MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 75932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019965	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640129
2	NC_019965	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640129
3	NC_019965	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
4	NC_019965	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
5	NC_019965	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640129
6	NC_019965	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
7	NC_019965	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640129
8	NC_019965	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
9	NC_019965	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640129
10	NC_019965	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
11	NC_019965	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640129
12	NC_019965	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640129
13	NC_019965	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
14	NC_019965	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640129
15	NC_019965	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640129
16	NC_019965	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
17	NC_019965	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640129
18	NC_019965	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
19	NC_019965	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640129
20	NC_019965	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640129
21	NC_019965	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640129
22	NC_019965	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640129
23	NC_019965	GTT	2	6	2187	2192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640130
24	NC_019965	CCG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640130
25	NC_019965	TTG	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640130
26	NC_019965	CGA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640130
27	NC_019965	TTG	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640130
28	NC_019965	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433640130
29	NC_019965	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640130
30	NC_019965	GAC	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640130
31	NC_019965	GGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640130
32	NC_019965	CGT	2	6	2636	2641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640130
33	NC_019965	GCC	2	6	2692	2697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640130
34	NC_019965	CGG	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640130
35	NC_019965	GCA	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640130
36	NC_019965	CTT	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640130
37	NC_019965	CCA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640130
38	NC_019965	GAT	2	6	2989	2994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640130
39	NC_019965	TTG	3	9	3017	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640130
40	NC_019965	CGG	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640130
41	NC_019965	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640131
42	NC_019965	GTG	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640131
43	NC_019965	ACG	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640131
44	NC_019965	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640131
45	NC_019965	ATC	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640131
46	NC_019965	TGT	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640131
47	NC_019965	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640131
48	NC_019965	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640131
49	NC_019965	TGG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640131
50	NC_019965	GAA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640131
51	NC_019965	AGC	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640131
52	NC_019965	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640131
53	NC_019965	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640131
54	NC_019965	GAC	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640131
55	NC_019965	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640131
56	NC_019965	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640131
57	NC_019965	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640131
58	NC_019965	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640131
59	NC_019965	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640131
60	NC_019965	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640131
61	NC_019965	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640131
62	NC_019965	AGG	2	6	4376	4381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640131
63	NC_019965	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640131
64	NC_019965	TGC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640132
65	NC_019965	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640132
66	NC_019965	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640132
67	NC_019965	ACG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640132
68	NC_019965	CGC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640132
69	NC_019965	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640132
70	NC_019965	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640133
71	NC_019965	GGT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
72	NC_019965	CGA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
73	NC_019965	GTG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
74	NC_019965	CGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
75	NC_019965	GTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
76	NC_019965	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640133
77	NC_019965	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
78	NC_019965	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
79	NC_019965	AAG	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640133
80	NC_019965	CTG	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640133
81	NC_019965	CAA	2	6	5840	5845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640133
82	NC_019965	CGA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
83	NC_019965	GTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640133
84	NC_019965	GGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640133
85	NC_019965	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
86	NC_019965	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
87	NC_019965	GGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640133
88	NC_019965	GGT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640133
89	NC_019965	GAC	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
90	NC_019965	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640133
91	NC_019965	ATC	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640133
92	NC_019965	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640133
93	NC_019965	ACG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
94	NC_019965	TGT	2	6	6868	6873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640133
95	NC_019965	GTT	3	9	6878	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640133
96	NC_019965	CCG	2	6	6936	6941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640133
97	NC_019965	CTG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640133
98	NC_019965	GAA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640133
99	NC_019965	CAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640133
