MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 2115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019965	CAACGC	2	12	4212284	4212295	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433643944
2002	NC_019965	GCCACC	2	12	4212768	4212779	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433643944
2003	NC_019965	GACCGA	2	12	4213967	4213978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433643946
2004	NC_019965	GCACCG	2	12	4214381	4214392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433643946
2005	NC_019965	GTGACG	2	12	4215204	4215215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433643947
2006	NC_019965	GTGTCA	2	12	4215216	4215227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433643947
2007	NC_019965	AGGCCA	2	12	4216287	4216298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433643949
2008	NC_019965	CACCGT	2	12	4217410	4217421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433643950
2009	NC_019965	TCGCCG	2	12	4217427	4217438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433643950
2010	NC_019965	GGTGAA	2	12	4217509	4217520	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	433643950
2011	NC_019965	GAGCGG	2	12	4225797	4225808	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	433643958
2012	NC_019965	ACCGCC	2	12	4226705	4226716	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433643961
2013	NC_019965	TCACCG	2	12	4226781	4226792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433643961
2014	NC_019965	CCGGAT	2	12	4226829	4226840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433643961
2015	NC_019965	AACGCG	2	12	4232791	4232802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433643966
2016	NC_019965	CACGGC	2	12	4237767	4237778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433643970
2017	NC_019965	GGCGCT	2	12	4240017	4240028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433643973
2018	NC_019965	CGCGGT	2	12	4242124	4242135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433643975
2019	NC_019965	GAGGTC	2	12	4245147	4245158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433643978
2020	NC_019965	GTCGAC	2	12	4246317	4246328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433643980
2021	NC_019965	GTCACC	2	12	4248779	4248790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433643982
2022	NC_019965	ACACCG	2	12	4249578	4249589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433643982
2023	NC_019965	CGCGGT	2	12	4251891	4251902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433643983
2024	NC_019965	GGTGCT	2	12	4252086	4252097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433643983
2025	NC_019965	TCGACA	2	12	4254015	4254026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433643984
2026	NC_019965	CCGGGC	2	12	4254494	4254505	0 %	0 %	50 %	50 %	433643984
2027	NC_019965	CGGTGT	2	12	4262731	4262742	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433643987
2028	NC_019965	CCGGCC	2	12	4263611	4263622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433643988
2029	NC_019965	TGCACC	2	12	4267905	4267916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433643991
2030	NC_019965	CATACA	2	12	4268260	4268271	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	433643991
2031	NC_019965	CTCGGC	2	12	4268681	4268692	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433643991
2032	NC_019965	GCGAGC	2	12	4268884	4268895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433643991
2033	NC_019965	GCCTCG	2	12	4270056	4270067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433643991
2034	NC_019965	GGTGCC	2	12	4270085	4270096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433643991
2035	NC_019965	CGTCGG	2	12	4270324	4270335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433643991
2036	NC_019965	CCACAC	2	12	4274995	4275006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433643994
2037	NC_019965	CGAAGC	2	12	4275189	4275200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433643994
2038	NC_019965	TTGCCG	2	12	4276105	4276116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433643995
2039	NC_019965	CGACGG	2	12	4276698	4276709	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433643995
2040	NC_019965	CGCCAG	2	12	4279183	4279194	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433643997
2041	NC_019965	CCAGCA	2	12	4279953	4279964	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433643997
2042	NC_019965	CCGACG	2	12	4283967	4283978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644001
2043	NC_019965	CGCGGC	2	12	4284762	4284773	0 %	0 %	50 %	50 %	433644001
2044	NC_019965	CCGCGG	2	12	4287119	4287130	0 %	0 %	50 %	50 %	433644003
2045	NC_019965	CACCGC	2	12	4290700	4290711	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433644006
2046	NC_019965	CCAGCA	2	12	4290954	4290965	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433644006
2047	NC_019965	TTCGCC	2	12	4295960	4295971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433644011
2048	NC_019965	GCCATC	2	12	4297988	4297999	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433644013
2049	NC_019965	CACGGC	2	12	4298590	4298601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644014
2050	NC_019965	ACGGTA	2	12	4298688	4298699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433644014
2051	NC_019965	ACCAGC	2	12	4300518	4300529	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433644014
2052	NC_019965	CGGTCT	2	12	4303558	4303569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644016
2053	NC_019965	GTCCTG	2	12	4305463	4305474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644016
2054	NC_019965	TCTGGT	2	12	4311651	4311662	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433644017
2055	NC_019965	ACCGCG	2	12	4312374	4312385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644018
2056	NC_019965	TTCGCG	2	12	4316545	4316556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644022
2057	NC_019965	CATGGC	2	12	4317186	4317197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644023
