MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 5366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019966	CTGTC	2	10	446	455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019966	TCGCA	2	10	1529	1538	20 %	20 %	20 %	40 %	433644872
3	NC_019966	CAGCA	2	10	1751	1760	40 %	0 %	20 %	40 %	433644872
4	NC_019966	ACCAC	2	10	1924	1933	40 %	0 %	0 %	60 %	433644872
5	NC_019966	TCGCG	2	10	4884	4893	0 %	20 %	40 %	40 %	433644875
6	NC_019966	ATCTG	2	10	6824	6833	20 %	40 %	20 %	20 %	433644877
7	NC_019966	GCACC	2	10	7434	7443	20 %	0 %	20 %	60 %	433644877
8	NC_019966	GCAGC	2	10	8412	8421	20 %	0 %	40 %	40 %	433644877
9	NC_019966	GCAGC	2	10	8815	8824	20 %	0 %	40 %	40 %	433644878
10	NC_019966	GGGCA	2	10	9077	9086	20 %	0 %	60 %	20 %	433644878
11	NC_019966	TCGAT	2	10	12044	12053	20 %	40 %	20 %	20 %	433644878
12	NC_019966	CGGCC	2	10	12674	12683	0 %	0 %	40 %	60 %	433644879
13	NC_019966	CACGG	2	10	13623	13632	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019966	GCGTC	2	10	14009	14018	0 %	20 %	40 %	40 %	433644880
15	NC_019966	GCCGG	2	10	17024	17033	0 %	0 %	60 %	40 %	433644883
16	NC_019966	CCGCG	2	10	18665	18674	0 %	0 %	40 %	60 %	433644886
17	NC_019966	GTCCC	2	10	20089	20098	0 %	20 %	20 %	60 %	433644888
18	NC_019966	CGGTG	2	10	20644	20653	0 %	20 %	60 %	20 %	433644888
19	NC_019966	TCCAC	2	10	21671	21680	20 %	20 %	0 %	60 %	433644889
20	NC_019966	ACCGC	2	10	22074	22083	20 %	0 %	20 %	60 %	433644889
21	NC_019966	GCCGC	2	10	23655	23664	0 %	0 %	40 %	60 %	433644890
22	NC_019966	GGGCG	2	10	26639	26648	0 %	0 %	80 %	20 %	433644892
23	NC_019966	CGACG	2	10	27961	27970	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019966	GAATC	2	10	29589	29598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019966	GCGCG	2	10	32971	32980	0 %	0 %	60 %	40 %	433644897
26	NC_019966	GTGTC	2	10	33005	33014	0 %	40 %	40 %	20 %	433644897
27	NC_019966	TCGGG	2	10	35507	35516	0 %	20 %	60 %	20 %	433644900
28	NC_019966	CCGGA	2	10	37550	37559	20 %	0 %	40 %	40 %	433644903
29	NC_019966	GCCGA	2	10	38679	38688	20 %	0 %	40 %	40 %	433644904
30	NC_019966	ACGGC	2	10	41578	41587	20 %	0 %	40 %	40 %	433644906
31	NC_019966	GCACC	2	10	41728	41737	20 %	0 %	20 %	60 %	433644906
32	NC_019966	CGCGC	2	10	43447	43456	0 %	0 %	40 %	60 %	433644908
33	NC_019966	TCGCA	2	10	43770	43779	20 %	20 %	20 %	40 %	433644908
34	NC_019966	GCCGA	2	10	45172	45181	20 %	0 %	40 %	40 %	433644909
35	NC_019966	CGGTG	2	10	46346	46355	0 %	20 %	60 %	20 %	433644911
36	NC_019966	GGCGT	2	10	47135	47144	0 %	20 %	60 %	20 %	433644912
37	NC_019966	GCCGA	2	10	48382	48391	20 %	0 %	40 %	40 %	433644913
38	NC_019966	AGCCC	2	10	49559	49568	20 %	0 %	20 %	60 %	433644913
39	NC_019966	GGGCC	2	10	52289	52298	0 %	0 %	60 %	40 %	433644916
40	NC_019966	GCCGG	2	10	54013	54022	0 %	0 %	60 %	40 %	433644917
41	NC_019966	GGCGA	2	10	54654	54663	20 %	0 %	60 %	20 %	433644918
42	NC_019966	CCGAC	2	10	55737	55746	20 %	0 %	20 %	60 %	433644918
43	NC_019966	GGCCA	2	10	56307	56316	20 %	0 %	40 %	40 %	433644919
44	NC_019966	GACTG	2	10	56739	56748	20 %	20 %	40 %	20 %	433644920
45	NC_019966	GGCTG	2	10	56974	56983	0 %	20 %	60 %	20 %	433644920
46	NC_019966	AACCG	2	10	58416	58425	40 %	0 %	20 %	40 %	433644921
47	NC_019966	CGGCC	2	10	59077	59086	0 %	0 %	40 %	60 %	433644923
48	NC_019966	GCCTC	2	10	59950	59959	0 %	20 %	20 %	60 %	433644925
49	NC_019966	CGGCC	2	10	61055	61064	0 %	0 %	40 %	60 %	433644926
