MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 5059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	CAAG	2	8	442	449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019971	TTTA	2	8	1078	1085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019971	ATCG	2	8	2003	2010	25 %	25 %	25 %	25 %	433659171
4	NC_019971	CAAC	2	8	2580	2587	50 %	0 %	0 %	50 %	433659171
5	NC_019971	AAAG	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	433659171
6	NC_019971	TCAA	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	433659171
7	NC_019971	TGAT	2	8	3161	3168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019971	CATT	2	8	3318	3325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019971	CATC	2	8	3711	3718	25 %	25 %	0 %	50 %	433659172
10	NC_019971	TGAA	2	8	5761	5768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019971	TGCT	2	8	6362	6369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019971	CAAC	2	8	7451	7458	50 %	0 %	0 %	50 %	433659175
13	NC_019971	CAAA	2	8	7477	7484	75 %	0 %	0 %	25 %	433659175
14	NC_019971	AGAT	2	8	7744	7751	50 %	25 %	25 %	0 %	433659176
15	NC_019971	CTTG	2	8	8290	8297	0 %	50 %	25 %	25 %	433659176
16	NC_019971	CAAG	2	8	8779	8786	50 %	0 %	25 %	25 %	433659177
17	NC_019971	ACTT	2	8	9555	9562	25 %	50 %	0 %	25 %	433659177
18	NC_019971	GATG	2	8	10132	10139	25 %	25 %	50 %	0 %	433659177
19	NC_019971	ATGA	2	8	10169	10176	50 %	25 %	25 %	0 %	433659177
20	NC_019971	TTAA	2	8	12349	12356	50 %	50 %	0 %	0 %	433659181
21	NC_019971	GAAA	2	8	12659	12666	75 %	0 %	25 %	0 %	433659180
22	NC_019971	CTCG	2	8	12979	12986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019971	TCAA	2	8	13634	13641	50 %	25 %	0 %	25 %	433659182
24	NC_019971	CACT	2	8	13755	13762	25 %	25 %	0 %	50 %	433659182
25	NC_019971	CAAA	2	8	14339	14346	75 %	0 %	0 %	25 %	433659183
26	NC_019971	ACGC	2	8	14473	14480	25 %	0 %	25 %	50 %	433659183
27	NC_019971	CTTG	2	8	14529	14536	0 %	50 %	25 %	25 %	433659184
28	NC_019971	TGAG	2	8	14782	14789	25 %	25 %	50 %	0 %	433659184
29	NC_019971	AACG	2	8	14874	14881	50 %	0 %	25 %	25 %	433659184
30	NC_019971	CGTG	2	8	14912	14919	0 %	25 %	50 %	25 %	433659184
31	NC_019971	AAAC	2	8	15254	15261	75 %	0 %	0 %	25 %	433659184
32	NC_019971	GCGT	2	8	15311	15318	0 %	25 %	50 %	25 %	433659184
33	NC_019971	TTTG	2	8	15691	15698	0 %	75 %	25 %	0 %	433659184
34	NC_019971	ATTG	2	8	15858	15865	25 %	50 %	25 %	0 %	433659185
35	NC_019971	CAAG	2	8	16347	16354	50 %	0 %	25 %	25 %	433659185
36	NC_019971	ATGG	2	8	16637	16644	25 %	25 %	50 %	0 %	433659186
37	NC_019971	AGCA	2	8	17515	17522	50 %	0 %	25 %	25 %	433659186
38	NC_019971	TTGT	2	8	17972	17979	0 %	75 %	25 %	0 %	433659187
39	NC_019971	ACTG	2	8	18131	18138	25 %	25 %	25 %	25 %	433659187
40	NC_019971	TAAT	2	8	18157	18164	50 %	50 %	0 %	0 %	433659187
41	NC_019971	CAGC	2	8	18347	18354	25 %	0 %	25 %	50 %	433659187
42	NC_019971	CAAA	2	8	18446	18453	75 %	0 %	0 %	25 %	433659187
43	NC_019971	TTGA	2	8	18537	18544	25 %	50 %	25 %	0 %	433659187
44	NC_019971	TGTT	2	8	19661	19668	0 %	75 %	25 %	0 %	433659188
45	NC_019971	GTTT	2	8	19712	19719	0 %	75 %	25 %	0 %	433659188
46	NC_019971	GTTT	2	8	20209	20216	0 %	75 %	25 %	0 %	433659189
47	NC_019971	TGGG	2	8	20349	20356	0 %	25 %	75 %	0 %	433659189
