MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019964	TCCCCT	2	12	22625	22636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019964	CGAGTG	2	12	116074	116085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019964	GTCGGC	2	12	119039	119050	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019964	GAACCG	2	12	119778	119789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019964	GTTGCG	2	12	233691	233702	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019964	CGGCGA	2	12	236468	236479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019964	CGGATC	2	12	249269	249280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019964	TCGCGA	2	12	253405	253416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019964	CCACAC	2	12	273945	273956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019964	TCACCT	2	12	284582	284593	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019964	ACCGGA	2	12	311038	311049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019964	CTGTCG	2	12	327691	327702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019964	TTCACT	2	12	363772	363783	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019964	GCAGGC	2	12	386328	386339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019964	TCGTTC	2	12	396706	396717	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019964	CGGTCG	2	12	411300	411311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019964	AGCGAA	2	12	476265	476276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019964	GCGCTC	2	12	476991	477002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019964	GGGTCC	2	12	528427	528438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019964	TAGCAG	2	12	529871	529882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019964	AGGCGA	2	12	531594	531605	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019964	GAACCC	2	12	556213	556224	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019964	AGTGGG	2	12	575510	575521	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019964	ACTGAC	2	12	585263	585274	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019964	GCGAGA	2	12	612710	612721	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019964	CTACGT	2	12	621269	621280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019964	CTCGCT	2	12	626360	626371	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019964	ACCAGT	2	12	633717	633728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019964	GGCGTT	2	12	692551	692562	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019964	TTCGGA	2	12	720396	720407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019964	ACTCGT	2	12	730411	730422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019964	TCGCCG	2	12	789486	789497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019964	CGAACG	2	12	824030	824041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019964	GGATGG	2	12	854599	854610	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019964	CGTCCC	2	12	857122	857133	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019964	ACTCTT	2	12	867378	867389	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019964	TCGCCA	2	12	906104	906115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019964	TCTCGC	2	12	915221	915232	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019964	GAGTTA	2	12	937051	937062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019964	CGCCCT	2	12	950371	950382	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019964	AACGAG	2	12	951234	951245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019964	TGGTAC	2	12	952625	952636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019964	TCACGG	2	12	1027684	1027695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019964	CTCCCT	2	12	1031567	1031578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019964	GTGGGT	2	12	1031604	1031615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019964	CACGTT	2	12	1054123	1054134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019964	CCCCGA	2	12	1077834	1077845	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019964	CCGAGG	2	12	1091130	1091141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019964	TCCGCG	2	12	1113833	1113844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019964	TCTCCC	2	12	1156497	1156508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019964	CGTCCG	2	12	1165840	1165851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019964	GTGTCT	2	12	1184191	1184202	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019964	GGGCTA	2	12	1207688	1207699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019964	GGCGAG	2	12	1216216	1216227	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019964	GGTTAC	2	12	1227721	1227732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019964	TAATTA	2	12	1229897	1229908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019964	GTCGAG	2	12	1288719	1288730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019964	GGTCGA	2	12	1373579	1373590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019964	CGGTTC	2	12	1479932	1479943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019964	GTGAAA	2	12	1495810	1495821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019964	TCGCGC	2	12	1496034	1496045	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019964	TCGACC	2	12	1618238	1618249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019964	TTCACT	2	12	1618369	1618380	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019964	CCGTCA	2	12	1629220	1629231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019964	GTCGAT	2	12	1630494	1630505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019964	TGATAC	2	12	1650165	1650176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019964	CTCGCG	2	12	1656241	1656252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019964	CGAAAT	2	12	1807122	1807133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019964	CTGGGA	2	12	1811835	1811846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019964	CGCGTT	2	12	1813311	1813322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019964	TCGGTC	2	12	1927440	1927451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019964	CTCGAT	2	12	2001974	2001985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019964	CGTCGG	2	12	2002126	2002137	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019964	GTCGAC	2	12	2002745	2002756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019964	ACGGTG	2	12	2004209	2004220	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019964	GCGCGA	2	12	2004447	2004458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019964	TATCGA	2	12	2015146	2015157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019964	GTCGGT	2	12	2022757	2022768	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019964	TTCACT	2	12	2040845	2040856	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019964	GGCATC	2	12	2053239	2053250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019964	CGCGAA	2	12	2058855	2058866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019964	GTGAGT	2	12	2059268	2059279	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019964	CCCAAG	2	12	2080002	2080013	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019964	GGGAGA	2	12	2103972	2103983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019964	TCGAGA	2	12	2137264	2137275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019964	CGTGCT	2	12	2144721	2144732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019964	CCTATC	2	12	2152224	2152235	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019964	GTTGGG	2	12	2165279	2165290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019964	CTCGTC	2	12	2217349	2217360	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019964	ACTATT	2	12	2219762	2219773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019964	GACGGC	2	12	2219879	2219890	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019964	TCAGTG	2	12	2245732	2245743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019964	GCCGAG	2	12	2256480	2256491	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019964	CGTGAC	2	12	2258452	2258463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019964	CAATTG	2	12	2262683	2262694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019964	CCGGTG	2	12	2383500	2383511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019964	ACTTTC	2	12	2391123	2391134	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019964	CAGTAA	2	12	2397340	2397351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019964	ACCGAA	2	12	2399765	2399776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019964	GCCCAC	2	12	2414177	2414188	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019964	ACTGGC	2	12	2419795	2419806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019964	CGACGG	2	12	2432829	2432840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019964	CGAAAC	2	12	2510111	2510122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019964	CGGGGC	2	12	2580953	2580964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019964	AGTGAA	2	12	2580988	2580999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019964	TCACTT	2	12	2628544	2628555	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019964	CTGTGA	2	12	2656925	2656936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019964	ACCTTT	2	12	2667251	2667262	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019964	TAAACC	2	12	2705073	2705084	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019964	ACGCGA	2	12	2727105	2727116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019964	TCTCGG	2	12	2748442	2748453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019964	CGACGC	2	12	2751401	2751412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019964	CGACGG	2	12	2781377	2781388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019964	GGTTCG	2	12	2781893	2781904	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019964	GTGAAA	2	12	2783655	2783666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019964	GGACGA	2	12	2798697	2798708	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019964	ATATTG	2	12	2826448	2826459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019964	ACGAGC	2	12	2828033	2828044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019964	CGTCCT	2	12	2873604	2873615	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019964	ACCGGG	2	12	2884256	2884267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019964	CGGCTG	2	12	2920510	2920521	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019964	ACCGAC	2	12	2959315	2959326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019964	GGCGAT	2	12	2992242	2992253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019964	CGTTCG	2	12	2997864	2997875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019964	TCGACC	2	12	3001400	3001411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019964	AGACCG	2	12	3022379	3022390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019964	CACGTA	2	12	3084102	3084113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019964	AAGGGC	2	12	3129257	3129268	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019964	GAGAGT	2	12	3157069	3157080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019964	GTGACG	2	12	3207274	3207285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019964	CCCATC	2	12	3211942	3211953	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.