MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 118499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019966	CGG	2	6	262361	262366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645103
5002	NC_019966	TCT	2	6	262386	262391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645103
5003	NC_019966	ATC	2	6	262489	262494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645104
5004	NC_019966	GGC	2	6	262497	262502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645104
5005	NC_019966	CAG	2	6	262800	262805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645104
5006	NC_019966	CCG	2	6	262831	262836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645104
5007	NC_019966	TGA	2	6	262871	262876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645104
5008	NC_019966	CGA	2	6	262937	262942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645104
5009	NC_019966	CGG	2	6	262960	262965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645104
5010	NC_019966	GCA	2	6	262976	262981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645104
5011	NC_019966	GCG	2	6	263005	263010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645104
5012	NC_019966	CGA	2	6	263036	263041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645104
5013	NC_019966	CAG	2	6	263144	263149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_019966	CGC	2	6	263161	263166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_019966	GCG	2	6	263265	263270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645105
5016	NC_019966	CGG	2	6	263275	263280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645105
5017	NC_019966	CGG	2	6	263335	263340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645105
5018	NC_019966	AAC	2	6	263365	263370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433645105
5019	NC_019966	GTT	2	6	263388	263393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433645105
5020	NC_019966	CGG	2	6	263416	263421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645105
5021	NC_019966	GGC	2	6	263444	263449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645105
5022	NC_019966	GCC	2	6	263491	263496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645105
5023	NC_019966	TGG	2	6	263765	263770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645105
5024	NC_019966	GCC	2	6	263784	263789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645105
5025	NC_019966	GAC	2	6	263820	263825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645105
5026	NC_019966	TGC	2	6	263842	263847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645105
5027	NC_019966	CCG	2	6	263858	263863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645105
5028	NC_019966	CCG	2	6	263896	263901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645105
5029	NC_019966	GTG	2	6	264054	264059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645105
5030	NC_019966	GTC	2	6	264086	264091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645105
5031	NC_019966	ACC	2	6	264116	264121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645105
5032	NC_019966	TGC	2	6	264254	264259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_019966	TTG	2	6	264338	264343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_019966	AGA	2	6	264404	264409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_019966	CGT	2	6	264416	264421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_019966	CCT	2	6	264494	264499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_019966	CGT	2	6	264625	264630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_019966	CGT	2	6	264776	264781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_019966	TTG	2	6	264837	264842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_019966	CCG	2	6	264864	264869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_019966	ATC	2	6	264873	264878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_019966	CCG	2	6	265063	265068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_019966	GCC	3	9	265164	265172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_019966	CGA	2	6	265222	265227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_019966	TGC	2	6	265262	265267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_019966	GCC	2	6	265350	265355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645106
5047	NC_019966	TCA	2	6	265455	265460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645106
5048	NC_019966	TCA	2	6	265465	265470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645106
5049	NC_019966	CTC	2	6	265580	265585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_019966	GAA	2	6	265603	265608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019966	GCT	2	6	265692	265697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_019966	CGC	2	6	265723	265728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_019966	GCA	2	6	265773	265778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645107
5054	NC_019966	GAT	2	6	265789	265794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645107
5055	NC_019966	TTC	2	6	265856	265861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645107
5056	NC_019966	TCG	2	6	265939	265944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_019966	TCA	2	6	265962	265967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645108
5058	NC_019966	GCC	2	6	265992	265997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645108
5059	NC_019966	CTG	2	6	266040	266045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645108
5060	NC_019966	CGG	2	6	266101	266106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645108
5061	NC_019966	CAA	2	6	266151	266156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433645108
5062	NC_019966	GCC	2	6	266193	266198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645108
5063	NC_019966	TCC	2	6	266268	266273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645108
5064	NC_019966	CGG	2	6	266276	266281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645108
5065	NC_019966	GCG	2	6	266295	266300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645108
5066	NC_019966	CTA	2	6	266375	266380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645108
5067	NC_019966	CGG	2	6	266393	266398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645108
5068	NC_019966	GCC	2	6	266420	266425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645108
5069	NC_019966	CAG	2	6	266620	266625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_019966	CTT	2	6	266784	266789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_019966	GTC	2	6	266822	266827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_019966	CGC	2	6	266872	266877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645109
5073	NC_019966	CTT	2	6	267052	267057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645109
5074	NC_019966	CGG	2	6	267184	267189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645109
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5084	NC_019966	TAC	2	6	267855	267860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_019966	AGC	2	6	267895	267900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_019966	GCC	2	6	268019	268024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_019966	TCG	2	6	268034	268039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_019966	ATC	2	6	268040	268045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_019966	CCG	2	6	268151	268156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_019966	TCG	2	6	268174	268179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_019966	CGC	2	6	268203	268208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_019966	GCA	2	6	268225	268230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_019966	GCG	2	6	268276	268281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_019966	CGG	2	6	268385	268390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645110
5095	NC_019966	GGC	2	6	268434	268439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645110
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5101	NC_019966	TGC	2	6	268656	268661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645110
5102	NC_019966	TGG	2	6	268714	268719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645110
5103	NC_019966	CTG	2	6	268825	268830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645110
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5110	NC_019966	GGC	2	6	269369	269374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645110
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5112	NC_019966	ACC	2	6	269491	269496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_019966	CGC	2	6	269584	269589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_019966	CAC	2	6	269702	269707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_019966	CAG	2	6	269739	269744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_019966	GCC	2	6	269856	269861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_019966	CAG	2	6	269930	269935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019966	GTC	2	6	270018	270023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645111
5120	NC_019966	CCG	2	6	270083	270088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645111
5121	NC_019966	CGA	2	6	270114	270119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645111
5122	NC_019966	GAC	3	9	270214	270222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645111
5123	NC_019966	GCC	3	9	270250	270258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645111
5124	NC_019966	CGT	2	6	270288	270293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645111
5125	NC_019966	CGG	2	6	270339	270344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645111
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5127	NC_019966	TGC	2	6	270375	270380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645111
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5133	NC_019966	GTC	2	6	270595	270600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645111
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5145	NC_019966	GTG	2	6	271523	271528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_019966	CAC	2	6	275398	275403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_019966	CGA	2	6	275447	275452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5344	NC_019966	CAA	3	9	280554	280562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433645121
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5354	NC_019966	CGT	2	6	281028	281033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645121
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5357	NC_019966	ACC	2	6	281146	281151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645121
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5360	NC_019966	CGT	2	6	281520	281525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645122
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