MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	ATA	2	6	89	94	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019972	TTC	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019972	TAT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019972	ATA	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019972	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019972	TAT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019972	TTC	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019972	CTA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019972	TTG	2	6	1670	1675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019972	ATT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019972	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019972	ATT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019972	TTG	3	9	1915	1923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019972	ATT	2	6	1938	1943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019972	ATT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019972	TTG	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019972	ATT	2	6	2127	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019972	GTT	2	6	2165	2170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019972	ATT	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019972	TTG	3	9	2287	2295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019972	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019972	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019972	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019972	GTT	2	6	2537	2542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019972	AGA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019972	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019972	TTA	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019972	CAC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019972	TAT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019972	ATG	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019972	ACA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019972	TCA	2	6	8804	8809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019972	TTG	2	6	8850	8855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019972	ATA	2	6	8996	9001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019972	CAC	2	6	10569	10574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019972	TTC	2	6	10612	10617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019972	TAA	2	6	10646	10651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019972	GAT	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019972	GAA	2	6	10675	10680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019972	AAG	2	6	10682	10687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019972	CTA	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019972	TTA	2	6	11107	11112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019972	ACT	2	6	11200	11205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019972	ATA	2	6	12617	12622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019972	AAT	2	6	12812	12817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019972	AAT	2	6	13161	13166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019972	AGA	2	6	13221	13226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019972	TGG	4	12	13378	13389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019972	CTG	2	6	13395	13400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019972	TAC	2	6	13529	13534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019972	ACT	2	6	13548	13553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019972	CCT	2	6	13555	13560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_019972	ATT	3	9	15004	15012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019972	ATT	2	6	15139	15144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019972	TAA	2	6	15163	15168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019972	AGG	2	6	15313	15318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019972	AGG	2	6	15377	15382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019972	CCT	2	6	15400	15405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019972	GGT	2	6	15422	15427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019972	GGA	2	6	15526	15531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019972	CAC	2	6	16235	16240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019972	TTA	2	6	16486	16491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019972	TTA	2	6	16509	16514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019972	CAA	2	6	16522	16527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019972	TAA	2	6	16671	16676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019972	AAT	2	6	16696	16701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019972	ACT	2	6	16754	16759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019972	CTA	2	6	16804	16809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019972	ATC	2	6	16810	16815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019972	ATT	2	6	16816	16821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019972	AAT	2	6	16873	16878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019972	TAA	2	6	16958	16963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019972	AGT	2	6	16965	16970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019972	TTA	2	6	16983	16988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019972	TAA	2	6	17313	17318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019972	AAT	2	6	17380	17385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019972	AAG	3	9	17425	17433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019972	TTA	2	6	17463	17468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019972	AAC	2	6	17488	17493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019972	ATC	2	6	17511	17516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019972	AAT	2	6	17581	17586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019972	ATG	2	6	17618	17623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019972	TAT	2	6	17684	17689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019972	TTA	2	6	17694	17699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019972	TTC	2	6	17700	17705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019972	TCA	2	6	17943	17948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019972	ATA	2	6	18013	18018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019972	AAT	2	6	18097	18102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019972	ACT	2	6	18259	18264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019972	AGA	2	6	18316	18321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019972	TCT	2	6	18344	18349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019972	CAA	2	6	18361	18366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019972	TAT	2	6	18450	18455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019972	TAT	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019972	TCA	3	9	18584	18592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019972	CTA	2	6	18614	18619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019972	TAC	2	6	18634	18639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019972	TAA	2	6	18769	18774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019972	ATT	2	6	19106	19111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019972	AAC	2	6	19148	19153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019972	CTG	2	6	19196	19201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019972	ACC	2	6	19341	19346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019972	AAT	2	6	27141	27146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019972	AAT	2	6	27182	27187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019972	AAT	2	6	27192	27197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019972	TAG	2	6	27335	27340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019972	GTG	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019972	ATT	2	6	28999	29004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019972	AGT	2	6	29380	29385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019972	AAT	2	6	29400	29405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019972	AGC	2	6	30116	30121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019972	TGA	2	6	30194	30199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019972	GTT	2	6	30205	30210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019972	AAT	2	6	36679	36684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019972	TAA	2	6	36690	36695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019972	CAA	2	6	36706	36711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019972	ATT	2	6	36712	36717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019972	TCC	2	6	42569	42574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_019972	CTG	2	6	44018	44023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019972	TTG	2	6	44562	44567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019972	ATG	2	6	44603	44608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019972	TAT	2	6	44656	44661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019972	TAC	2	6	44792	44797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019972	TGC	2	6	44840	44845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019972	AAT	2	6	47531	47536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019972	TAT	2	6	51060	51065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019972	CAA	2	6	51207	51212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019972	GAA	3	9	51214	51222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019972	AGC	2	6	51287	51292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019972	ATG	2	6	53302	53307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019972	AAT	2	6	53312	53317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019972	GAT	2	6	53519	53524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019972	ACC	2	6	53551	53556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019972	GAA	2	6	53571	53576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019972	TGA	2	6	53584	53589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019972	GGT	2	6	53697	53702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019972	CTC	2	6	53829	53834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_019972	TCT	2	6	53917	53922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019972	TGC	2	6	54024	54029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019972	ACG	2	6	54032	54037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019972	TGA	2	6	54141	54146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019972	ATT	2	6	54255	54260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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