MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 1569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019966	CCGC	2	8	192	199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019966	GACA	2	8	333	340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019966	CGAT	2	8	2455	2462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019966	TGAA	2	8	13820	13827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019966	CTTG	2	8	14141	14148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019966	ACTG	2	8	14537	14544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019966	GCGG	2	8	14696	14703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019966	CCCG	2	8	17222	17229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019966	CGCT	2	8	22911	22918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019966	CCGC	2	8	29460	29467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_019966	CGGC	2	8	29912	29919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019966	CGAC	2	8	35939	35946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019966	ACGG	2	8	51322	51329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019966	ACCG	2	8	54248	54255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019966	CGGT	2	8	54308	54315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019966	GGTT	2	8	54353	54360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019966	AGGA	2	8	54386	54393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019966	CACC	2	8	54394	54401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_019966	CGAG	2	8	61859	61866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019966	GTGG	2	8	61879	61886	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019966	CGTC	2	8	66234	66241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019966	CCCG	2	8	68595	68602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_019966	TCGC	2	8	73136	73143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019966	TTGA	2	8	76083	76090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019966	ACCG	2	8	97629	97636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019966	GGGT	2	8	101925	101932	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019966	TGGG	2	8	114381	114388	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019966	AGCA	2	8	122257	122264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019966	GCCC	2	8	127607	127614	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_019966	CTCG	2	8	138790	138797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019966	TTGG	2	8	142271	142278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019966	ATCC	2	8	163032	163039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019966	CCGC	2	8	169552	169559	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019966	CAAT	2	8	175626	175633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019966	GACC	2	8	180526	180533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019966	CTGC	2	8	184635	184642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019966	TGCC	2	8	194501	194508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019966	GATG	2	8	199087	199094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019966	CGCA	2	8	199108	199115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019966	TCAC	2	8	208932	208939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019966	CGTA	2	8	212265	212272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019966	ACCG	2	8	212386	212393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019966	CGGC	2	8	227087	227094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019966	ACGG	2	8	231686	231693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019966	GTTA	2	8	239983	239990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019966	AGGT	2	8	240034	240041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019966	GCGA	2	8	245287	245294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019966	CGTG	2	8	250064	250071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019966	AAGA	2	8	251783	251790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019966	GTCG	2	8	261387	261394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019966	CGAT	2	8	261605	261612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019966	GACG	2	8	264598	264605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019966	CGTT	2	8	264754	264761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019966	ATCA	2	8	264791	264798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019966	ACCG	2	8	264884	264891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019966	ATTC	2	8	264960	264967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019966	CTGT	2	8	265595	265602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019966	CTTG	2	8	266676	266683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019966	AGCA	2	8	268076	268083	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019966	CGGC	2	8	268360	268367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019966	GCTT	2	8	269798	269805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019966	CGCT	2	8	276693	276700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019966	GGTC	2	8	278690	278697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019966	GCCA	2	8	281293	281300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019966	CCTC	2	8	289233	289240	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_019966	CGGT	2	8	291457	291464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019966	GGTC	2	8	312447	312454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019966	TCGC	2	8	316461	316468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019966	CGCT	2	8	316494	316501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019966	CTCG	2	8	316508	316515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019966	GGGC	2	8	334541	334548	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019966	CTGG	2	8	334940	334947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019966	CCAC	2	8	340572	340579	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_019966	GAGG	2	8	346438	346445	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019966	CGAA	2	8	353127	353134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019966	CGAA	2	8	354678	354685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019966	GCGT	2	8	357451	357458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019966	TGCG	2	8	363758	363765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019966	GGCA	2	8	365006	365013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019966	CGAT	2	8	366362	366369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019966	ATTG	2	8	366577	366584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019966	AGTG	2	8	389065	389072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019966	AATT	2	8	391497	391504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019966	CGGT	2	8	400862	400869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019966	ATCT	2	8	400964	400971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019966	AGGG	2	8	401702	401709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019966	ACCA	2	8	402877	402884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019966	GTCG	2	8	404840	404847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019966	GCCG	2	8	404933	404940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019966	CGCC	2	8	434246	434253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_019966	ACCG	2	8	439048	439055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019966	GGGT	2	8	442985	442992	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019966	GCGA	2	8	454820	454827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019966	CCTC	2	8	464763	464770	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_019966	TCTT	2	8	469679	469686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019966	GCCA	2	8	472306	472313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019966	TGCT	2	8	480938	480945	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019966	CCAA	2	8	484726	484733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019966	TATG	2	8	484744	484751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019966	CTCG	2	8	502475	502482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019966	GTGC	2	8	527363	527370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019966	CCGT	2	8	531994	532001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019966	CGCA	2	8	533767	533774	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019966	TGGA	2	8	539425	539432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019966	GAGC	2	8	539447	539454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019966	ACCG	2	8	539456	539463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019966	CGCA	2	8	539784	539791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019966	GCCG	2	8	539862	539869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019966	GCGG	2	8	540100	540107	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019966	GCCA	2	8	540139	540146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019966	CGAC	2	8	540269	540276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019966	ACCG	2	8	540493	540500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019966	CGGC	2	8	541943	541950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019966	GACG	2	8	542199	542206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019966	CGGC	2	8	542488	542495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019966	AGGA	2	8	546257	546264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019966	AGCA	2	8	563499	563506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019966	CGCC	2	8	564979	564986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_019966	GGCT	2	8	571084	571091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019966	CGGC	2	8	575054	575061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019966	TTAC	2	8	575605	575612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019966	GACC	2	8	579400	579407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019966	TCAC	2	8	580809	580816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019966	AACT	2	8	585597	585604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019966	CTAG	2	8	589023	589030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019966	TCGC	2	8	604044	604051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019966	GAGC	2	8	613786	613793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019966	GAGC	2	8	613857	613864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019966	GAGC	2	8	613928	613935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019966	GCCG	3	12	618782	618793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019966	CCGG	2	8	618859	618866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019966	GAAG	2	8	619153	619160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019966	GCCC	2	8	622130	622137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_019966	CATC	2	8	625562	625569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019966	CGCC	2	8	631334	631341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_019966	GAAG	2	8	639639	639646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019966	ACCA	2	8	643457	643464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019966	ATCG	2	8	645801	645808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019966	GGCC	2	8	651610	651617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019966	ACCG	2	8	651905	651912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019966	CCCG	2	8	652780	652787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_019966	GCCA	2	8	652891	652898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019966	TCCG	2	8	655930	655937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019966	CGCT	2	8	672879	672886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019966	CGGT	2	8	676641	676648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019966	GCCC	2	8	688919	688926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_019966	CGCC	2	8	699422	699429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_019966	TCGC	2	8	705989	705996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019966	CAGG	2	8	720814	720821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019966	TGGT	2	8	720987	720994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019966	CGGT	2	8	721174	721181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_019966	ATCG	2	8	764397	764404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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275	NC_019966	CTGA	2	8	1107879	1107886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_019966	CACT	2	8	1166137	1166144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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471	NC_019966	CTGA	2	8	1809522	1809529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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