MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	TA	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019972	TA	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019972	TC	3	6	6942	6947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019972	TG	3	6	7950	7955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019972	TG	3	6	9065	9070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019972	CA	3	6	10087	10092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019972	TA	3	6	12626	12631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019972	CT	3	6	15267	15272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019972	TG	3	6	15366	15371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019972	TG	3	6	15413	15418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019972	AT	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019972	TA	3	6	17045	17050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019972	TA	3	6	17116	17121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019972	TA	3	6	18027	18032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019972	CA	3	6	18457	18462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019972	AT	3	6	18539	18544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019972	AT	3	6	18665	18670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019972	CA	3	6	19039	19044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019972	TG	3	6	19217	19222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019972	AT	3	6	19281	19286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019972	CA	3	6	19410	19415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019972	AT	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019972	AT	4	8	27110	27117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019972	AT	3	6	27155	27160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019972	AT	3	6	29320	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019972	AT	3	6	30128	30133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019972	AT	6	12	30164	30175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019972	TA	3	6	30286	30291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019972	TA	3	6	30314	30319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019972	TA	3	6	44591	44596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019972	AT	3	6	44635	44640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019972	TA	4	8	44780	44787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019972	AT	3	6	51064	51069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019972	TA	3	6	53273	53278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019972	AT	3	6	53399	53404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019972	CT	3	6	53513	53518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019972	AG	3	6	53577	53582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019972	GT	3	6	53783	53788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019972	GA	3	6	54299	54304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019972	TA	4	8	58455	58462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019972	TA	3	6	65148	65153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019972	TG	3	6	70001	70006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019972	CT	4	8	71197	71204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019972	AT	3	6	73636	73641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019972	TA	3	6	73682	73687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019972	GA	3	6	75540	75545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019972	AT	3	6	78295	78300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019972	TA	3	6	78689	78694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019972	AT	3	6	80160	80165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019972	TC	3	6	82923	82928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019972	TG	3	6	90300	90305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019972	TC	3	6	92293	92298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019972	AT	3	6	92319	92324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019972	TA	3	6	94119	94124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019972	TA	4	8	94168	94175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019972	TA	3	6	94717	94722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019972	AT	3	6	94801	94806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019972	AT	3	6	94815	94820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019972	AT	3	6	95007	95012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019972	AT	3	6	96185	96190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019972	AT	4	8	100143	100150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019972	AT	3	6	104549	104554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019972	AT	3	6	106857	106862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019972	AT	3	6	111132	111137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019972	TG	3	6	111315	111320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019972	AT	3	6	111804	111809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019972	TA	4	8	112458	112465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019972	AT	3	6	117650	117655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019972	TA	3	6	122670	122675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019972	AT	3	6	122677	122682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019972	TA	3	6	125934	125939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019972	TA	3	6	133574	133579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019972	AT	3	6	139457	139462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019972	AT	3	6	139530	139535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019972	CA	3	6	143266	143271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019972	AT	3	6	144288	144293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019972	AT	3	6	145601	145606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019972	AT	3	6	153269	153274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019972	TC	4	8	158573	158580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019972	TG	3	6	161999	162004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019972	TA	4	8	162147	162154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019972	CT	3	6	175084	175089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019972	CT	3	6	175149	175154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019972	AG	3	6	175228	175233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019972	TG	3	6	175309	175314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019972	AT	3	6	183968	183973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019972	TA	3	6	186975	186980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019972	AT	3	6	187052	187057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019972	AG	3	6	192573	192578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019972	TG	3	6	194757	194762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019972	GA	3	6	194849	194854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019972	GT	3	6	195639	195644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019972	AC	3	6	195789	195794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019972	AT	3	6	195874	195879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019972	TA	3	6	196519	196524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019972	AT	3	6	196649	196654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019972	TA	3	6	196712	196717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019972	AT	3	6	196753	196758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019972	TG	4	8	198234	198241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019972	TA	3	6	198643	198648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019972	AT	3	6	202793	202798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019972	TC	3	6	204125	204130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019972	AT	3	6	210113	210118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019972	AG	3	6	212940	212945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019972	AT	3	6	217322	217327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019972	GT	3	6	230673	230678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019972	CT	3	6	230690	230695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019972	TA	4	8	230735	230742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019972	TA	3	6	230828	230833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019972	GT	3	6	235312	235317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019972	AT	3	6	236463	236468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019972	AT	3	6	244869	244874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019972	TC	3	6	246088	246093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019972	TG	3	6	246494	246499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019972	AT	3	6	247823	247828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019972	TA	3	6	251666	251671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019972	AG	3	6	251756	251761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019972	AT	3	6	254411	254416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019972	AT	3	6	254438	254443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019972	TA	3	6	254847	254852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019972	AT	3	6	255821	255826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019972	AT	3	6	258971	258976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019972	AT	3	6	259653	259658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019972	TA	3	6	261596	261601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019972	GA	3	6	262806	262811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019972	TA	3	6	262838	262843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019972	TA	4	8	263000	263007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019972	AT	3	6	264151	264156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019972	AT	3	6	264159	264164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019972	TA	3	6	264247	264252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019972	AT	3	6	264272	264277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019972	CT	3	6	265463	265468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019972	CT	3	6	267107	267112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019972	TA	4	8	267219	267226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019972	TG	3	6	271001	271006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019972	TA	3	6	271095	271100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019972	TC	3	6	272165	272170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019972	AT	4	8	273174	273181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019972	TG	3	6	273186	273191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019972	AT	3	6	275935	275940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019972	AT	3	6	276284	276289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019972	AT	3	6	276821	276826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019972	AT	3	6	283371	283376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019972	GA	3	6	283758	283763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.