATTTAT	2	12	1531586	1531597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019974	CAGTTG	2	12	1556628	1556639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019974	GAAGCG	2	12	1607193	1607204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019974	GTGGCC	2	12	1629387	1629398	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019974	ACAGCT	2	12	1658795	1658806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019974	CTGTCG	2	12	1712720	1712731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019974	ACTGAT	2	12	1734826	1734837	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019974	GTCGCT	2	12	1800870	1800881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019974	AACGAC	2	12	1815667	1815678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019974	GCGGCC	2	12	1826008	1826019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019974	CGAGCA	2	12	1826537	1826548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019974	CACTTT	2	12	1827669	1827680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019974	CGGACC	2	12	1849365	1849376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019974	GGACGA	2	12	1860403	1860414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019974	GACTGT	2	12	1867372	1867383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019974	TCGCGA	2	12	1889850	1889861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019974	TCGAAC	2	12	1949049	1949060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019974	GTCGGC	2	12	1959494	1959505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019974	TCCCGT	2	12	1993637	1993648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019974	TCTCGC	2	12	2005238	2005249	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019974	GAGCCG	2	12	2040924	2040935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019974	TGCCCG	2	12	2044450	2044461	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019974	CGCGAC	2	12	2069514	2069525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019974	CTCGCG	2	12	2069610	2069621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019974	CGGCGA	2	12	2082670	2082681	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019974	GCGACC	2	12	2083856	2083867	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019974	GACGTC	2	12	2091738	2091749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019974	CGGAGT	2	12	2124362	2124373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019974	GAACGC	2	12	2124553	2124564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019974	CCGCGA	2	12	2139297	2139308	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019974	CCGTGG	2	12	2145025	2145036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019974	CGAAGG	2	12	2145842	2145853	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019974	CTCGAA	2	12	2152703	2152714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019974	TCGCGA	2	12	2162544	2162555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019974	GACGGC	2	12	2180965	2180976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019974	ACTGCA	2	12	2192179	2192190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019974	ACCAAC	2	12	2215005	2215016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019974	TTTTCA	2	12	2217911	2217922	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019974	ACTTCG	2	12	2219870	2219881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019974	TCGCGG	2	12	2221952	2221963	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019974	AGTGAA	2	12	2230903	2230914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019974	CGGCGA	2	12	2276752	2276763	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019974	TCCCCC	2	12	2281758	2281769	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
117	NC_019974	TCCGGT	2	12	2282629	2282640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019974	GGTTCG	2	12	2302060	2302071	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019974	CGTCGA	2	12	2302260	2302271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019974	GTCGGT	2	12	2302378	2302389	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019974	GCACCG	2	12	2302607	2302618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019974	CGGACG	2	12	2337191	2337202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019974	CGCGGC	2	12	2391490	2391501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019974	GGCTTC	2	12	2406227	2406238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019974	CACGGG	2	12	2415803	2415814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019974	GACGTC	2	12	2432004	2432015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019974	CGTCGG	2	12	2456443	2456454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019974	TAGTCG	2	12	2480083	2480094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019974	GCCACA	2	12	2484009	2484020	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019974	CTCGCG	2	12	2488617	2488628	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019974	GTCGCC	2	12	2488765	2488776	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019974	CGAGCC	2	12	2488872	2488883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019974	CGCGAA	2	12	2488915	2488926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019974	AACTAC	2	12	2491867	2491878	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019974	ACACGA	2	12	2491911	2491922	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019974	GCGACG	2	12	2493560	2493571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019974	GGAATC	2	12	2517732	2517743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_019974	GGTGTG	2	12	2563605	2563616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019974	CGGCCG	2	12	2569384	2569395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019974	CGACGG	2	12	2586759	2586770	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019974	TTTCAC	2	12	2660519	2660530	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019974	GGTGGG	2	12	2680993	2681004	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_019974	CCGTCC	2	12	2768901	2768912	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019974	TGCCGT	2	12	2785804	2785815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_019974	ACGCGA	2	12	2895323	2895334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_019974	GCCGGC	2	12	2914606	2914617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019974	GAGTGG	2	12	2915308	2915319	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019974	CGGTCG	2	12	2915455	2915466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019974	CGACGT	2	12	2916096	2916107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_019974	ACCCAC	2	12	2935787	2935798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_019974	CACGAG	2	12	2947164	2947175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019974	CGTCTC	2	12	2955129	2955140	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
158	NC_019974	AGCGTC	2	12	2959361	2959372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_019974	CGTGTT	2	12	2983022	2983033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_019974	GGACTG	2	12	2993261	2993272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_019974	TTAATA	2	12	2993501	2993512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019974	ACGGCC	2	12	2997061	2997072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
164	NC_019974	CTTTCG	2	12	3028020	3028031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_019974	TTTCTC	2	12	3090780	3090791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_019974	ACGGTC	2	12	3133500	3133511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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201	NC_019974	CGTCCA	2	12	3630921	3630932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.