MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 1208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	TCGTG	2	10	4553	4562	0 %	40 %	40 %	20 %	433659173
2	NC_019971	AAGCT	2	10	6940	6949	40 %	20 %	20 %	20 %	433659175
3	NC_019971	ATCCT	2	10	8389	8398	20 %	40 %	0 %	40 %	433659176
4	NC_019971	CGGTG	2	10	9007	9016	0 %	20 %	60 %	20 %	433659177
5	NC_019971	CTTGG	2	10	9827	9836	0 %	40 %	40 %	20 %	433659177
6	NC_019971	TTTGG	2	10	10529	10538	0 %	60 %	40 %	0 %	433659178
7	NC_019971	GATTG	2	10	18806	18815	20 %	40 %	40 %	0 %	433659187
8	NC_019971	GGCTT	2	10	20160	20169	0 %	40 %	40 %	20 %	433659189
9	NC_019971	AGTTC	2	10	20993	21002	20 %	40 %	20 %	20 %	433659190
10	NC_019971	CTGTT	2	10	21147	21156	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019971	GCAAC	2	10	21387	21396	40 %	0 %	20 %	40 %	433659191
12	NC_019971	TCTTG	2	10	22452	22461	0 %	60 %	20 %	20 %	433659191
13	NC_019971	CATTG	2	10	23398	23407	20 %	40 %	20 %	20 %	433659193
14	NC_019971	CACGG	2	10	26066	26075	20 %	0 %	40 %	40 %	433659195
15	NC_019971	TGATC	2	10	28985	28994	20 %	40 %	20 %	20 %	433659198
16	NC_019971	TGGTG	2	10	30265	30274	0 %	40 %	60 %	0 %	433659199
17	NC_019971	CGCTT	2	10	34530	34539	0 %	40 %	20 %	40 %	433659204
18	NC_019971	CGAAT	2	10	37468	37477	40 %	20 %	20 %	20 %	433659208
19	NC_019971	CAACG	2	10	37578	37587	40 %	0 %	20 %	40 %	433659208
20	NC_019971	CCAAG	2	10	38340	38349	40 %	0 %	20 %	40 %	433659209
21	NC_019971	ATTTG	2	10	38437	38446	20 %	60 %	20 %	0 %	433659209
22	NC_019971	CTTGT	2	10	42401	42410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019971	AATTA	2	10	48546	48555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019971	AGAGA	2	10	52998	53007	60 %	0 %	40 %	0 %	433659224
25	NC_019971	AACCA	2	10	54931	54940	60 %	0 %	0 %	40 %	433659225
26	NC_019971	GCACC	2	10	56981	56990	20 %	0 %	20 %	60 %	433659228
27	NC_019971	ATGTT	2	10	60806	60815	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019971	TTTGG	2	10	61952	61961	0 %	60 %	40 %	0 %	433659233
29	NC_019971	CTGCG	2	10	63255	63264	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019971	ATCGC	2	10	66370	66379	20 %	20 %	20 %	40 %	433659238
31	NC_019971	TTTGG	2	10	69770	69779	0 %	60 %	40 %	0 %	433659241
32	NC_019971	ACTTA	2	10	70751	70760	40 %	40 %	0 %	20 %	433659243
33	NC_019971	CCAAG	2	10	73245	73254	40 %	0 %	20 %	40 %	433659245
34	NC_019971	ATGAA	2	10	73278	73287	60 %	20 %	20 %	0 %	433659246
35	NC_019971	AGGCA	2	10	73348	73357	40 %	0 %	40 %	20 %	433659246
36	NC_019971	AGTGC	2	10	74338	74347	20 %	20 %	40 %	20 %	433659247
37	NC_019971	AAAAT	2	10	75939	75948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019971	ACGGC	2	10	77263	77272	20 %	0 %	40 %	40 %	433659249
39	NC_019971	CGGTG	2	10	78362	78371	0 %	20 %	60 %	20 %	433659249
40	NC_019971	TTTTG	2	10	80963	80972	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019971	GTGAT	2	10	81022	81031	20 %	40 %	40 %	0 %	433659251
42	NC_019971	AGCAC	2	10	82021	82030	40 %	0 %	20 %	40 %	433659251
43	NC_019971	GCGCA	2	10	82391	82400	20 %	0 %	40 %	40 %	433659252
44	NC_019971	TTACT	2	10	83041	83050	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019971	AATTG	2	10	84946	84955	40 %	40 %	20 %	0 %	433659255
46	NC_019971	AACCG	2	10	85261	85270	40 %	0 %	20 %	40 %	433659255
47	NC_019971	CAGAA	2	10	87149	87158	60 %	0 %	20 %	20 %	433659257
48	NC_019971	CGAGC	2	10	94302	94311	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019971	ATTCC	2	10	94767	94776	20 %	40 %	0 %	40 %	433659263