2058	NC_019965	ACCGAC	2	12	4317589	4317600	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433644024
2059	NC_019965	TCGACG	2	12	4318250	4318261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644025
2060	NC_019965	ACGCTG	2	12	4320348	4320359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644026
2061	NC_019965	GCCACC	2	12	4320689	4320700	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433644026
2062	NC_019965	CCGCGT	2	12	4322624	4322635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644030
2063	NC_019965	AATCCG	2	12	4323473	4323484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433644031
2064	NC_019965	CTGGCG	2	12	4324872	4324883	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644032
2065	NC_019965	CAGCGA	2	12	4333008	4333019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644041
2066	NC_019965	CCCGCA	2	12	4335267	4335278	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433644044
2067	NC_019965	GTCGCC	2	12	4336826	4336837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644047
2068	NC_019965	GTCGGA	2	12	4337716	4337727	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433644047
2069	NC_019965	ATGCAG	2	12	4339517	4339528	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433644049
2070	NC_019965	TCAGCG	2	12	4339572	4339583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644049
2071	NC_019965	TGCCGC	2	12	4339692	4339703	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644049
2072	NC_019965	ACGGTG	2	12	4341408	4341419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433644051
2073	NC_019965	CGCAGC	2	12	4341846	4341857	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644051
2074	NC_019965	CTCGGC	2	12	4346157	4346168	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644052
2075	NC_019965	GTCGGT	2	12	4353451	4353462	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433644059
2076	NC_019965	AGCCGA	2	12	4353715	4353726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644059
2077	NC_019965	GACCGG	2	12	4355058	4355069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433644060
2078	NC_019965	ATCGGT	2	12	4357424	4357435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433644062
2079	NC_019965	ACACCG	2	12	4358253	4358264	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433644062
2080	NC_019965	GCGCGG	2	12	4362352	4362363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644065
2081	NC_019965	AAGCAG	2	12	4362926	4362937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	433644066
2082	NC_019965	CCCCAC	2	12	4363678	4363689	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	433644068
2083	NC_019965	CTCCGC	2	12	4363690	4363701	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433644068
2084	NC_019965	GTCGTG	2	12	4365087	4365098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433644068
2085	NC_019965	GTCGCG	2	12	4366328	4366339	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644069
2086	NC_019965	CCGGCG	2	12	4368268	4368279	0 %	0 %	50 %	50 %	433644071
2087	NC_019965	CCAGCG	2	12	4371286	4371297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644074
2088	NC_019965	CCACCG	2	12	4371361	4371372	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433644074
2089	NC_019965	GGCGGG	2	12	4371586	4371597	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	433644074
2090	NC_019965	CGCCGG	2	12	4373410	4373421	0 %	0 %	50 %	50 %	433644075
2091	NC_019965	CCCCGG	2	12	4375034	4375045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644076
2092	NC_019965	ATCGCC	2	12	4377294	4377305	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433644077
2093	NC_019965	GGCCGC	2	12	4378061	4378072	0 %	0 %	50 %	50 %	433644078
2094	NC_019965	CGCGGC	2	12	4380652	4380663	0 %	0 %	50 %	50 %	433644079
2095	NC_019965	CGATCG	2	12	4381493	4381504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644080
2096	NC_019965	ACCAGC	2	12	4381930	4381941	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433644080
2097	NC_019965	CCGGCC	2	12	4383777	4383788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644082
2098	NC_019965	TCGGCG	2	12	4388655	4388666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644087
2099	NC_019965	CACCGG	2	12	4389089	4389100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644087
2100	NC_019965	ACCCGC	2	12	4399034	4399045	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433644093
2101	NC_019965	GCCGTC	2	12	4399797	4399808	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644096
2102	NC_019965	GCCGTC	2	12	4400160	4400171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644096
2103	NC_019965	ACCCCG	2	12	4402233	4402244	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433644098
2104	NC_019965	CGGTCC	2	12	4402257	4402268	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433644098
2105	NC_019965	GGGCCG	2	12	4402854	4402865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644098
2106	NC_019965	TCGGCA	2	12	4405916	4405927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644100
2107	NC_019965	TCGGCG	2	12	4406684	4406695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644100
2108	NC_019965	GGCCGC	2	12	4407714	4407725	0 %	0 %	50 %	50 %	433644100
2109	NC_019965	ATCGGC	2	12	4408210	4408221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644100
2110	NC_019965	ACGCCG	2	12	4408630	4408641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644100
2111	NC_019965	AGTCGA	2	12	4415582	4415593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433644108
2112	NC_019965	GATCGA	2	12	4415831	4415842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433644108
2113	NC_019965	GTCGGT	2	12	4416088	4416099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433644108
2114	NC_019965	TTCGCT	2	12	4417040	4417051	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433644110
2115	NC_019965	CGTCGA	2	12	4417525	4417536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644110

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