MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium australicum WSM2073

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019973	CGCCGA	2	12	59805	59816	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019973	CGTTTG	2	12	84312	84323	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019973	TTCAGT	2	12	94101	94112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019973	CAATGG	2	12	265184	265195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019973	CAGCCG	2	12	294309	294320	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019973	CAAAAT	2	12	315506	315517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019973	CCTTTG	2	12	316069	316080	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019973	TTGCCG	2	12	340451	340462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019973	GAGGGT	2	12	359182	359193	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019973	GAGGGG	2	12	359194	359205	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019973	TGCGCC	2	12	500469	500480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019973	GCCGGC	2	12	504331	504342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019973	GCCGGT	2	12	556996	557007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019973	GGTTGA	2	12	568672	568683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019973	CGTTTC	2	12	572204	572215	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019973	GCCCGC	2	12	581468	581479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019973	GCGCAA	2	12	585149	585160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019973	TCGATG	2	12	612868	612879	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019973	CGGATT	2	12	662662	662673	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019973	GCGCTG	2	12	670437	670448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019973	GCGCTG	2	12	688364	688375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019973	CACCCC	2	12	721874	721885	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_019973	TTCGTG	2	12	767449	767460	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019973	GGTCGA	2	12	814048	814059	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019973	CGCTCC	2	12	820563	820574	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019973	CGGGCG	2	12	875863	875874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019973	CCTTCG	2	12	885064	885075	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019973	CAAGCC	2	12	913354	913365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019973	CCGATG	2	12	918100	918111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019973	GCTGGT	2	12	949190	949201	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019973	TGAGAG	2	12	984344	984355	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019973	TTTTGG	2	12	1061770	1061781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019973	GGAAAA	2	12	1061856	1061867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019973	CGCGGA	2	12	1087615	1087626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019973	GCGCTG	2	12	1119231	1119242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019973	GTTTGG	2	12	1119508	1119519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019973	GATCGG	2	12	1125134	1125145	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019973	GACCGG	2	12	1190733	1190744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019973	CCGGCA	2	12	1214193	1214204	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019973	AGGCCG	2	12	1224583	1224594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019973	CCCGTT	2	12	1252414	1252425	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019973	CGAGGC	2	12	1254763	1254774	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019973	GAAAAG	2	12	1256275	1256286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019973	GAACGC	2	12	1299218	1299229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019973	AGGCGG	2	12	1315579	1315590	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019973	CAAAAA	2	12	1411441	1411452	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019973	GTTGCC	2	12	1412971	1412982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019973	CGTGTT	2	12	1422857	1422868	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019973	GCGCCG	2	12	1426116	1426127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019973	CCAGCG	2	12	1438129	1438140	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019973	GGGCGG	2	12	1449244	1449255	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019973	GAAGGA	2	12	1466261	1466272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019973	TTAGCG	2	12	1480383	1480394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019973	TCGCCG	2	12	1514352	1514363	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019973	ATTGGT	2	12	1714410	1714421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019973	TCCGGG	2	12	1743014	1743025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019973	TCCGGG	2	12	1750594	1750605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019973	TTTCTT	2	12	1773139	1773150	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019973	TCCCTC	2	12	1785466	1785477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019973	TCTTGA	2	12	1791395	1791406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019973	GGCTAT	2	12	1793482	1793493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019973	CGGGCG	2	12	1816454	1816465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019973	GCATGG	2	12	1838172	1838183	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019973	GCAAAA	2	12	1896868	1896879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019973	CTCCCG	2	12	1898016	1898027	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019973	AGCCGC	2	12	1898727	1898738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019973	CGTACG	2	12	1927159	1927170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019973	CGGGCG	2	12	2009856	2009867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019973	GCCCGC	2	12	2030472	2030483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019973	CACCGG	2	12	2032851	2032862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019973	GCTCGG	2	12	2037523	2037534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019973	CCGGCT	2	12	2042487	2042498	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019973	CAAAAA	2	12	2123205	2123216	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019973	CAATAA	2	12	2151144	2151155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019973	TCGGGT	2	12	2159852	2159863	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019973	GGCCGC	2	12	2188648	2188659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019973	CACGCG	2	12	2193746	2193757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019973	CCGATT	2	12	2234627	2234638	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019973	CGGCGA	2	12	2317260	2317271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019973	TGGCGC	2	12	2353601	2353612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019973	AGGGGA	2	12	2375356	2375367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019973	TCATGG	2	12	2385005	2385016	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019973	ACCCGC	2	12	2387913	2387924	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019973	GCGAGG	2	12	2420151	2420162	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019973	GCCGCT	2	12	2513651	2513662	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019973	GCTTTC	2	12	2516925	2516936	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019973	