50	NC_019971	GATTA	2	10	99183	99192	40 %	40 %	20 %	0 %	433659266
51	NC_019971	TTTCA	2	10	102043	102052	20 %	60 %	0 %	20 %	433659269
52	NC_019971	GTGAA	2	10	102449	102458	40 %	20 %	40 %	0 %	433659270
53	NC_019971	ACTTT	2	10	102941	102950	20 %	60 %	0 %	20 %	433659271
54	NC_019971	TCGTT	2	10	104418	104427	0 %	60 %	20 %	20 %	433659273
55	NC_019971	TTGGT	2	10	108591	108600	0 %	60 %	40 %	0 %	433659277
56	NC_019971	ACGCA	2	10	108852	108861	40 %	0 %	20 %	40 %	433659277
57	NC_019971	TGCAT	2	10	111046	111055	20 %	40 %	20 %	20 %	433659279
58	NC_019971	CGTGC	2	10	114308	114317	0 %	20 %	40 %	40 %	433659282
59	NC_019971	CAAAA	2	10	115358	115367	80 %	0 %	0 %	20 %	433659284
60	NC_019971	AATGG	2	10	120576	120585	40 %	20 %	40 %	0 %	433659289
61	NC_019971	AGTAA	2	10	121436	121445	60 %	20 %	20 %	0 %	433659290
62	NC_019971	CGAAA	2	10	121609	121618	60 %	0 %	20 %	20 %	433659290
63	NC_019971	GTTTT	2	10	122114	122123	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019971	CTTTG	2	10	123344	123353	0 %	60 %	20 %	20 %	433659292
65	NC_019971	GAGCA	2	10	125370	125379	40 %	0 %	40 %	20 %	433659294
66	NC_019971	GTGCT	2	10	126323	126332	0 %	40 %	40 %	20 %	433659296
67	NC_019971	CCAAC	2	10	126595	126604	40 %	0 %	0 %	60 %	433659296
68	NC_019971	TGGCT	2	10	127055	127064	0 %	40 %	40 %	20 %	433659297
69	NC_019971	ACCAA	2	10	128431	128440	60 %	0 %	0 %	40 %	433659298
70	NC_019971	GTTGC	2	10	131981	131990	0 %	40 %	40 %	20 %	433659301
71	NC_019971	TTGTT	2	10	132027	132036	0 %	80 %	20 %	0 %	433659301
72	NC_019971	GTAGT	2	10	133371	133380	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019971	GATGT	2	10	143321	143330	20 %	40 %	40 %	0 %	433659307
74	NC_019971	CCGAG	2	10	144842	144851	20 %	0 %	40 %	40 %	433659308
75	NC_019971	CGGTG	2	10	145447	145456	0 %	20 %	60 %	20 %	433659309
76	NC_019971	CGTAC	2	10	145946	145955	20 %	20 %	20 %	40 %	433659309
77	NC_019971	TAAAT	2	10	152579	152588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019971	AGCTA	2	10	154300	154309	40 %	20 %	20 %	20 %	433659318
79	NC_019971	CGCTG	2	10	157377	157386	0 %	20 %	40 %	40 %	433659323
80	NC_019971	GTTCG	2	10	157707	157716	0 %	40 %	40 %	20 %	433659323
81	NC_019971	TAATT	2	10	158621	158630	40 %	60 %	0 %	0 %	433659324
82	NC_019971	GGCTC	2	10	159707	159716	0 %	20 %	40 %	40 %	433659325
83	NC_019971	TTTCA	2	10	160602	160611	20 %	60 %	0 %	20 %	433659326
84	NC_019971	GCATC	2	10	166676	166685	20 %	20 %	20 %	40 %	433659329
85	NC_019971	CAAAC	2	10	166740	166749	60 %	0 %	0 %	40 %	433659329
86	NC_019971	GAGGC	2	10	166795	166804	20 %	0 %	60 %	20 %	433659329
87	NC_019971	TGTAT	2	10	168187	168196	20 %	60 %	20 %	0 %	433659330
88	NC_019971	CCACA	2	10	169185	169194	40 %	0 %	0 %	60 %	433659332
89	NC_019971	ATTCA	2	10	172439	172448	40 %	40 %	0 %	20 %	433659336
90	NC_019971	GGTGT	2	10	172576	172585	0 %	40 %	60 %	0 %	433659336
91	NC_019971	CTGGC	2	10	175191	175200	0 %	20 %	40 %	40 %	433659338
92	NC_019971	ACGAA	2	10	175886	175895	60 %	0 %	20 %	20 %	433659338
93	NC_019971	GCCAC	2	10	178349	178358	20 %	0 %	20 %	60 %	433659340
94	NC_019971	TTAAG	2	10	183191	183200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019971	TTTTG	2	10	186444	186453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019971	TGCAT	2	10	186593	186602	20 %	40 %	20 %	20 %	433659345
97	NC_019971	CGAAG	2	10	187472	187481	40 %	0 %	40 %	20 %	433659345
98	NC_019971	TTGGC	2	10	188152	188161	0 %	40 %	40 %	20 %	433659345
99	NC_019971	TTTGG	2	10	188492	188501	0 %	60 %	40 %	0 %	433659345