48	NC_019971	TCTA	2	8	20446	20453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019971	GGTT	2	8	20850	20857	0 %	50 %	50 %	0 %	433659190
50	NC_019971	ACCA	2	8	21175	21182	50 %	0 %	0 %	50 %	433659191
51	NC_019971	TTGG	2	8	21235	21242	0 %	50 %	50 %	0 %	433659191
52	NC_019971	GCAA	2	8	21620	21627	50 %	0 %	25 %	25 %	433659191
53	NC_019971	CGAG	2	8	22630	22637	25 %	0 %	50 %	25 %	433659191
54	NC_019971	AGGT	2	8	22733	22740	25 %	25 %	50 %	0 %	433659191
55	NC_019971	TATT	2	8	22896	22903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019971	CAAC	2	8	23136	23143	50 %	0 %	0 %	50 %	433659192
57	NC_019971	ATGG	2	8	23962	23969	25 %	25 %	50 %	0 %	433659193
58	NC_019971	GAAT	2	8	24270	24277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019971	AGCA	2	8	24616	24623	50 %	0 %	25 %	25 %	433659194
60	NC_019971	GGAA	2	8	25291	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019971	TAAG	2	8	25330	25337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019971	TGAA	2	8	25584	25591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019971	GGTT	2	8	25885	25892	0 %	50 %	50 %	0 %	433659195
64	NC_019971	TTTC	2	8	26868	26875	0 %	75 %	0 %	25 %	433659195
65	NC_019971	GGTC	2	8	27370	27377	0 %	25 %	50 %	25 %	433659196
66	NC_019971	GCAA	2	8	27567	27574	50 %	0 %	25 %	25 %	433659196
67	NC_019971	TCAC	2	8	27642	27649	25 %	25 %	0 %	50 %	433659196
68	NC_019971	AGAA	2	8	29100	29107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019971	AAAG	2	8	30136	30143	75 %	0 %	25 %	0 %	433659199
70	NC_019971	GTTC	2	8	31439	31446	0 %	50 %	25 %	25 %	433659200
71	NC_019971	TGGC	2	8	31482	31489	0 %	25 %	50 %	25 %	433659200
72	NC_019971	ATGA	2	8	31757	31764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019971	ATGA	2	8	32407	32414	50 %	25 %	25 %	0 %	433659201
74	NC_019971	ACTT	2	8	32487	32494	25 %	50 %	0 %	25 %	433659201
75	NC_019971	TCAC	2	8	33405	33412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019971	TAAT	2	8	33919	33926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019971	GAAA	2	8	34790	34797	75 %	0 %	25 %	0 %	433659204
78	NC_019971	CTTT	2	8	34921	34928	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019971	TGAT	2	8	35012	35019	25 %	50 %	25 %	0 %	433659205
80	NC_019971	AGCC	2	8	35625	35632	25 %	0 %	25 %	50 %	433659205
81	NC_019971	ATAA	2	8	35814	35821	75 %	25 %	0 %	0 %	433659206
82	NC_019971	CCAT	2	8	35986	35993	25 %	25 %	0 %	50 %	433659206
83	NC_019971	ACCA	2	8	36025	36032	50 %	0 %	0 %	50 %	433659206
84	NC_019971	TGTT	2	8	36159	36166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019971	ATCC	2	8	36882	36889	25 %	25 %	0 %	50 %	433659208
86	NC_019971	CCGA	2	8	36995	37002	25 %	0 %	25 %	50 %	433659208
87	NC_019971	TTGA	2	8	37167	37174	25 %	50 %	25 %	0 %	433659208
88	NC_019971	AATC	2	8	38232	38239	50 %	25 %	0 %	25 %	433659208
89	NC_019971	ACTG	2	8	38650	38657	25 %	25 %	25 %	25 %	433659209
90	NC_019971	TTGC	2	8	38690	38697	0 %	50 %	25 %	25 %	433659209
91	NC_019971	GTTT	2	8	38784	38791	0 %	75 %	25 %	0 %	433659211
92	NC_019971	TGAG	2	8	38853	38860	25 %	25 %	50 %	0 %	433659211
93	NC_019971	CGAA	2	8	39162	39169	50 %	0 %	25 %	25 %	433659210
94	NC_019971	GCGG	2	8	39386	39393	0 %	0 %	75 %	25 %	433659210
95	NC_019971	CAGA	2	8	40128	40135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019971	GATG	2	8	40896	40903	25 %	25 %	50 %	0 %	433659212
