MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 82989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019965	ACC	2	6	28722	28727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640152
502	NC_019965	CGT	2	6	28770	28775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640152
503	NC_019965	CGA	2	6	28818	28823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640152
504	NC_019965	ACG	2	6	28829	28834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640152
505	NC_019965	GGC	2	6	28841	28846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640152
506	NC_019965	CGC	2	6	28946	28951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640152
507	NC_019965	CAC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640152
508	NC_019965	CAA	2	6	29168	29173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640152
509	NC_019965	GTC	2	6	29178	29183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640152
510	NC_019965	CAA	2	6	29228	29233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640152
511	NC_019965	AGC	2	6	29561	29566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640153
512	NC_019965	GTC	2	6	29581	29586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640153
513	NC_019965	GCC	3	9	29587	29595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640153
514	NC_019965	GGT	2	6	29904	29909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640154
515	NC_019965	CGC	2	6	30015	30020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640154
516	NC_019965	AGC	2	6	30042	30047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
517	NC_019965	GTC	2	6	30091	30096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
518	NC_019965	GGT	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640154
519	NC_019965	GCC	2	6	30313	30318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640154
520	NC_019965	GCG	2	6	30395	30400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640154
521	NC_019965	CAG	2	6	30421	30426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
522	NC_019965	CCT	2	6	30459	30464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640154
523	NC_019965	GCT	3	9	30471	30479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
524	NC_019965	CGT	2	6	30548	30553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
525	NC_019965	CTG	2	6	30661	30666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640154
526	NC_019965	CGA	2	6	30702	30707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
527	NC_019965	AAG	2	6	30716	30721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640154
528	NC_019965	CGA	2	6	30774	30779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
529	NC_019965	CGA	2	6	30792	30797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
530	NC_019965	CGA	2	6	30839	30844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640154
531	NC_019965	CGC	2	6	30894	30899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640154
532	NC_019965	GGC	3	9	30909	30917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640154
533	NC_019965	CAA	2	6	30946	30951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640154
534	NC_019965	GCG	2	6	31147	31152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640154
535	NC_019965	CGG	2	6	31199	31204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640154
536	NC_019965	CAA	2	6	31234	31239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_019965	GAG	2	6	31240	31245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019965	CAG	2	6	31310	31315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640155
539	NC_019965	CCG	2	6	31317	31322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640155
540	NC_019965	CGT	2	6	31341	31346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640155
541	NC_019965	ACG	2	6	31350	31355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640155
542	NC_019965	GCT	2	6	31420	31425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640155
543	NC_019965	CAG	2	6	31448	31453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640155
544	NC_019965	AGC	2	6	31512	31517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640155
545	NC_019965	CAT	2	6	31549	31554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640155
546	NC_019965	GGC	2	6	31679	31684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640156
547	NC_019965	CCG	2	6	31729	31734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640156
548	NC_019965	GGC	2	6	31781	31786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640156
549	NC_019965	GCT	2	6	31847	31852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640156
550	NC_019965	GCC	2	6	31867	31872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640156
551	NC_019965	GGC	2	6	31937	31942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640157
552	NC_019965	TCG	2	6	31997	32002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640157
553	NC_019965	TGC	3	9	32006	32014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640157
554	NC_019965	CAC	2	6	32069	32074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_019965	GAT	2	6	32098	32103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019965	CTC	2	6	32201	32206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640158
557	NC_019965	CAC	2	6	32216	32221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640158
558	NC_019965	CCG	2	6	32266	32271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640158
559	NC_019965	ACG	2	6	32332	32337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640158
560	NC_019965	AGA	3	9	32387	32395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433640158
561	NC_019965	GCG	2	6	32503	32508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640158
562	NC_019965	CGG	2	6	32510	32515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640158
563	NC_019965	GCC	3	9	32598	32606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640158
564	NC_019965	CCT	2	6	32633	32638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433640158
565	NC_019965	ACG	2	6	32700	32705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640158
566	NC_019965	TTG	2	6	32772	32777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640158
567	NC_019965	ACG	2	6	32823	32828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640158
568	NC_019965	ACG	2	6	32959	32964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640158
569	NC_019965	CGG	2	6	32995	33000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640158
570	NC_019965	GCC	3	9	33012	33020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640158
571	NC_019965	CCA	2	6	33062	33067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640158
572	NC_019965	TGT	2	6	33118	33123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640158
573	NC_019965	GCC	2	6	33126	33131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640158
574	NC_019965	TGG	2	6	33257	33262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019965	TCG	2	6	33337	33342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640159
576	NC_019965	TTC	2	6	33349	33354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640159
577	NC_019965	GGC	2	6	33368	33373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640159
578	NC_019965	TGA	2	6	33496	33501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640159
579	NC_019965	CGA	2	6	33560	33565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640159
580	NC_019965	CGG	2	6	33593	33598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640159
581	NC_019965	CGC	2	6	33746	33751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640160
582	NC_019965	CGG	2	6	33972	33977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_019965	GCG	2	6	33993	33998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_019965	TGG	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019965	CGG	2	6	34125	34130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_019965	GGT	2	6	34187	34192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019965	CCA	2	6	34209	34214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_019965	CCA	2	6	34497	34502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640161
589	NC_019965	GGT	2	6	34545	34550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640161
590	NC_019965	GAC	2	6	34688	34693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640161
591	NC_019965	TGA	2	6	34707	34712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640161
592	NC_019965	CGA	2	6	34924	34929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640161
593	NC_019965	TTC	2	6	35021	35026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640161
594	NC_019965	GCG	2	6	35027	35032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640161
595	NC_019965	GTT	2	6	35068	35073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640161
596	NC_019965	CTT	2	6	35098	35103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640161
597	NC_019965	GCG	2	6	35198	35203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640161
598	NC_019965	ATG	3	9	35369	35377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640161
599	NC_019965	CGA	2	6	35404	35409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640161
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609	NC_019965	CGC	2	6	35896	35901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640161
610	NC_019965	ACC	2	6	35949	35954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640161
611	NC_019965	CGC	2	6	35969	35974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640161
612	NC_019965	GCC	2	6	35985	35990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640161
613	NC_019965	ATC	2	6	35993	35998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640161
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620	NC_019965	GCC	2	6	36299	36304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640161
621	NC_019965	CGG	2	6	36353	36358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640161
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