100	NC_019971	GTGTG	2	10	188524	188533	0 %	40 %	60 %	0 %	433659345
101	NC_019971	GCGCT	2	10	190124	190133	0 %	20 %	40 %	40 %	433659347
102	NC_019971	CTTTT	2	10	190502	190511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019971	TCCAA	2	10	191751	191760	40 %	20 %	0 %	40 %	433659348
104	NC_019971	GTTCA	2	10	192219	192228	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019971	CGGAC	2	10	193359	193368	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019971	TCTTT	2	10	193499	193508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019971	GATTC	2	10	193751	193760	20 %	40 %	20 %	20 %	433659350
108	NC_019971	TTTGG	2	10	196061	196070	0 %	60 %	40 %	0 %	433659352
109	NC_019971	CAAGG	2	10	196484	196493	40 %	0 %	40 %	20 %	433659352
110	NC_019971	GCTGC	2	10	198573	198582	0 %	20 %	40 %	40 %	433659354
111	NC_019971	GCCCG	2	10	201124	201133	0 %	0 %	40 %	60 %	433659355
112	NC_019971	GGGTA	2	10	201480	201489	20 %	20 %	60 %	0 %	433659355
113	NC_019971	GCCAT	2	10	201848	201857	20 %	20 %	20 %	40 %	433659355
114	NC_019971	GCAAG	2	10	202815	202824	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019971	TCAAC	2	10	205740	205749	40 %	20 %	0 %	40 %	433659357
116	NC_019971	TTACG	2	10	205824	205833	20 %	40 %	20 %	20 %	433659357
117	NC_019971	GCAAG	2	10	206136	206145	40 %	0 %	40 %	20 %	433659357
118	NC_019971	GCAAT	2	10	206774	206783	40 %	20 %	20 %	20 %	433659357
119	NC_019971	GCTAA	2	10	209691	209700	40 %	20 %	20 %	20 %	433659360
120	NC_019971	CCGCG	2	10	209719	209728	0 %	0 %	40 %	60 %	433659360
121	NC_019971	AGTGT	2	10	210795	210804	20 %	40 %	40 %	0 %	433659362
122	NC_019971	CAATA	2	10	211506	211515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019971	TTGCT	2	10	211653	211662	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019971	AAGTG	2	10	213571	213580	40 %	20 %	40 %	0 %	433659364
125	NC_019971	GAAGA	2	10	213764	213773	60 %	0 %	40 %	0 %	433659364
126	NC_019971	TGAAG	2	10	214987	214996	40 %	20 %	40 %	0 %	433659364
127	NC_019971	GATGC	2	10	216719	216728	20 %	20 %	40 %	20 %	433659364
128	NC_019971	GCTTT	2	10	217054	217063	0 %	60 %	20 %	20 %	433659365
129	NC_019971	GAGCA	2	10	217310	217319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019971	CCTTA	2	10	221368	221377	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019971	ACAGA	2	10	221911	221920	60 %	0 %	20 %	20 %	433659372
132	NC_019971	TGACC	2	10	222515	222524	20 %	20 %	20 %	40 %	433659373
133	NC_019971	TTGGC	2	10	227884	227893	0 %	40 %	40 %	20 %	433659376
134	NC_019971	CCAAG	2	10	228511	228520	40 %	0 %	20 %	40 %	433659377
135	NC_019971	AGCCA	2	10	229121	229130	40 %	0 %	20 %	40 %	433659377
136	NC_019971	CAAAC	2	10	230103	230112	60 %	0 %	0 %	40 %	433659378
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250	NC_019971	GCACG	2	10	373528	373537	20 %	0 %	40 %	40 %	433659518
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258	NC_019971	TGCAG	2	10	397273	397282	20 %	20 %	40 %	20 %	433659542
259	NC_019971	GATTT	2	10	397756	397765	20 %	60 %	20 %	0 %	433659542
260	NC_019971	TAAAT	2	10	398304	398313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019971	TCTTA	2	10	401493	401502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_019971	GCTAT	2	10	405249	405258	20 %	40 %	20 %	20 %	433659550
264	NC_019971	TTGGT	2	10	405592	405601	0 %	60 %	40 %	0 %	433659550
265	NC_019971	AAAGC	2	10	408403	408412	60 %	0 %	20 %	20 %	433659554
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