97	NC_019971	CCAT	2	8	40911	40918	25 %	25 %	0 %	50 %	433659212
98	NC_019971	AAAG	2	8	41048	41055	75 %	0 %	25 %	0 %	433659213
99	NC_019971	ACCA	2	8	41234	41241	50 %	0 %	0 %	50 %	433659213
100	NC_019971	ACAA	2	8	41730	41737	75 %	0 %	0 %	25 %	433659213
101	NC_019971	CCCG	2	8	41816	41823	0 %	0 %	25 %	75 %	433659213
102	NC_019971	GCAA	2	8	41849	41856	50 %	0 %	25 %	25 %	433659213
103	NC_019971	GTGA	2	8	42683	42690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019971	GTGA	2	8	42726	42733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019971	CAAG	2	8	43224	43231	50 %	0 %	25 %	25 %	433659215
106	NC_019971	CTGC	2	8	43295	43302	0 %	25 %	25 %	50 %	433659215
107	NC_019971	ACCA	2	8	43559	43566	50 %	0 %	0 %	50 %	433659215
108	NC_019971	CGAG	2	8	43676	43683	25 %	0 %	50 %	25 %	433659215
109	NC_019971	TTAC	2	8	43828	43835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019971	CATG	2	8	43885	43892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019971	CATT	2	8	44367	44374	25 %	50 %	0 %	25 %	433659216
112	NC_019971	CTTG	2	8	44645	44652	0 %	50 %	25 %	25 %	433659216
113	NC_019971	TGAG	2	8	44791	44798	25 %	25 %	50 %	0 %	433659217
114	NC_019971	TGGT	2	8	45047	45054	0 %	50 %	50 %	0 %	433659217
115	NC_019971	TTGG	2	8	45231	45238	0 %	50 %	50 %	0 %	433659217
116	NC_019971	ATTG	2	8	45305	45312	25 %	50 %	25 %	0 %	433659217
117	NC_019971	ATCG	2	8	45431	45438	25 %	25 %	25 %	25 %	433659217
118	NC_019971	TTGA	2	8	45630	45637	25 %	50 %	25 %	0 %	433659217
119	NC_019971	CTTG	2	8	45810	45817	0 %	50 %	25 %	25 %	433659218
120	NC_019971	GTCA	2	8	46287	46294	25 %	25 %	25 %	25 %	433659218
121	NC_019971	GCTT	2	8	46347	46354	0 %	50 %	25 %	25 %	433659218
122	NC_019971	ATGA	2	8	46774	46781	50 %	25 %	25 %	0 %	433659218
123	NC_019971	GAAC	2	8	47070	47077	50 %	0 %	25 %	25 %	433659218
124	NC_019971	GTAC	2	8	47814	47821	25 %	25 %	25 %	25 %	433659218
125	NC_019971	TAAA	2	8	48476	48483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019971	GAAT	2	8	48767	48774	50 %	25 %	25 %	0 %	433659219
127	NC_019971	AACG	2	8	49080	49087	50 %	0 %	25 %	25 %	433659219
128	NC_019971	ACAA	2	8	49230	49237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019971	TGAT	2	8	49302	49309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019971	AGCG	2	8	50002	50009	25 %	0 %	50 %	25 %	433659221
131	NC_019971	GAGC	2	8	50120	50127	25 %	0 %	50 %	25 %	433659221
132	NC_019971	TAGG	2	8	50838	50845	25 %	25 %	50 %	0 %	433659222
133	NC_019971	GTAG	2	8	51030	51037	25 %	25 %	50 %	0 %	433659222
134	NC_019971	CAAC	2	8	52013	52020	50 %	0 %	0 %	50 %	433659224
135	NC_019971	ACGG	2	8	52070	52077	25 %	0 %	50 %	25 %	433659224
136	NC_019971	CTGT	2	8	52278	52285	0 %	50 %	25 %	25 %	433659224
137	NC_019971	TCGC	2	8	52633	52640	0 %	25 %	25 %	50 %	433659224
138	NC_019971	GTTA	2	8	53057	53064	25 %	50 %	25 %	0 %	433659224
139	NC_019971	ACCA	2	8	53545	53552	50 %	0 %	0 %	50 %	433659225
140	NC_019971	GCTT	2	8	54482	54489	0 %	50 %	25 %	25 %	433659225
141	NC_019971	ATCA	2	8	54616	54623	50 %	25 %	0 %	25 %	433659225
142	NC_019971	TCGG	2	8	54664	54671	0 %	25 %	50 %	25 %	433659225
143	NC_019971	CGAG	2	8	55137	55144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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