MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 11456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019965	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	433640129
2	NC_019965	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	433640129
3	NC_019965	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	433640129
4	NC_019965	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	433640129
5	NC_019965	ACTC	2	8	743	750	25 %	25 %	0 %	50 %	433640129
6	NC_019965	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	433640129
7	NC_019965	CCGA	2	8	1726	1733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019965	GTGG	2	8	2133	2140	0 %	25 %	75 %	0 %	433640130
9	NC_019965	GCCA	2	8	2151	2158	25 %	0 %	25 %	50 %	433640130
10	NC_019965	TCAG	2	8	2495	2502	25 %	25 %	25 %	25 %	433640130
11	NC_019965	CGTT	2	8	2721	2728	0 %	50 %	25 %	25 %	433640130
12	NC_019965	ACCG	2	8	2847	2854	25 %	0 %	25 %	50 %	433640130
13	NC_019965	ACGG	2	8	3073	3080	25 %	0 %	50 %	25 %	433640130
14	NC_019965	GCCT	2	8	3135	3142	0 %	25 %	25 %	50 %	433640130
15	NC_019965	CGTC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	433640131
16	NC_019965	GGTA	2	8	3466	3473	25 %	25 %	50 %	0 %	433640131
17	NC_019965	GGTT	2	8	3648	3655	0 %	50 %	50 %	0 %	433640131
18	NC_019965	CCAC	2	8	5500	5507	25 %	0 %	0 %	75 %	433640133
19	NC_019965	ACCG	2	8	5519	5526	25 %	0 %	25 %	50 %	433640133
20	NC_019965	CAAG	2	8	5714	5721	50 %	0 %	25 %	25 %	433640133
21	NC_019965	CGCC	2	8	5810	5817	0 %	0 %	25 %	75 %	433640133
22	NC_019965	CGGC	2	8	6625	6632	0 %	0 %	50 %	50 %	433640133
23	NC_019965	GACA	2	8	7305	7312	50 %	0 %	25 %	25 %	433640134
24	NC_019965	CGGT	2	8	7525	7532	0 %	25 %	50 %	25 %	433640134
25	NC_019965	CGAG	2	8	8457	8464	25 %	0 %	50 %	25 %	433640134
26	NC_019965	CCAC	2	8	8987	8994	25 %	0 %	0 %	75 %	433640134
27	NC_019965	CGAC	2	8	9356	9363	25 %	0 %	25 %	50 %	433640134
28	NC_019965	GGTT	2	8	9584	9591	0 %	50 %	50 %	0 %	433640134
29	NC_019965	CCCG	2	8	10133	10140	0 %	0 %	25 %	75 %	433640135
30	NC_019965	GCAC	2	8	11609	11616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019965	GAGC	2	8	12093	12100	25 %	0 %	50 %	25 %	433640136
32	NC_019965	CTCA	2	8	12304	12311	25 %	25 %	0 %	50 %	433640136
33	NC_019965	GCCC	2	8	12454	12461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019965	AACC	2	8	13339	13346	50 %	0 %	0 %	50 %	433640138
35	NC_019965	CCCG	2	8	13448	13455	0 %	0 %	25 %	75 %	433640138
36	NC_019965	ATTC	2	8	13692	13699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019965	ACCC	2	8	14099	14106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_019965	TGAT	2	8	14136	14143	25 %	50 %	25 %	0 %	433640140
39	NC_019965	TGCT	2	8	14183	14190	0 %	50 %	25 %	25 %	433640140
40	NC_019965	GCCC	2	8	14670	14677	0 %	0 %	25 %	75 %	433640140
41	NC_019965	GGGC	2	8	15451	15458	0 %	0 %	75 %	25 %	433640141
42	NC_019965	CTGA	2	8	15906	15913	25 %	25 %	25 %	25 %	433640142
43	NC_019965	TGGC	2	8	16049	16056	0 %	25 %	50 %	25 %	433640142
44	NC_019965	GCTT	2	8	16108	16115	0 %	50 %	25 %	25 %	433640142
45	NC_019965	CAGT	2	8	16136	16143	25 %	25 %	25 %	25 %	433640142
46	NC_019965	CGGT	2	8	16507	16514	0 %	25 %	50 %	25 %	433640142