CGTTGG	2	12	2526028	2526039	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019973	CGAAGC	2	12	2559786	2559797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019973	ACCGGC	2	12	2595352	2595363	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019973	GGGCAA	2	12	2642449	2642460	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019973	CCGCTT	2	12	2644454	2644465	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019973	TCAGAA	2	12	2697113	2697124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019973	CGGCTT	2	12	2697170	2697181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019973	AGCCGC	2	12	2755566	2755577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019973	GGGGTC	2	12	2780821	2780832	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019973	CCAGAT	2	12	2785119	2785130	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019973	CTTTCG	2	12	2787120	2787131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019973	CCACCG	2	12	2798900	2798911	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019973	AGCTAA	2	12	2799231	2799242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019973	CCAGCT	2	12	2846138	2846149	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019973	CCGTTT	2	12	2851763	2851774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019973	CCGGTG	2	12	2869072	2869083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019973	TGCCAG	2	12	2869103	2869114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019973	AAGGCG	2	12	2911913	2911924	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019973	CGGCTT	2	12	2936014	2936025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019973	TGGCGG	2	12	2936256	2936267	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019973	AGGCTA	2	12	2939037	2939048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019973	TTTGCC	2	12	2973013	2973024	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019973	GCCTCG	2	12	3012807	3012818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019973	CGATCG	2	12	3035213	3035224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019973	GGCGCG	2	12	3072490	3072501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019973	GCGCGA	2	12	3127512	3127523	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019973	CCGTCT	2	12	3190974	3190985	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019973	CGGGCG	2	12	3212153	3212164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019973	CGTGGC	2	12	3220628	3220639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019973	CCGGCG	2	12	3221294	3221305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019973	GATGGC	2	12	3227419	3227430	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019973	AACCGG	2	12	3291384	3291395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019973	CGCCGT	2	12	3302375	3302386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019973	GCACGG	2	12	3433619	3433630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019973	AACGTG	2	12	3459328	3459339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019973	GACTCA	2	12	3478974	3478985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019973	GGATTC	2	12	3528905	3528916	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019973	CCGGCA	2	12	3535428	3535439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019973	TGCATC	2	12	3581188	3581199	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019973	ATTTGT	2	12	3698471	3698482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019973	ACATGT	2	12	3809307	3809318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019973	CTTTGC	2	12	3850436	3850447	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019973	GAAGGC	2	12	3870806	3870817	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019973	TAGAGG	2	12	3954978	3954989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019973	GGGATA	2	12	3957535	3957546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019973	GCTAGC	2	12	3968526	3968537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019973	GAGTTC	2	12	3983279	3983290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_019973	TCGAAC	2	12	3994233	3994244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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136	NC_019973	CGCAAG	2	12	4053182	4053193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_019973	GGCAAA	2	12	4104582	4104593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_019973	ACGCAG	2	12	4184582	4184593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019973	GACTGT	2	12	4190513	4190524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_019973	CTGGCG	2	12	4214761	4214772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019973	CATCGA	2	12	4216481	4216492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_019973	GCATTT	2	12	4229180	4229191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_019973	CCTTTC	2	12	4250765	4250776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019973	ACGGCC	2	12	4402288	4402299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019973	TGGCAA	2	12	4404463	4404474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_019973	ATCTTG	2	12	4409453	4409464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_019973	CGCAGG	2	12	4439924	4439935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019973	GCAACC	2	12	4460308	4460319	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019973	CGGAAC	2	12	4624486	4624497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019973	CATCGA	2	12	4768058	4768069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019973	CCGCGC	2	12	4815072	4815083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_019973	GAGGCG	2	12	4847270	4847281	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_019973	CTCAAT	2	12	4919765	4919776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019973	CGGTCG	2	12	4923473	4923484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019973	TTCCGG	2	12	4927125	4927136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019973	ATGGGG	2	12	4942936	4942947	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019973	CCGCTG	2	12	4968866	4968877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_019973	CGCACT	2	12	4995334	4995345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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239	NC_019973	CTGCCG	2	12	6002390	6002401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
240	NC_019973	GAGCCA	2	12	6016762	6016773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_019973	GCTCAA	2	12	6021239	6021250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_019973	GTTGCC	2	12	6036191	6036202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_019973	AAGCCG	2	12	6036733	6036744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_019973	AAGGCC	2	12	6037523	6037534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_019973	AGGAGA	2	12	6041928	6041939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
246	NC_019973	CAAGCA	2	12	6046199	6046210	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_019973	ATCACC	2	12	6053760	6053771	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
248	NC_019973	GGTGCC	2	12	6054343	6054354	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_019973	ATCAAT	2	12	6065228	6065239	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_019973	CCGCAT	2	12	6089413	6089424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
251	NC_019973	GCGCTT	2	12	6106593	6106604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_019973	TTTACG	2	12	6164049	6164060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.