50	NC_019966	GCCGC	2	10	65059	65068	0 %	0 %	40 %	60 %	433644931
51	NC_019966	GTGCC	2	10	65190	65199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_019966	ACGAG	2	10	65574	65583	40 %	0 %	40 %	20 %	433644932
53	NC_019966	CGATG	2	10	67097	67106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019966	GTGAT	2	10	67226	67235	20 %	40 %	40 %	0 %	433644933
55	NC_019966	CCGCT	2	10	67789	67798	0 %	20 %	20 %	60 %	433644933
56	NC_019966	CGCTG	2	10	68481	68490	0 %	20 %	40 %	40 %	433644933
57	NC_019966	CCAAC	2	10	68663	68672	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_019966	GAGGC	2	10	68759	68768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019966	CCGAA	2	10	70313	70322	40 %	0 %	20 %	40 %	433644935
60	NC_019966	CCACC	2	10	71044	71053	20 %	0 %	0 %	80 %	433644935
61	NC_019966	CGATC	2	10	72907	72916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_019966	CGGTC	2	10	72930	72939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019966	GTCGC	2	10	74911	74920	0 %	20 %	40 %	40 %	433644938
64	NC_019966	GCAGG	2	10	76669	76678	20 %	0 %	60 %	20 %	433644940
65	NC_019966	CCGGG	2	10	76912	76921	0 %	0 %	60 %	40 %	433644941
66	NC_019966	GGCCT	2	10	78942	78951	0 %	20 %	40 %	40 %	433644942
67	NC_019966	ACAGC	2	10	79208	79217	40 %	0 %	20 %	40 %	433644942
68	NC_019966	CGCGA	2	10	80092	80101	20 %	0 %	40 %	40 %	433644943
69	NC_019966	CGGTG	2	10	80775	80784	0 %	20 %	60 %	20 %	433644943
70	NC_019966	ACGTG	2	10	82895	82904	20 %	20 %	40 %	20 %	433644947
71	NC_019966	CAGCG	2	10	83369	83378	20 %	0 %	40 %	40 %	433644947
72	NC_019966	GCTCG	2	10	84679	84688	0 %	20 %	40 %	40 %	433644948
73	NC_019966	CCAGA	2	10	85016	85025	40 %	0 %	20 %	40 %	433644948
74	NC_019966	CAGAC	2	10	85534	85543	40 %	0 %	20 %	40 %	433644949
75	NC_019966	CGATC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	433644949
76	NC_019966	CTCGC	2	10	88307	88316	0 %	20 %	20 %	60 %	433644951
77	NC_019966	GCCGG	2	10	90969	90978	0 %	0 %	60 %	40 %	433644953
78	NC_019966	GCCCG	2	10	92482	92491	0 %	0 %	40 %	60 %	433644954
79	NC_019966	GGCCG	2	10	92647	92656	0 %	0 %	60 %	40 %	433644954
80	NC_019966	CAGCG	2	10	92729	92738	20 %	0 %	40 %	40 %	433644955
81	NC_019966	CGGGC	2	10	93228	93237	0 %	0 %	60 %	40 %	433644955
82	NC_019966	CCTGC	2	10	95067	95076	0 %	20 %	20 %	60 %	433644956
83	NC_019966	TGGCG	2	10	96371	96380	0 %	20 %	60 %	20 %	433644958
84	NC_019966	GCCGA	2	10	97382	97391	20 %	0 %	40 %	40 %	433644959
85	NC_019966	CGCAC	2	10	98592	98601	20 %	0 %	20 %	60 %	433644961
86	NC_019966	GCGGG	2	10	98765	98774	0 %	0 %	80 %	20 %	433644961
87	NC_019966	GGCCC	2	10	101292	101301	0 %	0 %	40 %	60 %	433644964
88	NC_019966	GGCGC	2	10	101546	101555	0 %	0 %	60 %	40 %	433644964
89	NC_019966	CCGTT	2	10	102869	102878	0 %	40 %	20 %	40 %	433644966
90	NC_019966	AGGCC	2	10	103187	103196	20 %	0 %	40 %	40 %	433644966
91	NC_019966	CCAGA	2	10	103573	103582	40 %	0 %	20 %	40 %	433644967
92	NC_019966	ACCGC	2	10	103632	103641	20 %	0 %	20 %	60 %	433644967
93	NC_019966	TCACC	2	10	103677	103686	20 %	20 %	0 %	60 %	433644967
94	NC_019966	TGGGA	2	10	104552	104561	20 %	20 %	60 %	0 %	433644968
95	NC_019966	CCTGA	2	10	111995	112004	20 %	20 %	20 %	40 %	433644977
96	NC_019966	AGCCG	2	10	113632	113641	20 %	0 %	40 %	40 %	433644978
97	NC_019966	CCGCG	2	10	115481	115490	0 %	0 %	40 %	60 %	433644981
