MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019970	ATTAAA	2	12	12438	12449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019970	AAATAA	2	12	31030	31041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019970	CTAATT	2	12	34556	34567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019970	AAACAA	2	12	41230	41241	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019970	AGTAAG	2	12	47068	47079	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019970	AAGCGA	2	12	49664	49675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019970	ACGTTG	2	12	49775	49786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019970	TTTGTA	2	12	53247	53258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019970	AGTAAG	2	12	65745	65756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019970	AGCGAA	2	12	67720	67731	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019970	CAAAAA	2	12	67825	67836	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019970	AAGCGA	2	12	68549	68560	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019970	ACGTTG	2	12	68660	68671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019970	TGATAA	2	12	84801	84812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019970	TAACTC	2	12	93454	93465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019970	ATTGTC	2	12	136344	136355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019970	TATAAA	2	12	140061	140072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019970	TTATTT	2	12	156721	156732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019970	GTTTTT	2	12	178228	178239	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019970	TAAAAT	2	12	191152	191163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019970	AAATTT	2	12	210067	210078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019970	AAAATA	2	12	211270	211281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019970	ATAAAT	2	12	230484	230495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019970	ATTTTA	2	12	246018	246029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019970	AGATGG	2	12	359407	359418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019970	AGTAAG	2	12	403997	404008	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019970	AAGCGA	2	12	406799	406810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019970	ACGTTG	2	12	406910	406921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019970	TAAGCG	2	12	407378	407389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019970	AGCGAA	2	12	409443	409454	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019970	AGTAAT	2	12	413884	413895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019970	GATAAA	2	12	421949	421960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019970	AATTAA	2	12	431970	431981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019970	TTTTGA	2	12	432172	432183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019970	AGTTAT	2	12	442044	442055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019970	AGCTGG	2	12	445797	445808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019970	ACTTTT	2	12	449739	449750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019970	TTAATT	2	12	474324	474335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019970	ACAGGG	2	12	486942	486953	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019970	CATATA	2	12	487313	487324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019970	GAAAAA	2	12	489037	489048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019970	TAAATA	2	12	494128	494139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019970	TTTTAT	2	12	508091	508102	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019970	AGTAAG	2	12	524035	524046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019970	AAGCGA	2	12	526648	526659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019970	ACGTTG	2	12	526759	526770	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019970	AAGCGA	2	12	527230	527241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019970	TTTTTA	2	12	531176	531187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019970	TTGAAA	2	12	542400	542411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019970	ATTAGA	2	12	542426	542437	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019970	TAAAAA	2	12	595200	595211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019970	ATTAAC	2	12	626672	626683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019970	GCTTAA	2	12	640822	640833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019970	AAATCA	2	12	651444	651455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019970	TGACAT	2	12	687225	687236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019970	ATATTT	2	12	690323	690334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019970	TTTGGC	2	12	699709	699720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019970	TAAAAA	2	12	759673	759684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019970	GTGAAA	2	12	761838	761849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019970	TCTTGT	2	12	764401	764412	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019970	AATATG	2	12	778090	778101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019970	GGCCTT	2	12	797806	797817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019970	GGCAAA	2	12	802937	802948	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019970	CTATGC	2	12	806058	806069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019970	AGCATA	2	12	882804	882815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019970	AGCATA	2	12	890363	890374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019970	ATATAA	2	12	913915	913926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019970	TTACTT	2	12	926720	926731	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019970	GAAGGT	2	12	933594	933605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019970	ATTACA	2	12	953683	953694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019970	GTCGAT	2	12	998732	998743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019970	TAAGAT	2	12	1020546	1020557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019970	TAAAAA	2	12	1025461	1025472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019970	AATATA	2	12	1077224	1077235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019970	TTACAA	2	12	1097812	1097823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019970	ATTAAT	2	12	1103312	1103323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019970	ATGGGA	2	12	1108168	1108179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019970	TAATAT	2	12	1130449	1130460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019970	TTACAT	2	12	1157534	1157545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019970	GATTTT	2	12	1158150	1158161	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019970	TTATAA	2	12	1158693	1158704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019970	GTTTTT	2	12	1170000	1170011	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019970	ATCAAT	2	12	1191166	1191177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019970	ATTTTA	2	12	1215127	1215138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019970	TAGATG	2	12	1234297	1234308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019970	TATTTT	2	12	1285987	1285998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019970	CATTAT	2	12	1401609	1401620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019970	GAATAA	2	12	1401669	