MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 4500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	AGA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019967	CGA	2	6	34	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019967	GGT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019967	GAT	2	6	84	89	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019967	AGG	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019967	AGT	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019967	ACA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019967	CCA	2	6	296	301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019967	ACT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019967	GTG	2	6	381	386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019967	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
12	NC_019967	GAG	2	6	533	538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
13	NC_019967	GAG	2	6	545	550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
14	NC_019967	GAG	2	6	554	559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
15	NC_019967	CGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
16	NC_019967	AAC	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
17	NC_019967	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
18	NC_019967	CTG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
19	NC_019967	CAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
20	NC_019967	AAC	3	9	953	961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
21	NC_019967	ATG	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593319
22	NC_019967	GCT	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
23	NC_019967	CCT	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593319
24	NC_019967	GCA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
25	NC_019967	GGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
26	NC_019967	GAC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
27	NC_019967	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
28	NC_019967	ATC	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
29	NC_019967	ACT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
30	NC_019967	AAC	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
31	NC_019967	GCT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019967	GTG	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019967	GTG	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019967	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019967	TCG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019967	GAT	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019967	CTG	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
38	NC_019967	CTC	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593320
39	NC_019967	TCG	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
40	NC_019967	AGC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
41	NC_019967	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
42	NC_019967	ACG	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
43	NC_019967	GTT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593320
44	NC_019967	GGA	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593320
45	NC_019967	CAC	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
46	NC_019967	TCG	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
47	NC_019967	CGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
48	NC_019967	CAC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
49	NC_019967	TGA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593320
50	NC_019967	CGG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
51	NC_019967	CGG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
52	NC_019967	GTC	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019967	TCC	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019967	TCG	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
55	NC_019967	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
56	NC_019967	CGT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
57	NC_019967	TCC	3	9	3614	3622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
58	NC_019967	CCT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
59	NC_019967	CGT	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
60	NC_019967	ATC	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593321
61	NC_019967	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
62	NC_019967	CAG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
63	NC_019967	TCG	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
64	NC_019967	GAT	3	9	4243	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593321
65	NC_019967	CTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593321
66	NC_019967	TCT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019967	TCG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
68	NC_019967	GCG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
69	NC_019967	TCG	3	9	4831	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
70	NC_019967	GTC	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
71	NC_019967	GGC	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
72	NC_019967	GTC	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
73	NC_019967	GTC	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019967	CTC	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019967	TCG	2	6	5256	5261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019967	TGA	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019967	GTT	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019967	AGT	2	6	5326	5331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019967	CTA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019967	CGA	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019967	TGC	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019967	GCC	2	6	5545	5550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019967	ACG	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019967	CGA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019967	CTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
86	NC_019967	GCG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593323
87	NC_019967	TCG	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
88	NC_019967	GTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593323
89	NC_019967	GCT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
90	NC_019967	CGT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
91	NC_019967	CCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593323
92	NC_019967	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593323
93	NC_019967	AAC	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593323
94	NC_019967	CTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
95	NC_019967	GGT	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019967	TTC	3	9	6455	6463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
97	NC_019967	GTC	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
98	NC_019967	CGA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
99	NC_019967	CGC	3	9	6569	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
100	NC_019967	AGC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
101	NC_019967	CCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
102	NC_019967	CGC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
103	NC_019967	CGT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
104	NC_019967	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
105	NC_019967	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593324
106	NC_019967	TGA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593324
107	NC_019967	CGC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
108	NC_019967	AGG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593324
109	NC_019967	GCC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
110	NC_019967	GGA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593324
111	NC_019967	GCC	2	6	7017	7022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
112	NC_019967	GAC	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
113	NC_019967	GCC	2	6	7055	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
114	NC_019967	ATC	2	6	7062	7067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593324
115	NC_019967	TCG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
116	NC_019967	CGA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
117	NC_019967	TTC	2	6	7454	7459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
118	NC_019967	GGT	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593324
119	NC_019967	GTT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593324
120	NC_019967	CAC	2	6	7537	7542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019967	CAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019967	CGG	2	6	7667	7672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019967	GAT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019967	CGC	2	6	7813	7818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019967	TCG	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019967	TGG	2	6	7883	7888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019967	CGA	2	6	7899	7904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019967	GAA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019967	CTG	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019967	CTC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019967	GTC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019967	AAG	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593325
133	NC_019967	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
134	NC_019967	GCT	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
135	NC_019967	GCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
136	NC_019967	TCG	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593325
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163	NC_019967	TCG	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593327
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233	NC_019967	TTG	2	6	14155	14160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_019967	AGG	2	6	15587	15592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019967	GCC	2	6	15701	15706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_019967	ACC	2	6	15768	15773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_019967	ACA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_019967	CAC	2	6	15819	15824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_019967	GAA	2	6	15880	15885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_019967	TCT	2	6	15990	15995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_019967	ACA	2	6	16019	16024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_019967	CGC	2	6	16456	16461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_019967	TCC	2	6	16606	16611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_019967	GAG	2	6	16689	16694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593334
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268	NC_019967	GGT	2	6	16951	16956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_019967	AGG	2	6	17952	17957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_019967	GCC	2	6	23333	23338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593344
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