47	NC_019965	GCCG	2	8	16566	16573	0 %	0 %	50 %	50 %	433640142
48	NC_019965	CGGG	2	8	17801	17808	0 %	0 %	75 %	25 %	433640143
49	NC_019965	CTGG	2	8	17909	17916	0 %	25 %	50 %	25 %	433640143
50	NC_019965	GTGC	2	8	18409	18416	0 %	25 %	50 %	25 %	433640143
51	NC_019965	GCCG	2	8	18427	18434	0 %	0 %	50 %	50 %	433640143
52	NC_019965	CGCT	2	8	18775	18782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019965	CCGC	2	8	18869	18876	0 %	0 %	25 %	75 %	433640144
54	NC_019965	GCCG	2	8	20333	20340	0 %	0 %	50 %	50 %	433640145
55	NC_019965	CCAG	2	8	20821	20828	25 %	0 %	25 %	50 %	433640145
56	NC_019965	CGGG	2	8	21960	21967	0 %	0 %	75 %	25 %	433640146
57	NC_019965	GCCG	2	8	22051	22058	0 %	0 %	50 %	50 %	433640146
58	NC_019965	GCTG	2	8	22431	22438	0 %	25 %	50 %	25 %	433640146
59	NC_019965	CGGC	2	8	22451	22458	0 %	0 %	50 %	50 %	433640146
60	NC_019965	GCCG	2	8	23122	23129	0 %	0 %	50 %	50 %	433640146
61	NC_019965	GCCC	2	8	23133	23140	0 %	0 %	25 %	75 %	433640146
62	NC_019965	GCTG	2	8	24273	24280	0 %	25 %	50 %	25 %	433640148
63	NC_019965	CGGC	2	8	24321	24328	0 %	0 %	50 %	50 %	433640148
64	NC_019965	GCCG	2	8	24421	24428	0 %	0 %	50 %	50 %	433640148
65	NC_019965	CGGG	2	8	24496	24503	0 %	0 %	75 %	25 %	433640148
66	NC_019965	TCAA	2	8	25574	25581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019965	GAGC	2	8	25602	25609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019965	GGCC	2	8	25616	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019965	GCTC	2	8	26565	26572	0 %	25 %	25 %	50 %	433640149
70	NC_019965	CCAA	2	8	26782	26789	50 %	0 %	0 %	50 %	433640149
71	NC_019965	CAGC	2	8	26848	26855	25 %	0 %	25 %	50 %	433640149
72	NC_019965	CGGC	2	8	27668	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
73	NC_019965	CCGG	2	8	28154	28161	0 %	0 %	50 %	50 %	433640151
74	NC_019965	GCTC	2	8	28710	28717	0 %	25 %	25 %	50 %	433640152
75	NC_019965	TGCG	2	8	28849	28856	0 %	25 %	50 %	25 %	433640152
76	NC_019965	CCGG	2	8	29114	29121	0 %	0 %	50 %	50 %	433640152
77	NC_019965	CGTC	2	8	29445	29452	0 %	25 %	25 %	50 %	433640153
78	NC_019965	CACG	2	8	29805	29812	25 %	0 %	25 %	50 %	433640154
79	NC_019965	ACCG	2	8	29886	29893	25 %	0 %	25 %	50 %	433640154
80	NC_019965	CCGG	2	8	30205	30212	0 %	0 %	50 %	50 %	433640154
81	NC_019965	GTCG	2	8	30381	30388	0 %	25 %	50 %	25 %	433640154
82	NC_019965	CCCG	2	8	31003	31010	0 %	0 %	25 %	75 %	433640154
83	NC_019965	ACCA	2	8	31188	31195	50 %	0 %	0 %	50 %	433640154
84	NC_019965	CGAG	2	8	31519	31526	25 %	0 %	50 %	25 %	433640155
85	NC_019965	CGAC	2	8	31816	31823	25 %	0 %	25 %	50 %	433640156
86	NC_019965	GCCG	2	8	32543	32550	0 %	0 %	50 %	50 %	433640158
87	NC_019965	CCGA	2	8	33526	33533	25 %	0 %	25 %	50 %	433640159
88	NC_019965	GCTA	2	8	33913	33920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019965	GGCC	2	8	34660	34667	0 %	0 %	50 %	50 %	433640161
90	NC_019965	CTGT	2	8	34843	34850	0 %	50 %	25 %	25 %	433640161
91	NC_019965	ATCG	2	8	35153	35160	25 %	25 %	25 %	25 %	433640161
92	NC_019965	GATC	2	8	35491	35498	25 %	25 %	25 %	25 %	433640161
93	NC_019965	CCAC	2	8	36312	36319	25 %	0 %	0 %	75 %	433640161
94	NC_019965	ACCG	2	8	36706	36713	25 %	0 %	25 %	50 %	433640162
95	NC_019965	CTGG	2	8	37050	37057	0 %	25 %	50 %	25 %	433640163
