MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	CAAG	2	8	442	449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019971	TTTA	2	8	1078	1085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019971	TGAT	2	8	3161	3168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019971	CATT	2	8	3318	3325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019971	TGAA	2	8	5761	5768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019971	TGCT	2	8	6362	6369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019971	CTCG	2	8	12979	12986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019971	TCTA	2	8	20446	20453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019971	TATT	2	8	22896	22903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019971	GAAT	2	8	24270	24277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019971	GGAA	2	8	25291	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019971	TAAG	2	8	25330	25337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019971	TGAA	2	8	25584	25591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019971	AGAA	2	8	29100	29107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019971	ATGA	2	8	31757	31764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019971	TCAC	2	8	33405	33412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019971	TAAT	2	8	33919	33926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019971	CTTT	2	8	34921	34928	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019971	TGTT	2	8	36159	36166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019971	CAGA	2	8	40128	40135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019971	GTGA	2	8	42683	42690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019971	GTGA	2	8	42726	42733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019971	TTAC	2	8	43828	43835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019971	CATG	2	8	43885	43892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019971	TAAA	2	8	48476	48483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019971	ACAA	2	8	49230	49237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019971	TGAT	2	8	49302	49309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019971	CGAG	2	8	55137	55144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019971	TTAT	2	8	61058	61065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019971	GAAT	2	8	62002	62009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019971	AGTG	2	8	63356	63363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019971	TAAG	2	8	63470	63477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019971	CAAT	2	8	68814	68821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019971	GCCA	2	8	71283	71290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019971	AAAT	2	8	72256	72263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019971	TTAC	2	8	74076	74083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019971	AGTT	2	8	79119	79126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019971	AGTC	2	8	84410	84417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019971	GTTT	2	8	85799	85806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019971	AGAT	2	8	89118	89125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019971	AAGC	2	8	89150	89157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019971	AAAC	2	8	89338	89345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019971	GCAT	2	8	89649	89656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019971	TGAT	2	8	89667	89674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019971	AATA	2	8	93473	93480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019971	AACG	2	8	97123	97130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019971	TAAA	2	8	99209	99216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019971	GTGG	2	8	99234	99241	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019971	TGGT	2	8	101719	101726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019971	TCGC	2	8	106882	106889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019971	TGAG	2	8	108355	108362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019971	GTGA	2	8	112523	112530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019971	TAGG	2	8	113440	113447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019971	TTTC	2	8	125422	125429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019971	AGTG	2	8	128109	128116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019971	TAAA	2	8	128196	128203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019971	ACTT	2	8	131840	131847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019971	TGAG	2	8	132490	132497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019971	AATT	2	8	132640	132647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019971	GTAG	2	8	134353	134360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019971	GCCT	2	8	134745	134752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019971	TGAC	2	8	135576	135583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019971	GTAC	2	8	135659	135666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019971	AGTA	2	8	136062	136069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019971	CGTC	2	8	136099	136106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019971	AAAG	2	8	136221	136228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019971	GTCG	2	8	138494	138501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019971	ATGA	2	8	138679	138686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019971	TCCC	2	8	140349	140356	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_019971	TAAA	2	8	140374	140381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019971	ATAA	2	8	145353	145360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019971	GATA	2	8	156571	156578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019971	CAAA	2	8	156889	156896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019971	CGCT	2	8	156937	156944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019971	GTTT	2	8	159171	159178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019971	ACAA	2	8	159256	159263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019971	TTTC	2	8	160331	160338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019971	CAAA	2	8	160417	160424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019971	TTAA	2	8	167442	167449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019971	TACT	2	8	170015	170022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019971	CTTT	2	8	170368	170375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019971	AAAT	2	8	171341	171348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019971	TTAG	2	8	172070	172077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019971	TTGC	2	8	173696	173703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019971	GTAC	2	8	174073	174080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019971	ACTA	2	8	174379	174386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019971	AATA	2	8	178126	178133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019971	TCCA	2	8	180238	180245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019971	TGAT	2	8	180296	180303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019971	AATA	2	8	184892	184899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019971	TTGT	2	8	185093	185100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019971	TTGA	2	8	190332	190339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019971	TATT	2	8	193088	193095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019971	TGTT	2	8	195989	195996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019971	GATT	2	8	198128	198135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019971	ATTA	2	8	200255	200262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019971	TAAA	2	8	202272	202279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019971	TGAT	2	8	202517	202524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019971	TAGT	2	8	204285	204292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019971	TGGC	2	8	204690	204697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019971	AAGC	2	8	204787	204794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019971	CCCA	2	8	204867	204874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_019971	GTTG	2	8	205401	205408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019971	TTGA	2	8	205474	205481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019971	ATAA	2	8	205697	205704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019971	AAGA	2	8	209405	209412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019971	TCTT	2	8	210895	210902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019971	TAAT	2	8	211219	211226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019971	TATT	2	8	211547	211554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019971	TCAT	2	8	211579	211586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019971	TTTA	2	8	211689	211696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019971	TCAC	2	8	218496	218503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019971	AATT	2	8	219491	219498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019971	AATT	2	8	224167	224174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019971	AATA	2	8	224256	224263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019971	AACA	2	8	224412	224419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019971	TATT	2	8	224753	224760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019971	TTCA	2	8	231012	231019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019971	TAAA	2	8	236130	236137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019971	CTTG	2	8	238077	238084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019971	GCTT	2	8	238092	238099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019971	CGCA	2	8	242416	242423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019971	GGGA	2	8	242512	242519	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019971	AGGA	2	8	242821	242828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019971	TTAA	2	8	242978	242985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019971	TAGA	2	8	243422	243429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019971	AAAC	2	8	243537	243544	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019971	AATT	2	8	249908	249915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019971	TGAG	2	8	249972	249979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019971	ATGA	2	8	250099	250106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019971	TTTC	2	8	252817	252824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019971	TTCC	2	8	253093	253100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019971	TGGA	2	8	254268	254275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019971	TGTT	2	8	257577	257584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019971	TCGG	2	8	260662	260669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019971	CAGT	2	8	260685	260692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019971	CTTC	2	8	260854	260861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019971	TATT	2	8	262729	262736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019971	GCTT	2	8	263263	263270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019971	TAAT	2	8	264112	264119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019971	TTGT	2	8	266788	266795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019971	GGGT	2	8	281861	281868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019971	ATAA	2	8	284249	284256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019971	TTTA	2	8	287087	287094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019971	TAAG	2	8	289188	289195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019971	TTTC	2	8	289292	289299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019971	TCGA	2	8	289387	289394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019971	TCAT	2	8	289472	289479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019971	CAGC	2	8	289494	289501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019971	GTCA	2	8	292330	292337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019971	GAGC	2	8	293116	293123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019971	ATAG	2	8	298195	298202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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