MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 23146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019971	GGA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019971	CAA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019971	CAT	2	6	814	819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019971	ATC	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019971	ATC	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019971	ATC	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019971	TAA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019971	AAT	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019971	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019971	TGA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
12	NC_019971	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
13	NC_019971	CTG	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
14	NC_019971	CAG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
15	NC_019971	CAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
16	NC_019971	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
17	NC_019971	TGC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
18	NC_019971	TGC	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
19	NC_019971	CAA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
20	NC_019971	TTG	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
21	NC_019971	CCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
22	NC_019971	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
23	NC_019971	CAC	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
24	NC_019971	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
25	NC_019971	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
26	NC_019971	GTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
27	NC_019971	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
28	NC_019971	CGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659171
29	NC_019971	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
30	NC_019971	CGT	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
31	NC_019971	GAA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
32	NC_019971	CTA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
33	NC_019971	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659171
34	NC_019971	TCT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659171
35	NC_019971	CCA	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
36	NC_019971	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
37	NC_019971	CAG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
38	NC_019971	CAT	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
39	NC_019971	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
40	NC_019971	GAT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019971	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019971	TTC	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019971	TTG	3	9	3500	3508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
44	NC_019971	TGC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659172
45	NC_019971	CAG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659172
46	NC_019971	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
47	NC_019971	AGG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659172
48	NC_019971	CAT	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659172
49	NC_019971	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659173
50	NC_019971	CTG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
51	NC_019971	AGT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
52	NC_019971	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659173
53	NC_019971	TTC	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
54	NC_019971	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659173
55	NC_019971	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659173
56	NC_019971	TCT	2	6	4370	4375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
57	NC_019971	CCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659173
58	NC_019971	TGC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
59	NC_019971	GAT	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
60	NC_019971	TCT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
61	NC_019971	TTG	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019971	GCT	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019971	ATG	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019971	TCA	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019971	TGA	2	6	5000	5005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019971	TTC	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019971	TTG	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019971	CAC	3	9	5067	5075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019971	ATG	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019971	TGA	3	9	5266	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019971	CCA	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019971	GGC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019971	ATT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019971	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019971	TGA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019971	TGA	2	6	5917	5922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019971	GGA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019971	GAA	4	12	6086	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
79	NC_019971	CAG	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659174
80	NC_019971	GAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
81	NC_019971	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019971	TTG	2	6	6430	6435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019971	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019971	CCA	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
85	NC_019971	ACT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659175
86	NC_019971	TTG	2	6	6598	6603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
87	NC_019971	ACA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
88	NC_019971	TCC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659175
89	NC_019971	ACC	2	6	6859	6864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
90	NC_019971	TGA	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
91	NC_019971	ATG	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
92	NC_019971	TCG	2	6	7150	7155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
93	NC_019971	GCG	2	6	7165	7170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659175
94	NC_019971	TGC	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
95	NC_019971	AGG	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659175
96	NC_019971	CAA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
97	NC_019971	GAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
98	NC_019971	TGC	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
99	NC_019971	TGA	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
100	NC_019971	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
101	NC_019971	AAG	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659175
102	NC_019971	TTG	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
103	NC_019971	TAA	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659176
104	NC_019971	GCG	2	6	7894	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659176
105	NC_019971	AGC	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659176
106	NC_019971	CTG	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659176
107	NC_019971	TTC	2	6	8139	8144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659176
108	NC_019971	GTT	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659176
109	NC_019971	TTG	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659176
110	NC_019971	TAA	2	6	8311	8316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659176
111	NC_019971	GCG	2	6	8329	8334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659176
112	NC_019971	GCA	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659176
113	NC_019971	ATT	3	9	8401	8409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019971	AAG	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
115	NC_019971	ATC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
116	NC_019971	GCG	2	6	9027	9032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659177
117	NC_019971	TGA	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659177
118	NC_019971	TTG	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
119	NC_019971	ATT	2	6	9242	9247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
120	NC_019971	GCT	2	6	9259	9264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659177
121	NC_019971	GCA	2	6	9286	9291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659177
122	NC_019971	ATC	2	6	9308	9313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
123	NC_019971	ATT	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
124	NC_019971	TTA	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
125	NC_019971	GAT	2	6	9428	9433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659177
126	NC_019971	AAC	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659177
127	NC_019971	TGG	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659177
128	NC_019971	CAT	2	6	9793	9798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
129	NC_019971	GGT	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659177
130	NC_019971	GTT	2	6	10007	10012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
131	NC_019971	GAA	2	6	10064	10069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
132	NC_019971	ATC	2	6	10196	10201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
133	NC_019971	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
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259	NC_019971	AAG	2	6	18607	18612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659187
260	NC_019971	GAT	2	6	18638	18643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659187
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275	NC_019971	CAT	2	6	19782	19787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_019971	GCG	2	6	20768	20773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659190
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295	NC_019971	GGC	2	6	21070	21075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_019971	TGA	2	6	36218	36223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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