96	NC_019965	GCAT	2	8	37445	37452	25 %	25 %	25 %	25 %	433640164
97	NC_019965	GCTG	2	8	37959	37966	0 %	25 %	50 %	25 %	433640164
98	NC_019965	AACG	2	8	38714	38721	50 %	0 %	25 %	25 %	433640164
99	NC_019965	CCGA	2	8	38775	38782	25 %	0 %	25 %	50 %	433640164
100	NC_019965	CCAC	2	8	38931	38938	25 %	0 %	0 %	75 %	433640164
101	NC_019965	CAGC	2	8	39102	39109	25 %	0 %	25 %	50 %	433640165
102	NC_019965	GCCG	2	8	39597	39604	0 %	0 %	50 %	50 %	433640165
103	NC_019965	GGCC	2	8	40129	40136	0 %	0 %	50 %	50 %	433640166
104	NC_019965	CGAT	2	8	40579	40586	25 %	25 %	25 %	25 %	433640166
105	NC_019965	GCCG	2	8	40879	40886	0 %	0 %	50 %	50 %	433640166
106	NC_019965	CACC	2	8	40904	40911	25 %	0 %	0 %	75 %	433640166
107	NC_019965	ACCG	2	8	41127	41134	25 %	0 %	25 %	50 %	433640166
108	NC_019965	GCGT	2	8	41153	41160	0 %	25 %	50 %	25 %	433640166
109	NC_019965	CCAC	2	8	41882	41889	25 %	0 %	0 %	75 %	433640167
110	NC_019965	CGAT	2	8	41891	41898	25 %	25 %	25 %	25 %	433640167
111	NC_019965	GGCA	2	8	42524	42531	25 %	0 %	50 %	25 %	433640169
112	NC_019965	GGCC	2	8	42587	42594	0 %	0 %	50 %	50 %	433640169
113	NC_019965	CCCG	2	8	43178	43185	0 %	0 %	25 %	75 %	433640169
114	NC_019965	CGGG	2	8	43207	43214	0 %	0 %	75 %	25 %	433640169
115	NC_019965	CGAC	2	8	43846	43853	25 %	0 %	25 %	50 %	433640170
116	NC_019965	GAGC	2	8	44226	44233	25 %	0 %	50 %	25 %	433640170
117	NC_019965	GGGC	2	8	45385	45392	0 %	0 %	75 %	25 %	433640170
118	NC_019965	CGGC	2	8	45480	45487	0 %	0 %	50 %	50 %	433640170
119	NC_019965	GCCG	2	8	46443	46450	0 %	0 %	50 %	50 %	433640170
120	NC_019965	TTGC	2	8	46607	46614	0 %	50 %	25 %	25 %	433640171
121	NC_019965	CCGC	2	8	46755	46762	0 %	0 %	25 %	75 %	433640171
122	NC_019965	CCGC	2	8	46788	46795	0 %	0 %	25 %	75 %	433640171
123	NC_019965	GGTC	2	8	46896	46903	0 %	25 %	50 %	25 %	433640171
124	NC_019965	CTAC	2	8	47220	47227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019965	CGGG	2	8	47447	47454	0 %	0 %	75 %	25 %	433640172
126	NC_019965	GCAG	2	8	47520	47527	25 %	0 %	50 %	25 %	433640172
127	NC_019965	GTGC	2	8	48420	48427	0 %	25 %	50 %	25 %	433640173
128	NC_019965	GCCG	2	8	48704	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	433640173
129	NC_019965	CAGC	2	8	49889	49896	25 %	0 %	25 %	50 %	433640174
130	NC_019965	CGGG	2	8	50078	50085	0 %	0 %	75 %	25 %	433640175
131	NC_019965	GCCG	2	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	433640175
132	NC_019965	GGTG	2	8	50501	50508	0 %	25 %	75 %	0 %	433640175
133	NC_019965	CGCT	2	8	51256	51263	0 %	25 %	25 %	50 %	433640176
134	NC_019965	GGTA	2	8	52122	52129	25 %	25 %	50 %	0 %	433640177
135	NC_019965	CTGG	2	8	52717	52724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019965	GCCG	2	8	53571	53578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019965	ACCA	2	8	53742	53749	50 %	0 %	0 %	50 %	433640179
138	NC_019965	GTGC	2	8	54627	54634	0 %	25 %	50 %	25 %	433640179
139	NC_019965	ACCG	2	8	55505	55512	25 %	0 %	25 %	50 %	433640179
140	NC_019965	GGTG	2	8	55514	55521	0 %	25 %	75 %	0 %	433640179
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142	NC_019965	GGCC	2	8	56347	56354	0 %	0 %	50 %	50 %	433640180
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