MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 3142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019966	CTCGGC	2	12	6178164	6178175	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650764
3002	NC_019966	CTCGAC	2	12	6179742	6179753	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433650765
3003	NC_019966	CCGCCA	2	12	6179848	6179859	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433650765
3004	NC_019966	CGCTGC	2	12	6182520	6182531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650770
3005	NC_019966	TCGGCG	2	12	6182745	6182756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650770
3006	NC_019966	GCCGCG	2	12	6182877	6182888	0 %	0 %	50 %	50 %	433650770
3007	NC_019966	GGGCTT	2	12	6185929	6185940	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433650774
3008	NC_019966	GACCTC	2	12	6187261	6187272	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433650775
3009	NC_019966	CGGCGA	2	12	6188165	6188176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433650777
3010	NC_019966	TGGGCA	2	12	6188455	6188466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433650777
3011	NC_019966	GGCCGC	2	12	6188720	6188731	0 %	0 %	50 %	50 %	433650778
3012	NC_019966	CCGATG	2	12	6191719	6191730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650782
3013	NC_019966	GTTGCC	2	12	6193811	6193822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433650784
3014	NC_019966	GGTTTT	2	12	6193874	6193885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433650784
3015	NC_019966	CAAGGC	2	12	6194336	6194347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433650785
3016	NC_019966	GCGACA	2	12	6194449	6194460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433650785
3017	NC_019966	GGTCGT	2	12	6196513	6196524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433650788
3018	NC_019966	CGTCGG	2	12	6196561	6196572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650788
3019	NC_019966	GTCGCG	2	12	6197027	6197038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650789
3020	NC_019966	ACCGCA	2	12	6197376	6197387	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433650789
3021	NC_019966	GTTGCG	2	12	6202505	6202516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433650795
3022	NC_019966	CGAGAC	2	12	6205564	6205575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433650799
3023	NC_019966	TCGCCG	2	12	6206458	6206469	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650801
3024	NC_019966	CTCGAC	2	12	6207867	6207878	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433650802
3025	NC_019966	TTGGCC	2	12	6210650	6210661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433650803
3026	NC_019966	GGTGCG	2	12	6210820	6210831	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433650803
3027	NC_019966	CCGCGG	2	12	6214097	6214108	0 %	0 %	50 %	50 %	433650804
3028	NC_019966	GCGTCG	2	12	6219250	6219261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650809
3029	NC_019966	CCGCGG	2	12	6219877	6219888	0 %	0 %	50 %	50 %	433650809
3030	NC_019966	GGCCGC	2	12	6222776	6222787	0 %	0 %	50 %	50 %	433650813
3031	NC_019966	ACGTCG	2	12	6227325	6227336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650820
3032	NC_019966	CCGAGC	2	12	6228092	6228103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650821
3033	NC_019966	CGGCGT	2	12	6230998	6231009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650825
3034	NC_019966	AGTGCA	2	12	6232624	6232635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433650826
3035	NC_019966	ATCGGT	2	12	6232875	6232886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433650826
3036	NC_019966	CGTCCA	2	12	6233585	6233596	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433650826
3037	NC_019966	TGGCGC	2	12	6235499	6235510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650827
3038	NC_019966	GGCGCA	2	12	6235580	6235591	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433650828
3039	NC_019966	AGACGG	2	12	6241134	6241145	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	433650836
3040	NC_019966	CGAACG	2	12	6241491	6241502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433650836
3041	NC_019966	GGCGCT	2	12	6244307	6244318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650840
3042	NC_019966	CGTCGA	2	12	6245629	6245640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650841
3043	NC_019966	CGCAGC	2	12	6247388	6247399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650842
3044	NC_019966	CGGCAT	2	12	6251553	6251564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650845
3045	NC_019966	TGGCCA	2	12	6252011	6252022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650845
3046	NC_019966	ACGTTC	2	12	6253438	6253449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433650848
3047	NC_019966	CGACGC	2	12	6255115	6255126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650849