1401680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019970	CGCTTA	2	12	1470099	1470110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019970	TCAACG	2	12	1470568	1470579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019970	TCGCTT	2	12	1470680	1470691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019970	GCTTTC	2	12	1471563	1471574	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019970	ATAAAA	2	12	1507012	1507023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019970	ATAAAA	2	12	1520102	1520113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019970	ATTTAT	2	12	1548612	1548623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019970	TTAAAA	2	12	1565870	1565881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019970	ATCGAA	2	12	1574358	1574369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019970	TTTTTA	2	12	1623477	1623488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019970	GCTTTC	2	12	1634084	1634095	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019970	AGCTTC	2	12	1636895	1636906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019970	GTCCAT	2	12	1637005	1637016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019970	AATATT	2	12	1648216	1648227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019970	TTTTCC	2	12	1648773	1648784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019970	TTTGTA	2	12	1660300	1660311	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019970	CTATGC	2	12	1667473	1667484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019970	TCAGTA	2	12	1667792	1667803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019970	TTTTGC	2	12	1668162	1668173	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019970	GAAAAG	2	12	1681139	1681150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019970	TGCCAA	2	12	1682083	1682094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019970	CTTATT	2	12	1687558	1687569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019970	CTGTAT	2	12	1687695	1687706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019970	TTCACT	2	12	1688303	1688314	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019970	GCTGTT	2	12	1715682	1715693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019970	ATTTTT	2	12	1715769	1715780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019970	TCTGCG	2	12	1797086	1797097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019970	AAAGAT	2	12	1801461	1801472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019970	TCTCTA	2	12	1811975	1811986	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019970	ATTTCC	2	12	1839030	1839041	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019970	ACAAAA	2	12	1928261	1928272	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019970	TTATAA	2	12	1952756	1952767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019970	CCATGG	2	12	1953748	1953759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019970	ATTTTA	2	12	1954647	1954658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019970	TTTATG	2	12	1964457	1964468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019970	TGCATT	2	12	1964486	1964497	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019970	ATCTAA	2	12	1986731	1986742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019970	TAAAAT	2	12	2024047	2024058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019970	ATTTTA	2	12	2035271	2035282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019970	TTATAC	2	12	2069578	2069589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019970	TTAAAT	2	12	2070396	2070407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019970	ATAAAA	2	12	2079150	2079161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019970	AGAGGA	2	12	2081191	2081202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019970	TGAAAA	2	12	2081617	2081628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019970	TGTTGA	2	12	2094742	2094753	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019970	TTCTTT	2	12	2103789	2103800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019970	AATTTA	2	12	2110406	2110417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019970	AAAGCA	2	12	2117904	2117915	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_019970	GAAATT	2	12	2127698	2127709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019970	AATCCA	2	12	2164064	2164075	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019970	TATAAT	2	12	2169758	2169769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019970	TCATTA	2	12	2180759	2180770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_019970	ATTTCT	2	12	2181114	2181125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_019970	CGCTTA	2	12	2197186	2197197	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019970	CACCTG	2	12	2205007	2205018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019970	TAAAAA	2	12	2208244	2208255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019970	ATTATA	2	12	2208752	2208763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019970	TGCTAA	2	12	2211218	2211229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_019970	AGCGAA	2	12	2243185	2243196	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_019970	TTTTAT	2	12	2361066	2361077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019970	TATTTT	2	12	2364620	2364631	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019970	AACCAC	2	12	2367619	2367630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019970	TAATGT	2	12	2376748	2376759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019970	GTAAAA	2	12	2388157	2388168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019970	GAAAAT	2	12	2431600	2431611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019970	CTTATT	2	12	2438238	2438249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_019970	CTTTCG	2	12	2499528	2499539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019970	ATTTTA	2	12	2502265	2502276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019970	TCTCTT	2	12	2553042	2553053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019970	ATATTA	2	12	2572662	2572673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019970	AAAATG	2	12	2590735	2590746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019970	GCTTTC	2	12	2606955	2606966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_019970	TATTAA	2	12	2607051	2607062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019970	TGTTTT	2	12	2614269	2614280	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019970	TATTTT	2	12	2616137	2616148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019970	TTAACT	2	12	2652867	2652878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_019970	CAATTT	2	12	2653677	2653688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_019970	AAGCAA	2	12	2661254	2661265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_019970	TCCGAA	2	12	2666663	2666674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_019970	AAAAAC	2	12	2667778	2667789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_019970	AATTTT	2	12	2683601	2683612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019970	ATTCTT	2	12	2702172	2702183	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_019970	ACAAAA	2	12	2711590	2711601	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_019970	TGTTAC	2	12	2720074	2720085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_019970	ATAAAA	2	12	2754464	2754475	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.