98	NC_019966	CGAGC	2	10	117010	117019	20 %	0 %	40 %	40 %	433644982
99	NC_019966	CTGGG	2	10	118984	118993	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019966	CGGTC	2	10	120631	120640	0 %	20 %	40 %	40 %	433644988
101	NC_019966	AGGTC	2	10	121522	121531	20 %	20 %	40 %	20 %	433644988
102	NC_019966	GCGCC	2	10	121972	121981	0 %	0 %	40 %	60 %	433644988
103	NC_019966	TGGCC	2	10	123090	123099	0 %	20 %	40 %	40 %	433644990
104	NC_019966	CGGCC	2	10	126523	126532	0 %	0 %	40 %	60 %	433644993
105	NC_019966	TCGGT	2	10	127995	128004	0 %	40 %	40 %	20 %	433644994
106	NC_019966	GCAAG	2	10	128470	128479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019966	TGCCC	2	10	128650	128659	0 %	20 %	20 %	60 %	433644995
108	NC_019966	TGCGT	2	10	129186	129195	0 %	40 %	40 %	20 %	433644996
109	NC_019966	CGACT	2	10	129860	129869	20 %	20 %	20 %	40 %	433644997
110	NC_019966	GGCCC	2	10	132265	132274	0 %	0 %	40 %	60 %	433644999
111	NC_019966	GCTGC	2	10	134052	134061	0 %	20 %	40 %	40 %	433645001
112	NC_019966	CGGGC	2	10	134500	134509	0 %	0 %	60 %	40 %	433645001
113	NC_019966	TCGCT	2	10	135036	135045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_019966	GGTCG	2	10	136554	136563	0 %	20 %	60 %	20 %	433645002
115	NC_019966	TCGGC	2	10	138698	138707	0 %	20 %	40 %	40 %	433645003
116	NC_019966	CGACG	2	10	139882	139891	20 %	0 %	40 %	40 %	433645005
117	NC_019966	CGAGC	2	10	142069	142078	20 %	0 %	40 %	40 %	433645006
118	NC_019966	GCTCG	2	10	143652	143661	0 %	20 %	40 %	40 %	433645007
119	NC_019966	GCCGA	2	10	144760	144769	20 %	0 %	40 %	40 %	433645008
120	NC_019966	CGTGC	2	10	145284	145293	0 %	20 %	40 %	40 %	433645008
121	NC_019966	CGATG	2	10	145577	145586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019966	GACGA	2	10	146165	146174	40 %	0 %	40 %	20 %	433645009
123	NC_019966	ACCAG	2	10	146267	146276	40 %	0 %	20 %	40 %	433645009
124	NC_019966	CGCGG	2	10	147757	147766	0 %	0 %	60 %	40 %	433645009
125	NC_019966	TCAAC	2	10	147918	147927	40 %	20 %	0 %	40 %	433645009
126	NC_019966	CGTGC	2	10	147995	148004	0 %	20 %	40 %	40 %	433645009
127	NC_019966	GTGCG	2	10	150619	150628	0 %	20 %	60 %	20 %	433645010
128	NC_019966	GAACG	2	10	154776	154785	40 %	0 %	40 %	20 %	433645014
129	NC_019966	AGCGC	2	10	155530	155539	20 %	0 %	40 %	40 %	433645015
130	NC_019966	CGTCT	2	10	157095	157104	0 %	40 %	20 %	40 %	433645016
131	NC_019966	GACCG	2	10	158398	158407	20 %	0 %	40 %	40 %	433645017
132	NC_019966	CGCGC	2	10	160051	160060	0 %	0 %	40 %	60 %	433645019
133	NC_019966	GGCGC	2	10	160676	160685	0 %	0 %	60 %	40 %	433645019
134	NC_019966	CTGCC	2	10	160915	160924	0 %	20 %	20 %	60 %	433645020
135	NC_019966	CGCTG	2	10	161844	161853	0 %	20 %	40 %	40 %	433645020
136	NC_019966	CCGCG	2	10	162801	162810	0 %	0 %	40 %	60 %	433645020
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197	NC_019966	CGGAG	2	10	227148	227157	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_019966	TGAGT	2	10	302018	302027	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_019966	GCCAG	2	10	321042	321051	20 %	0 %	40 %	40 %	433645159
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262	NC_019966	GCCAG	2	10	335169	335178	20 %	0 %	40 %	40 %	433645172
263	NC_019966	TCACA	2	10	337026	337035	40 %	20 %	0 %	40 %	433645174
264	NC_019966	TCCCG	2	10	338208	338217	0 %	20 %	20 %	60 %	433645175
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