3048	NC_019966	CCGCAG	2	12	6260226	6260237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650855
3049	NC_019966	CAGCAT	2	12	6261943	6261954	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433650858
3050	NC_019966	TCGCCG	2	12	6262082	6262093	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650858
3051	NC_019966	GGCCGA	2	12	6263513	6263524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433650860
3052	NC_019966	TGGCGT	2	12	6264188	6264199	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433650861
3053	NC_019966	CCGTGG	2	12	6264699	6264710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650862
3054	NC_019966	GGTGTT	2	12	6264884	6264895	0 %	50 %	50 %	0 %	433650862
3055	NC_019966	CGCTCG	2	12	6274501	6274512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650870
3056	NC_019966	CCAGCG	2	12	6278417	6278428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650874
3057	NC_019966	GAATGC	2	12	6278844	6278855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433650874
3058	NC_019966	CGCCGG	2	12	6280774	6280785	0 %	0 %	50 %	50 %	433650876
3059	NC_019966	TCCGGT	2	12	6280949	6280960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433650876
3060	NC_019966	CTGGCA	2	12	6283034	6283045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650880
3061	NC_019966	GCGGCC	2	12	6284693	6284704	0 %	0 %	50 %	50 %	433650880
3062	NC_019966	GGGCAT	2	12	6285755	6285766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433650882
3063	NC_019966	TGACCT	2	12	6287587	6287598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433650884
3064	NC_019966	GATGCC	2	12	6291125	6291136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650887
3065	NC_019966	AACCAA	2	12	6291395	6291406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433650887
3066	NC_019966	CGCTGG	2	12	6293837	6293848	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650890
3067	NC_019966	GAACGC	2	12	6296313	6296324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433650892
3068	NC_019966	ATCGGC	2	12	6297877	6297888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650895
3069	NC_019966	GGCGAT	2	12	6298092	6298103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433650895
3070	NC_019966	CAGGGG	2	12	6300272	6300283	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	433650896
3071	NC_019966	TCGGTG	2	12	6301436	6301447	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433650898
3072	NC_019966	CCTGTT	2	12	6305590	6305601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433650902
3073	NC_019966	TTCATT	2	12	6306563	6306574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	433650902
3074	NC_019966	TGGTCA	2	12	6306813	6306824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433650902
3075	NC_019966	GAACAA	2	12	6308080	6308091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	433650904
3076	NC_019966	GCGCCG	2	12	6309670	6309681	0 %	0 %	50 %	50 %	433650908
3077	NC_019966	CAACGC	2	12	6311469	6311480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433650912
3078	NC_019966	CGCGGC	2	12	6312414	6312425	0 %	0 %	50 %	50 %	433650912
3079	NC_019966	CTGCCG	2	12	6314339	6314350	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650915
3080	NC_019966	CGACGT	2	12	6315939	6315950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650917
3081	NC_019966	TTCGGC	2	12	6316621	6316632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433650918
3082	NC_019966	TCGGCA	2	12	6318426	6318437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650919
3083	NC_019966	ATCACC	2	12	6318561	6318572	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433650919
3084	NC_019966	GCGGGC	2	12	6320996	6321007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433650922
3085	NC_019966	CGACGG	2	12	6324227	6324238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433650927
3086	NC_019966	GGCGAG	2	12	6325096	6325107	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	433650929
3087	NC_019966	GGTCAG	2	12	6333834	6333845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433650939
3088	NC_019966	GGCCGC	2	12	6334410	6334421	0 %	0 %	50 %	50 %	433650939
3089	NC_019966	CGGTCG	2	12	6334916	6334927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650940
3090	NC_019966	AGCACC	2	12	6337040	6337051	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433650940
3091	NC_019966	GACCAC	2	12	6340297	6340308	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433650943
3092	NC_019966	CAGCGC	2	12	6340780	6340791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650944
3093	NC_019966	CGGCAT	2	12	6343458	6343469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650946
3094	NC_019966	CAGCGT	2	12	6345107	6345118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650948
3095	NC_019966	CCTCGG	2	12	6347025	6347036	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650951