100	NC_019965	ACC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640133
101	NC_019965	GAC	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640133
102	NC_019965	GCC	4	12	7161	7172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640133
103	NC_019965	GTT	2	6	7178	7183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640133
104	NC_019965	GCC	2	6	7320	7325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640134
105	NC_019965	GAC	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
106	NC_019965	CAG	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
107	NC_019965	TCG	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
108	NC_019965	ACC	2	6	7553	7558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640134
109	NC_019965	TGG	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640134
110	NC_019965	CGG	2	6	7673	7678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
111	NC_019965	CGA	2	6	7737	7742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
112	NC_019965	ACG	2	6	7769	7774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
113	NC_019965	CTG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
114	NC_019965	GGC	2	6	7837	7842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
115	NC_019965	CGC	2	6	7871	7876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640134
116	NC_019965	ACG	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
117	NC_019965	CGA	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
118	NC_019965	CCG	2	6	7991	7996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640134
119	NC_019965	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
120	NC_019965	GTT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640134
121	NC_019965	AGA	2	6	8079	8084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640134
122	NC_019965	TCA	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640134
123	NC_019965	GGT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640134
124	NC_019965	CAA	2	6	8286	8291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640134
125	NC_019965	TCG	2	6	8345	8350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
126	NC_019965	ACC	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640134
127	NC_019965	GCG	2	6	8424	8429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
128	NC_019965	CAC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640134
129	NC_019965	GCT	2	6	8571	8576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
130	NC_019965	CGA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
131	NC_019965	GCG	2	6	8622	8627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
132	NC_019965	CAT	2	6	8652	8657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640134
133	NC_019965	CGA	2	6	8658	8663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
134	NC_019965	CGA	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
135	NC_019965	CGA	2	6	8775	8780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
136	NC_019965	ATC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640134
137	NC_019965	CGA	2	6	8820	8825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
138	NC_019965	CGT	2	6	8847	8852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
139	NC_019965	CGG	2	6	8919	8924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
140	NC_019965	GAC	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
141	NC_019965	TCG	2	6	8963	8968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
142	NC_019965	CTT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640134
143	NC_019965	TTC	2	6	9007	9012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640134
144	NC_019965	ACC	2	6	9013	9018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640134
145	NC_019965	GCA	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
146	NC_019965	ACG	2	6	9269	9274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
147	NC_019965	CGA	3	9	9303	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
148	NC_019965	CTG	3	9	9313	9321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
149	NC_019965	CGA	2	6	9423	9428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
150	NC_019965	GCT	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
151	NC_019965	CGT	2	6	9447	9452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
152	NC_019965	CTG	2	6	9469	9474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640134
153	NC_019965	CGG	2	6	9537	9542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
154	NC_019965	CCG	2	6	9570	9575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640134
155	NC_019965	CGA	3	9	9606	9614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
156	NC_019965	CGG	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640134
157	NC_019965	TGA	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640134
158	NC_019965	GAA	2	6	9760	9765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640134
159	NC_019965	CGA	2	6	9771	9776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640134
160	NC_019965	CGC	2	6	10042	10047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640135
161	NC_019965	TGC	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640135
162	NC_019965	GCC	3	9	10094	10102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640135
163	NC_019965	CCG	4	12	10138	10149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640135
164	NC_019965	GCC	2	6	10203	10208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640135
165	NC_019965	CCG	2	6	10267	10272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640135
166	NC_019965	GCC	2	6	10386	10391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640135
167	NC_019965	GCG	2	6	10399	10404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640135
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169	NC_019965	GAT	2	6	10562	10567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640135
170	NC_019965	CGG	2	6	10595	10600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640135
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172	NC_019965	GCA	2	6	10660	10665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640135
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239	NC_019965	ACG	2	6	16438	16443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640142
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246	NC_019965	ACG	2	6	16720	16725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640142
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248	NC_019965	CTG	2	6	16946	16951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640142
249	NC_019965	ATG	2	6	17038	17043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640142
250	NC_019965	TGA	2	6	17080	17085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640142
251	NC_019965	CGG	2	6	17219	17224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640142
252	NC_019965	CGA	2	6	17255	17260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640142
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254	NC_019965	GGT	2	6	17463	17468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640142
255	NC_019965	CGG	2	6	17516	17521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640143
256	NC_019965	GGT	3	9	17627	17635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640143
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499	NC_019965	CCG	2	6	32266	32271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640158
500	NC_019965	ACG	2	6	32332	32337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640158

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