MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	TACA	2	8	236	243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019972	TAAA	2	8	315	322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019972	GTTT	2	8	5483	5490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019972	TAAT	2	8	6951	6958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019972	TATG	2	8	8538	8545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019972	CCCT	2	8	8606	8613	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_019972	AGGA	2	8	8632	8639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019972	TACA	2	8	8887	8894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019972	TCTT	2	8	8968	8975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019972	TTCT	2	8	10653	10660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019972	TGTT	2	8	11169	11176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019972	AGGA	2	8	11231	11238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019972	TTTG	2	8	12741	12748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019972	TTTG	2	8	13090	13097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019972	TGTT	2	8	13205	13212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019972	GTCT	2	8	13302	13309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019972	GTTG	2	8	13431	13438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019972	GATA	2	8	13495	13502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019972	AGGA	2	8	13581	13588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019972	TTTG	2	8	15352	15359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019972	ATTT	2	8	15495	15502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019972	ACAT	2	8	16364	16371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019972	TAAA	2	8	16469	16476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019972	AATT	2	8	16740	16747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019972	TTCA	2	8	16822	16829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019972	ATGT	2	8	16845	16852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019972	TAAA	2	8	17480	17487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019972	ACAA	2	8	17760	17767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019972	TTAA	2	8	18379	18386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019972	AAAT	2	8	18847	18854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019972	TACA	2	8	19271	19278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019972	TAAA	2	8	19311	19318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019972	TTTA	2	8	29977	29984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019972	TTAA	2	8	30036	30043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019972	ACTG	2	8	44698	44705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019972	ACAT	2	8	44707	44714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019972	AGAA	2	8	44808	44815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019972	GAAA	2	8	45067	45074	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019972	TTAT	2	8	50963	50970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019972	TCTT	2	8	53469	53476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019972	CATG	2	8	53872	53879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019972	GACA	2	8	53935	53942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019972	AGAA	2	8	54112	54119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019972	ACAA	2	8	58463	58470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019972	TAAA	2	8	70016	70023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019972	AATC	2	8	73113	73120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019972	AAGA	2	8	73187	73194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019972	AGAA	2	8	77109	77116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019972	TTTG	2	8	78280	78287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019972	CCCT	2	8	78605	78612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_019972	GTAA	2	8	78755	78762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019972	TTTA	2	8	84946	84953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019972	TGAA	2	8	84968	84975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019972	TCTA	2	8	86818	86825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019972	TTAT	2	8	90354	90361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019972	TTGA	2	8	93839	93846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019972	TAAA	2	8	94283	94290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019972	TTGA	2	8	94437	94444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019972	TGTA	2	8	94734	94741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019972	TAAT	2	8	94880	94887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019972	TTAC	2	8	96924	96931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019972	TTGC	2	8	100172	100179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019972	TATG	2	8	104473	104480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019972	AATA	2	8	104595	104602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019972	TTAG	2	8	105972	105979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019972	TATT	2	8	106172	106179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019972	AATT	2	8	110507	110514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019972	ATTT	2	8	111379	111386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019972	CAGA	2	8	111814	111821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019972	ATAG	2	8	112306	112313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019972	GAAG	2	8	116686	116693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019972	GAAA	2	8	125844	125851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019972	ATGT	2	8	125856	125863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019972	ATAG	2	8	125905	125912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019972	AGTA	2	8	125928	125935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019972	GCTT	2	8	132747	132754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019972	AATC	2	8	132792	132799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019972	ATGC	2	8	139297	139304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019972	TATG	2	8	139449	139456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019972	AAGT	2	8	140197	140204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019972	AAAC	2	8	144229	144236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019972	TTTA	2	8	144449	144456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019972	CTGT	2	8	144466	144473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019972	GAAA	2	8	153208	153215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019972	GAAA	2	8	153235	153242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019972	ATTG	2	8	156483	156490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019972	CTGC	2	8	158270	158277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019972	ATAA	2	8	158603	158610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019972	GAAA	2	8	160523	160530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019972	GGTA	2	8	160628	160635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019972	ATTG	2	8	162283	162290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019972	ATTA	2	8	167092	167099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019972	CTTC	2	8	167765	167772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019972	ATTT	2	8	174772	174779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019972	TTTC	2	8	174883	174890	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019972	TTCA	2	8	175216	175223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019972	ATCT	2	8	175234	175241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019972	GAAA	2	8	175594	175601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019972	AAGA	2	8	175739	175746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019972	GGAA	2	8	178187	178194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019972	CAAA	2	8	186966	186973	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019972	ATAA	2	8	187198	187205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019972	ATCT	2	8	194595	194602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019972	GTCT	2	8	194939	194946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019972	ATTC	2	8	195501	195508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019972	TTAT	2	8	195603	195610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019972	AAAG	2	8	195711	195718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019972	GAAG	2	8	195724	195731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019972	TATT	2	8	196537	196544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019972	AATA	2	8	196761	196768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019972	ATTA	2	8	196952	196959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019972	TTTA	2	8	202371	202378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019972	TTTG	2	8	203440	203447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019972	AAAT	2	8	210087	210094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019972	GTTT	2	8	212882	212889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019972	TGTT	2	8	216084	216091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019972	AATT	2	8	220015	220022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019972	AGAA	2	8	220114	220121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019972	ATTA	2	8	220128	220135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019972	GAAA	2	8	220799	220806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019972	CAGT	2	8	226706	226713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019972	TAAA	2	8	230650	230657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019972	GTTG	2	8	230885	230892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019972	CTAT	2	8	234049	234056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019972	TTGA	2	8	235323	235330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019972	CTTG	2	8	236447	236454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019972	TTTG	2	8	237040	237047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019972	TGCT	2	8	242308	242315	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019972	AAAG	2	8	244688	244695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019972	GAAT	2	8	244843	244850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019972	TTTA	2	8	245962	245969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019972	GTAT	2	8	245981	245988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019972	ATTT	2	8	246419	246426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019972	TAGT	2	8	247787	247794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019972	TGTT	2	8	250182	250189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019972	GTTA	2	8	251815	251822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019972	TTAT	2	8	254559	254566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019972	TACT	2	8	255484	255491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019972	CATT	2	8	255690	255697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019972	AGGA	2	8	255919	255926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019972	GATT	2	8	258811	258818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019972	TAAC	2	8	259032	259039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019972	ACAA	2	8	259354	259361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019972	CAAA	2	8	259387	259394	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019972	TTTG	2	8	261419	261426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019972	TTTA	2	8	261648	261655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019972	GAAG	2	8	262827	262834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019972	ATTT	2	8	262852	262859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019972	ACCA	2	8	263329	263336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019972	TGTA	2	8	263392	263399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019972	TTCT	2	8	264136	264143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019972	TTTC	2	8	266636	266643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019972	ATTT	2	8	267062	267069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019972	CTTT	2	8	267080	267087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_019972	TATG	2	8	267187	267194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019972	TCGT	2	8	270986	270993	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_019972	GTTG	2	8	271028	271035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019972	TTCC	2	8	272341	272348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019972	AGGT	2	8	272350	272357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019972	ATTC	2	8	275052	275059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_019972	TGTT	2	8	275874	275881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019972	CTTG	2	8	276017	276024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_019972	ATGT	2	8	279410	279417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019972	GATA	2	8	281991	281998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019972	ATGT	2	8	282062	282069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019972	ACCC	3	12	283457	283468	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
167	NC_019972	GGGT	2	8	283641	283648	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019972	TATC	2	8	283723	283730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.