3096	NC_019966	GTCGAC	2	12	6355236	6355247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650958
3097	NC_019966	GCGCTC	2	12	6358554	6358565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650961
3098	NC_019966	TGCGGC	2	12	6358726	6358737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650961
3099	NC_019966	CGGCCG	2	12	6360695	6360706	0 %	0 %	50 %	50 %	433650962
3100	NC_019966	CCGCGA	2	12	6368291	6368302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650968
3101	NC_019966	TGCGGC	2	12	6373794	6373805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650973
3102	NC_019966	CGGTGA	2	12	6376837	6376848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433650975
3103	NC_019966	GCCTGA	2	12	6376884	6376895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433650975
3104	NC_019966	TCCCGA	2	12	6379048	6379059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433650976
3105	NC_019966	GCGTCG	2	12	6380377	6380388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433650978
3106	NC_019966	CGGGTG	2	12	6382379	6382390	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433650981
3107	NC_019966	GGCCGC	2	12	6383458	6383469	0 %	0 %	50 %	50 %	433650981
3108	NC_019966	ACGCGC	2	12	6392150	6392161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433650989
3109	NC_019966	GCCTCG	2	12	6400282	6400293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433650998
3110	NC_019966	CACCCT	2	12	6401537	6401548	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	433650998
3111	NC_019966	GGTGGG	2	12	6405307	6405318	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	433651001
3112	NC_019966	ATCGGC	2	12	6406263	6406274	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433651001
3113	NC_019966	CGCCGA	2	12	6408073	6408084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433651003
3114	NC_019966	ACCTGC	2	12	6410805	6410816	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433651005
3115	NC_019966	CAACAG	2	12	6415117	6415128	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	433651009
3116	NC_019966	CGATCA	2	12	6416384	6416395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433651010
3117	NC_019966	CCACCG	2	12	6418781	6418792	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433651013
3118	NC_019966	ACCTCG	2	12	6418859	6418870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433651013
3119	NC_019966	GTTCAG	2	12	6419302	6419313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433651014
3120	NC_019966	CGCCGG	2	12	6419998	6420009	0 %	0 %	50 %	50 %	433651015
3121	NC_019966	TGCCGG	2	12	6422770	6422781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433651017
3122	NC_019966	TCGGGC	2	12	6423015	6423026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433651017
3123	NC_019966	GGCATC	2	12	6426285	6426296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433651020
3124	NC_019966	TCGACG	2	12	6427782	6427793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433651022
3125	NC_019966	GGCCGA	2	12	6430459	6430470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433651024
3126	NC_019966	CGTCAA	2	12	6431572	6431583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433651026
3127	NC_019966	GGTGCG	2	12	6440684	6440695	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433651033
3128	NC_019966	ACCATC	2	12	6442842	6442853	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433651036
3129	NC_019966	TGTTGG	2	12	6444098	6444109	0 %	50 %	50 %	0 %	433651037
3130	NC_019966	TCGACG	2	12	6444395	6444406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433651037
3131	NC_019966	GCCGTC	2	12	6445498	6445509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433651039
3132	NC_019966	CCGTCG	2	12	6445802	6445813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433651039
3133	NC_019966	GTCAAC	2	12	6448693	6448704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433651042
3134	NC_019966	TCGGCA	2	12	6451393	6451404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433651043
3135	NC_019966	CGTCGC	2	12	6453241	6453252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433651043
3136	NC_019966	CGGGTG	2	12	6453345	6453356	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433651043
3137	NC_019966	GCACCG	2	12	6454171	6454182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433651043
3138	NC_019966	GACGCC	2	12	6454205	6454216	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433651043
3139	NC_019966	CGCGCC	2	12	6458607	6458618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433651049
3140	NC_019966	GGTCGA	2	12	6461289	6461300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433651051
3141	NC_019966	CTCGCT	2	12	6462423	6462434	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433651053
3142	NC_019966	CGCTTC	2	12	6462976	6462987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433651054

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