MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	TCTAT	2	10	2314	2323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019972	TTTAT	2	10	17083	17092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019972	ATAGT	2	10	17203	17212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019972	CAAAA	2	10	17440	17449	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019972	TTAAA	2	10	18549	18558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019972	ATCAA	2	10	18961	18970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019972	ATAAA	2	10	44816	44825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019972	AAGAA	2	10	53848	53857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019972	CAAAA	2	10	64691	64700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019972	ACCAA	2	10	69953	69962	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019972	CTATC	2	10	70053	70062	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019972	GATAG	2	10	73369	73378	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019972	ATATT	2	10	78340	78349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019972	CTGGT	2	10	86772	86781	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019972	TTCTC	2	10	90398	90407	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019972	TGAAA	2	10	91090	91099	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019972	ATTTT	2	10	92882	92891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019972	TAATT	2	10	93582	93591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019972	ATTAT	2	10	100158	100167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019972	TTTGT	2	10	107476	107485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019972	CTCTT	2	10	111480	111489	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019972	CTAAA	2	10	112499	112508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019972	TTTAT	2	10	124092	124101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019972	TATTC	2	10	139273	139282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019972	TTTAA	2	10	144394	144403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019972	ATTTA	2	10	145588	145597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019972	CTTCA	2	10	156508	156517	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019972	AGTGG	2	10	158377	158386	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019972	AATTT	2	10	162070	162079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019972	GATAT	2	10	194574	194583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019972	ATTAT	2	10	195749	195758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019972	TTTTG	2	10	196833	196842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019972	TTCCT	2	10	202339	202348	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019972	TAATA	2	10	217298	217307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019972	TAAAA	2	10	220100	220109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019972	AATTA	2	10	230631	230640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019972	TGTGT	2	10	230661	230670	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019972	ATGAG	2	10	243276	243285	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019972	TTATA	2	10	255453	255462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019972	ATTTT	2	10	261694	261703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019972	ATGTG	2	10	262691	262700	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019972	AATAA	2	10	265414	265423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019972	CAAAA	2	10	265963	265972	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019972	CTTAT	2	10	266563	266572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019972	TTTCT	2	10	267159	267168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019972	GGCTA	2	10	267227	267236	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019972	ATATG	2	10	276292	276301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019972	GATAT	2	10	277086	277095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019972	CACTA	2	10	277745	277754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019972	ATATT	2	10	277814	277823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019972	TATTT	2	10	285090	285099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.